Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08758
• Subject: XM_006526694.1
• Aligned Length: 2493
• Identities: 2109
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGATGAATATGCACTGACCCTTGGTACAATAGATGTTTCTTATCTGCCACA-TTCATCAGAATACAGTGTTG  73
            |||||.||.|.|.||.||||..||||.||||||||.|||||||||||||| || ||||||.||||||||..|||
Sbjct    1  ATGGAGGAGTCTTCAGTGACAGTTGGCACAATAGACGTTTCTTATCTGCC-CAGTTCATCGGAATACAGCCTTG  73

Query   74  GTCGATGTAAGCACACAAGTGAGGAATGGGGTGAGTGTGGCTTTAGACCCACCATCTTCAGATCTGCAACTTTA  147
            |.||||||||.|||||.||||||||.||||.|||.|||||.||.|.|||.|||.||||||||||||||||..|.
Sbjct   74  GCCGATGTAAACACACCAGTGAGGACTGGGTTGACTGTGGGTTCAAACCTACCTTCTTCAGATCTGCAACACTG  147

Query  148  AAATGGAAAGAAAGCCTAATGAGTCGGAAAAGGCCATTTGTTGGAAGATGTTGTTACTCCTGCACTCCCCAGAG  221
            ||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  148  AAATGGAAGGAGAGCCTTATGAGCCGGAAGAGGCCCTTCGTGGGAAGGTGCTGCTATTCCTGCACGCCACAGAG  221

Query  222  CTGGGACAAATTTTTCAACACCAGTATCCCGTCTTTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATCAATGAAACTCACA  295
            ||||||.|..|||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  222  CTGGGAAAGGTTTTTCAACCCCAGTATCCCATCTCTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATCAATGAAACGCACA  295

Query  296  CAAGACACCGCGGATGGCTTGCAAGACGCCTTTCTTACGTTCTTTTTATTCAAGAGCGAGATGTGCATAAGGGC  369
            ||||.|||.|.||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||||||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  296  CAAGGCACAGAGGATGGCTGGCGAGACGGCTGTCTTACATCCTTTTTGTTCAAGAGCGAGACGTCCATAAGGGC  369

Query  370  ATGTTTGCCACCAATGTGACTGAAAATGTGCTGAACAGCAGTAGAGTACAAGAGGCAATTGCAGAAGTGGCTGC  443
            |||||||||||||.|||.|||||.|||||.||||.||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  370  ATGTTTGCCACCAGTGTTACTGAGAATGTACTGAGCAGCAGCAGAGTCCAAGAGGCAATTGCTGAAGTGGCTGC  443

Query  444  TGAATTAAACCCTGATGGTTCTGCCCAGCAGCAATCAAAAGCCGTTAACAAAGTGAAAAAGAAAGCTAAAAGGA  517
            .||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|..|.||.|||||||.||||||.|..|.||
Sbjct  444  GGAGTTGAACCCAGATGGATCTGCCCAGCAGCAGTCCAAAGCCATCCAGAAGGTGAAAAGGAAAGCCAGGAAGA  517

Query  518  TTCTTCAAGAAATGGTTGCCACTGTCTCACCGGCAATGATCAGACTGACTGGGTGGGTGCTGCTAAAACTGTTC  591
            |.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|..||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.||.|||
Sbjct  518  TCCTCCAGGAGATGGTCGCCACCGTCTCCCCAGGGATGATCAGGCTGACTGGCTGGGTGTTACTAAAGCTCTTC  591

Query  592  AACAGCTTCTTTTGGAACATTCAAATTCACAAAGGTCAACTTGAGATGGTTAAAGCTGCAACTGAGACGAATTT  665
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||..|
Sbjct  592  AACAGCTTCTTCTGGAACATTCAGATTCACAAGGGTCAACTCGAGATGGTCAAGGCTGCAACTGAGACGAACCT  665

Query  666  GCCGCTTCTGTTTCTACCAGTTCATAGATCCCATATTGACTATCTGCTGCTCACTTTCATTCTCTTCTGCCATA  739
            ||||||..|||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  666  GCCGCTCTTGTTTCTGCCGGTGCACAGATCCCACATTGACTACCTGTTGCTCACCTTCATCCTCTTTTGCCACA  739

Query  740  ACATCAAAGCACCATACATTGCTTCAGGCAATAATCTCAACATCCCAATCTTCAGTACCTTGATCCATAAGCTT  813
            |||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  740  ACATCAAGGCGCCGTACATCGCCTCGGGCAATAATCTCAACATCCCCGTCTTCAGTACCTTGATTCACAAGCTT  813

Query  814  GGGGGCTTCTTCATACGACGAAGGCTCGATGAAACACCAGATGGACGGAAAGATGTTCTCTATAGAGCTTTGCT  887
            ||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||
Sbjct  814  GGGGGCTTTTTCATAAGACGGAGGCTCGATGAAACCCCAGATGGACGCAAAGACATTCTGTACAGAGCGTTGCT  887

Query  888  CCATGGGCATATAGTTGAATTACTTCGACAGCAGCAATTCTTGGAGATCTTCCTGGAAGGCACACGTTCTAGGA  961
            ||||||||||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||..|.|
Sbjct  888  CCATGGGCATGTAGTTGAACTCCTCCGACAGCAGCAGTTCCTGGAGATCTTCCTGGAAGGCACCCGCTCCCGCA  961

Query  962  GTGGAAAAACCTCTTGTGCTCGGGCAGGACTTTTGTCAGTTGTGGTAGATACTCTGTCTACCAATGTCATCCCA  1035
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||.||..|.|||||.||.||.|||||||||||..||||...||||||.
Sbjct  962  GTGGCAAGACCTCCTGTGCCCGGGCAGGGCTCCTCTCAGTGGTAGTGGATACTCTGTCGTCCAACACCATCCCC  1035

Query 1036  GACATCTTGATAATACCTGTTGGAATCTCCTATGATCGCATTATCGAAGGTCACTACAATGGTGAACAACTGGG  1109
            ||||||.|..|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||
Sbjct 1036  GACATCCTCGTCATACCCGTGGGCATCTCGTATGATCGCATAATCGAAGGTCACTACAATGGCGAACAGTTGGG  1109

Query 1110  CAAACCTAAGAAGAATGAGAGCCTGTGGAGTGTAGCAAGAGGTGTTATTAGAATGTTACGAAAAAACTATGGTT  1183
            .||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||.|.||.||||||||.||.|
Sbjct 1110  AAAGCCCAAGAAGAACGAGAGCCTCTGGAGTGTGGCGAGAGGCGTTATCAGAATGCTGCGGAAAAACTACGGCT  1183

Query 1184  GTGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTAAAGGAATATTTAGAAAGCCAAAGTCAGAAACCGGTGTCT  1257
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1184  ACGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTGAAGGAATATTTAGAAGGCCAGAGTCAGAAACCTGTATCT  1257

Query 1258  GCTCTACTTTCCCTGGAGCAAGCGTTGTTACCAGCTATACTTCCTTCAAGACCCAGTGATGCTGCTGATGAAGG  1331
            ||.|..|||||.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|.|||||.||||||||||..
Sbjct 1258  GCCCCCCTTTCTCTGGAGCAAGCACTGTTACCAGCGATCCTTCCTTCAAGACCGAATGATGTTGCTGATGAACA  1331

Query 1332  TAGAGACACGTCCATTAATGAGTCCAGAAATGCAACAGATGAATCCCTACGAAGGAGGTTGATTGCAAATCTGG  1405
            |..||||...||||.|||.|||||||||||..||.||||.|||.||.|.|||.|.|||.||||||||||.||||
Sbjct 1332  TCAAGACCTATCCAGTAACGAGTCCAGAAACCCAGCAGACGAAGCCTTCCGACGAAGGCTGATTGCAAACCTGG  1405

Query 1406  CTGAGCATATTCTATTCACTGCTAGCAAGTCCTGTGCCATTATGTCCACACACATTGTGGCTTGCCTGCTCCTC  1479
            |||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1406  CTGAGCACATTCTCTTCACCGCCAGCAAGTCCTGCGCTATCATGTCCACCCACATTGTGGCCTGTCTGCTCCTC  1479

Query 1480  TACAGACACAGGCAGGGAATTGATCTCTCCACATTGGTCGAAGACTTCTTTGTGATGAAAGAGGAAGTCCTGGC  1553
            ||||||||||||||||||||..||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1480  TACAGACACAGGCAGGGAATCCATCTCTCCACGCTTGTGGAAGACTTCTTTGTGATGAAGGAGGAAGTCCTAGC  1553

Query 1554  TCGTGATTTTGACCTGGGGTTCTCAGGAAATTCAGAAGATGTAGTAATGCATGCCATACAGCTGCTGGGAAATT  1627
            |||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1554  TCGCGATTTCGACCTAGGCTTCTCCGGGAATTCAGAAGATGTCGTCATGCATGCTATTCAGCTTCTGGGGAACT  1627

Query 1628  GTGTCACAATCACCCACACTAGCAGGAACGATGAGTTTTTTATCACCCCCAGCACAACTGTCCCATCAGTCTTC  1701
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1628  GTGTCACAATCACCCACACGAGCAGGAAAGATGAGTTTTTTATTACTCCCAGCACAACTGTCCCGTCAGTCTTT  1701

Query 1702  GAACTCAACTTCTACAGCAATGGGGTACTTCATGTCTTTATCATGGAGGCCATCATAGCTTGCAGCCTTTATGC  1775
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1702  GAACTCAACTTCTACAGCAATGGCGTACTTCATGTGTTCATCATGGAAGCCATCATAGCTTGCAGCATCTATGC  1775

Query 1776  AGTTCTGAACAAGAGG-GGACTGGGGGGTCCCACT--AGCACCCCACCT----AACCTGATCAGCCAGGAGCAG  1842
            |||.|||||.|||||| |..||||.|||| ||.||  ||      .|||    |||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  AGTCCTGAATAAGAGGTGCTCTGGAGGGT-CCGCTGGAG------GCCTCGGCAACCTGATCAGCCAGGAGCAG  1842

Query 1843  CTGGTGCGGAAGGCGGCCAGCCTGTGCTACCTTCTCTCCAATGAAGGCACCATCTCACTGCCTTGCCAGACATT  1916
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1843  CTGGTGAGGAAGGCCGCCAGCCTGTGCTACCTTCTCTCTAACGAAGGTACCATTTCTCTGCCCTGCCAGACTTT  1916

Query 1917  TTACCAAGTCTGCCATGAAACAGTAGGAAAGTTTATCCAGTATGGCATTCTTACAGTGGCAGAGCACGATGACC  1990
            |||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1917  TTACCAAGTTTGTCATGAGACAGTTGGCAAGTTCATCCAGTATGGCATTCTCACAGTGGCAGAGCAAGATGACC  1990

Query 1991  AGGAAGATATCAGTCCTAGTCTTGCTGAGCAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCAGAACCTTTGTCTTGGAGAAGT  2064
            ||||||||.||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||   ||...|||||||||
Sbjct 1991  AGGAAGATGTCAGTCCTGGCCTTGCAGAACAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCGGAAC---TGAACTGGAGAAGT  2061

Query 2065  GATGAAGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGGGAGGAACAGCGAGATTGCTACCTGAAGGTGAGCCAATCCAAGGA  2138
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2062  GACGAGGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGTGAGGAGCAGCGAGATTGCTATCTCAAGGTGAGCCAGTCCAAGGA  2135

Query 2139  GCACCAGCAGTTTATCACC-TTCTTACAGAGACTCCTTGGGCCTTTGCTGGAGGCCTACAGCTCTGCTGCCATC  2211
            |||||||||.||.|||||| ||||| |||||.||.||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  GCACCAGCAATTCATCACCTTTCTT-CAGAGGCTTCTAGGTCCCCTGCTAGAAGCCTACAGCTCTGCTGCCATC  2208

Query 2212  TTTGTTCACAACTTCAGTGGTCCTGTTCCAGAACCTGAGTATCTGCAAAAGTTGCACAAATACCTAATAACCAG  2285
            |||||.|||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||.||..||||||..|||||.||.|||||
Sbjct 2209  TTTGTCCACAACTTCAGCGGTCCAGTTCCCGAGTCTGAGTACCTGCAGAAACTGCACAGGTACCTTATCACCAG  2282

Query 2286  AACAGAAAGAAATGTTGCAGTATATGCTGAGAGTGCCACATATTGTCTTGTGAAGAATGCTGTGAAAATGTTTA  2359
            .||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2283  GACGGAAAGGAACGTTGCCGTGTACGCTGAGAGTGCCACATACTGTCTCGTGAAGAACGCTGTGAAAATGTTTA  2356

Query 2360  AGGATATTGGGGTTTTCAAGGAGACCAAACAAAAGAGAGTGTCTGTTTTAGAACTGAGCAGCACTTTTCTACCT  2433
            ||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2357  AGGACATCGGGGTTTTCAAAGAGACCAAGCAAAAGCGAGTGTCTGTTCTAGAACTGAGCAGTACTTTCCTACCT  2430

Query 2434  CAATGCAACCGACAAAAACTTCTAGAATATATTCTGAGTTTTGTGGTGCTG  2484
            ||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431  CAGTGCAACCGGCAGAAACTCCTAGAGTATATTCTGAGTTTTGTGGTGCTG  2481