Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08733
• Subject: XM_024451952.1
• Aligned Length: 3210
• Identities: 2672
• Gaps: 534

Alignment

Query    1  ATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCGGCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCGGCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAG  74

Query   75  CCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATGACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATGACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGA  148

Query  149  CAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGACCCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGACCCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAG  222

Query  223  GGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCGAGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCGAGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTT  296

Query  297  CAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACTCAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACTCAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGT  370

Query  371  ACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATCTCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATCTCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCA  444

Query  445  TTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCGGATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCGGATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCC  518

Query  519  TGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCCGGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCCGGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTG  592

Query  593  TCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAACCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCAATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAACCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCCATG  666

Query  667  CCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCCCGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCCCGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCC  740

Query  741  CGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCATCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCATCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTG  814

Query  815  TCACCAAACCCATTACGGTCACAAAGCTTGTGACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTC  888
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACCAAACCCATTACGGTAACAAAGCTTGTGACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTC  888

Query  889  AGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTG  962

Query  963  CAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACAAAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACAAAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGG  1036

Query 1037  CTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCACCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCACCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCC  1110

Query 1111  TCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAGTGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAGTGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCC  1184

Query 1185  GTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAGGCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAGGCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGC  1258

Query 1259  ACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTTACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTTACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAA  1332

Query 1333  GGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGTTCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGTTCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGC  1406

Query 1407  CCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCAATCACTGTCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCCATCACTGTCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAG  1480

Query 1481  GTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATCCATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATCCATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTC  1554

Query 1555  ACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTCAAGAAGCACATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCA  1628
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTTAAGAAGCACATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCA  1628

Query 1629  GCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCGGCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCGGCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCT  1702

Query 1703  CTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAGGAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAGGAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA  1776

Query 1777  CGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCG  1850

Query 1851  CTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCCCCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCCCCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCA  1924

Query 1925  AGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAGCACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAGCACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCT  1998

Query 1999  GAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGACCCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGACCCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGT  2072

Query 2073  GTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGCTGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGCTGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTG  2146

Query 2147  TGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGACCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGACCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGG  2220

Query 2221  AAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAACTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAACTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTC  2294

Query 2295  CGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTA------------------------------------------  2326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 2295  CGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTAAGGTCAGTTCTGGGGCCTGCCCCACGGCCAGGTGCGCTGCAC  2368

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2369  TCAGAGCTCCCAGCTCACCCCACGCGGGCTTCCCACACAGTAGTGAGGGACCCTGCCTTGTCCCCTACTTTTTC  2442

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2443  TACGTGGCCTCCTCTTCCACGAACCCAGAGACTGGCCGGTGGCTGATGGCCAGCCTAGGACACCTCCCTCGCCC  2516

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2517  CAACCCCAGCCACAAGACAACGAGTCCTAGTCCTGTCCTTGGAGCTCTGCGTCCATGTAGGCATGGGTGGGCAC  2590

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2591  CCCGACCCACGCAGATGGCACACTGGCTTACAATAAGGGATGCTCGGCAAAGGTCTGCAACTCTTCCCCTGGGC  2664

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2665  ACCTGCCTCTCCCTACCCTTCCTCTCCCCTACCACCCCTGCCGCCCTGGTAACTCAGTGGCCCCCTGCATTGTC  2738

Query 2327  --------------------------------------------------------------------------  2326
                                                                                      
Sbjct 2739  TGGCACAGACAGCCACAGCTTTCCTTGGGCCACCGCTGACTCTGACCCTTTAGCCATGAGTAGGGGCTTAGGAC  2812

Query 2327  ------------------------------------------------AGGGGGCCCACCTGGCAGGGAAGTAC  2352
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGATCTGGGTCCTCCAAGGGCTGGGGCACTGGCCTGCCTATGCATTGCAGGGGGCCCACCTGGCAGGGAAGTAC  2886

Query 2353  CGCTGTCTGCTGTGTCCGAAGGAGTTCAGTTCTGAGAGTGGCGTCAAATACCACATCCTGAAGACCCACGCAGA  2426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CGCTGTCTGCTGTGTCCGAAGGAGTTCAGTTCTGAGAGTGGCGTCAAATACCACATCCTGAAGACCCACGCAGA  2960

Query 2427  GAACTGGTTCCGAACATCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCAGGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAA  2500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GAACTGGTTCCGAACATCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCAGGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAA  3034

Query 2501  AGAAGAAAAATCTGGCAGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGGAGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCC  2574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGAAGAAAAATCTGGCAGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGGAGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCC  3108

Query 2575  AAGCTGCCCCCGCGCCGGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAGGGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAA  2648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AAGCTGCCCCCGCGCCGGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAGGGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAA  3182

Query 2649  GGTGGGAGTCAGCAAGGCGCCTGAAAAG  2676
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGTGGGAGTCAGCAAGGCGCCTGAAAAG  3210