Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08733
• Subject: XM_011528930.2
• Aligned Length: 2718
• Identities: 2573
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ------------------------------------------ATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCG  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTCATGCCGGCCCTGTCTCCTTTCAAAAGTTGCAAAAGATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCG  74

Query   33  GCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAGCCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATG  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAGCCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATG  148

Query  107  ACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGACAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGAC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGACAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGAC  222

Query  181  CCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAGGGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCG  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAGGGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCG  296

Query  255  AGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTTCAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACT  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTTCAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACT  370

Query  329  CAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGTACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATC  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGTACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATC  444

Query  403  TCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCATTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCG  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCATTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCG  518

Query  477  GATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCCTGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCC  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCCTGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCC  592

Query  551  GGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTGTCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAA  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTGTCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAA  666

Query  625  CCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCAATGCCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCC  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCCATGCCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCC  740

Query  699  CGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCCCGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCCCGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCA  814

Query  773  TCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTGTCACCAAACCCATTACGGTCACAAAGCTTGTG  846
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  TCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTGTCACCAAACCCATTACGGTAACAAAGCTTGTG  888

Query  847  ACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGAC  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGAC  962

Query  921  AGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTGCAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACA  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTGCAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACA  1036

Query  995  AAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGGCTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCA  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGGCTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCA  1110

Query 1069  CCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCCTCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAG  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCCTCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAG  1184

Query 1143  TGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCCGTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAG  1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCCGTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAG  1258

Query 1217  GCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGCACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTT  1290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGCACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTT  1332

Query 1291  ACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAAGGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGT  1364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAAGGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGT  1406

Query 1365  TCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGCCCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCAATCACTG  1438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  TCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGCCCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCCATCACTG  1480

Query 1439  TCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAGGTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATC  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAGGTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATC  1554

Query 1513  CATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTCACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTCAAGAAGCA  1586
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  CATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTCACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTTAAGAAGCA  1628

Query 1587  CATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCAGCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCG  1660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCAGCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCG  1702

Query 1661  GCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCTCTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAG  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCTCTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAG  1776

Query 1735  GAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGACGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGC  1808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGACGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGC  1850

Query 1809  TGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCGCTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCC  1882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCGCTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCC  1924

Query 1883  CCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCAAGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAG  1956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCAAGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAG  1998

Query 1957  CACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCTGAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGAC  2030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCTGAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGAC  2072

Query 2031  CCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGTGTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGC  2104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGTGTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGC  2146

Query 2105  TGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTGTGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGA  2178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTGTGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGA  2220

Query 2179  CCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGGAAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAA  2252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGGAAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAA  2294

Query 2253  CTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTCCGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTA  2326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTCCGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTA  2368

Query 2327  AGGGGGCCCACCTGGCAGGGAAGTACCGCTGTCTGCTGTGTCCGAAGGAGTTCAGTTCTGAGAGTGGCGTCAAA  2400
                                                                                      
Sbjct 2369  --------------------------------------------------------------------------  2368

Query 2401  TACCACATCCTGAAGACCCACGCAGAGAACTGGTTCCGAACATCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCA  2474
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  -------------------------AGAACTGGTTCCGAACATCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCA  2417

Query 2475  GGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAAAGAAGAAAAATCTGGCAGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGG  2548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418  GGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAAAGAAGAAAAATCTGGCAGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGG  2491

Query 2549  AGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCCAAGCTGCCCCCGCGCCGGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAG  2622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492  AGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCCAAGCTGCCCCCGCGCCGGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAG  2565

Query 2623  GGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAAGGTGGGAGTCAGCAAGGCGCCTGAAAAG  2676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566  GGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAAGGTGGGAGTCAGCAAGGCGCCTGAAAAG  2619