Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08751
• Subject: NM_001321905.2
• Aligned Length: 2452
• Identities: 2363
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ----------------------------ATGAACC--TAACTGCCAGCGTGTCCCATCACATCAAG--------  36
                                        |||||.|  ||            ||||.|.|||.||.|        
Sbjct    1  ATGCAAATGGATATGGAGCTTTCTTGGAATGAAACATTA------------TCCCGTAACACCAGGATCCATTG  62

Query   37  -TGTCAAC-----CCTCA--AAA----------ACAA---TCAAG-----GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCA  84
             |||..||     || ||  |||          ||.|   ||.||     ||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  CTGTTTACATGGGCC-CATTAAATGGAGTTATGACTATTTTCTAGTTTATGAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCA  135

Query   85  CAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCACTATGTCAGT  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  CAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCACTATGTCAGT  209

Query  159  CATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAG  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAG  283

Query  233  ACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGAGAATGGACAT  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  ACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGAGAATGGACAT  357

Query  307  GTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAACCTTCAAAGC  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  GTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAACCTTCAAAGC  431

Query  381  ATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATTTTTCATTATT  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  ATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATTTTTCATTATT  505

Query  455  CATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAG  528
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  CGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAG  579

Query  529  GACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAAATAATATCTA  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  GACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAAATAATATCTA  653

Query  603  CTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATTTTTAATGGGA  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  CTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATTTTTAATGGGA  727

Query  677  TTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGA  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGA  801

Query  751  CTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCC  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCC  875

Query  825  CAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAATAAAATTATATGTTGTAAACCTGT  898
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAATAAAATTATATGTTGTAAACCTGT  949

Query  899  ATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATATCACTATGGTT  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  ATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATATCACTATGGTT  1023

Query  973  AAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCCTCACAGTCTG  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCCTCACAGTCTG  1097

Query 1047  TGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGG  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  TGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGG  1171

Query 1121  AGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTT  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  AGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTT  1245

Query 1195  CACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACATCAGGAAACTG  1268
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  CACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACATCAGGAAACTG  1319

Query 1269  GGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCA  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  GGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCA  1393

Query 1343  GAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAATTTCATGAAA  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  GAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAATTTCATGAAA  1467

Query 1417  GAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAG  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  GAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAG  1541

Query 1491  GGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAATTCTATGCTGA  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  GGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAATTCTATGCTGA  1615

Query 1565  AGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTATGAACTTCCT  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616  AGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTATGAACTTCCT  1689

Query 1639  TTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGGATGAAGAACC  1712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  TTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGGATGAAGAACC  1763

Query 1713  AGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGATAATGTCATTG  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  AGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGATAATGTCATTG  1837

Query 1787  TAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCGAAGATTAGGT  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  TAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCGAAGATTAGGT  1911

Query 1861  TCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACTCCAAAAGATT  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  TCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACTCCAAAAGATT  1985

Query 1935  AAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAGCTTTTTAAAT  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  AAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAGCTTTTTAAAT  2059

Query 2009  GTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATACCTTGGGATG  2082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060  GTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATACCTTGGGATG  2133

Query 2083  CCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAGAAGAAAATAT  2156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  CCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAGAAGAAAATAT  2207

Query 2157  ATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAGCACCTAATAA  2230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  ATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAGCACCTAATAA  2281

Query 2231  AAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAGCAAGTATCAT  2304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282  AAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAGCAAGTATCAT  2355

Query 2305  CTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCACAGGAACCAGA  2378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356  CTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCACAGGAACCAGA  2429

Query 2379  AGAAGATGAA  2388
            ||||||||||
Sbjct 2430  AGAAGATGAA  2439