Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08761
• Subject: NM_020940.4
• Aligned Length: 2298
• Identities: 2205
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGTTCTCCAAGTTCACCTCCATCCTGCAGCACGCCGTGGAGGCGCTTGCACCTTCTCTTCCTTTACAAGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCTCCAAGTTCACCTCCATCCTGCAGCACGCCGTGGAGGCGCTTGCACCTTCTCTTCCTTTACAAGAAGA  74

Query   75  TTTTGTTTATCACTGGAAGGCAATTACCCATTACTACATAGAGACTTCAGATGATAAAGCCCCAGTGACCGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTTGTTTATCACTGGAAGGCAATTACCCATTACTACATAGAGACTTCAGATGATAAAGCCCCAGTGACCGATA  148

Query  149  CAAATATTCCATCGCATCTGGAACAGATGTTAGATATACTGGTTCAAGAAGAAAATGAACGGGAATCTGGAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAATATTCCATCGCATCTGGAACAGATGTTAGATATACTGGTTCAAGAAGAAAATGAACGGGAATCTGGAGAG  222

Query  223  ACAGGGCCATGTATGGAATATTTGCTTCATCACAAGATCTTGGAAACATTATATACCTTGGGGAAAGCTGATTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACAGGGCCATGTATGGAATATTTGCTTCATCACAAGATCTTGGAAACATTATATACCTTGGGGAAAGCTGATTG  296

Query  297  TCCTCCGGGAATGAAACAGCAGGTTTTGGTTTTCTATACGAAACTTCTGGGAAGAATCCGGCAGCCACTACTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCCGGGAATGAAACAGCAGGTTTTGGTTTTCTATACGAAACTTCTGGGAAGAATCCGGCAGCCACTACTTC  370

Query  371  CACACATTAACGTGCACAGGCCAGTGCAGAAATTAATTAGACTCTGTGGTGAAGTCCTAGCAACACCAACAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACACATTAACGTGCACAGGCCAGTGCAGAAATTAATTAGACTCTGTGGTGAAGTCCTAGCAACACCAACAGAA  444

Query  445  AATGAAGAGATTCAGTTTCTTTGCATTGTGTGTGCGAAGCTGAAACAGGACCCCTACCTGGTTAACTTTTTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGAAGAGATTCAGTTTCTTTGCATTGTGTGTGCGAAGCTGAAACAGGACCCCTACCTGGTTAACTTTTTCCT  518

Query  519  AGAGAATAAGATGAAATCATTGGCTTCCAAAGGAGTACCAAATGTAATTTCAGAAGATACATTAAAAGGTCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGAATAAGATGAAATCATTGGCTTCCAAAGGAGTACCAAATGTAATTTCAGAAGATACATTAAAAGGTCAGG  592

Query  593  ATTCCTTGTCAACAGATACAGGACAGTCCCGTCAACCAGAGGAACTATCTGGTGCTACTGGAATGGAGCAAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCCTTGTCAACAGATACAGGACAGTCCCGTCAACCAGAGGAACTATCTGGTGCTACTGGAATGGAGCAAACA  666

Query  667  GAATTGGAAGATGAGCCTCCTCATCAGATGGATCACCTGTCCACAAGCTTGGATAACCTCAGTGTCACCTCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTGGAAGATGAGCCTCCTCATCAGATGGATCACCTGTCCACAAGCTTGGATAACCTCAGTGTCACCTCACT  740

Query  741  GCCAGAGGCCTCGGTTGTTTGTCCAAATCAGGATTACAATTTAGTGAATTCTTTGTTAAATCTTACTAGAAGTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCAGAGGCCTCGGTTGTTTGTCCAAATCAGGATTACAATTTAGTGAATTCTTTGTTAAATCTTACTAGAAGTC  814

Query  815  CTGATGGCAGAATAGCTGTGAAGGCATGTGAAGGCTTGATGCTGTTAGTAAGTTTGCCAGAGCCTGCGGCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGATGGCAGAATAGCTGTGAAGGCATGTGAAGGCTTGATGCTGTTAGTAAGTTTGCCAGAGCCTGCGGCTGCA  888

Query  889  AAGTGCCTTACACAGAGCACTTGCTTGTGTGAACTACTGACAGACAGACTTGCCTCCCTGTACAAGGCCCTACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGTGCCTTACACAGAGCACTTGCTTGTGTGAACTACTGACAGACAGACTTGCCTCCCTGTACAAGGCCCTACC  962

Query  963  TCAGTCAGTGGATCCGTTAGATATTGAAACCGTGGAAGCAATTAACTGGGGCTTGGACTCATATAGTCATAAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGTCAGTGGATCCGTTAGATATTGAAACCGTGGAAGCAATTAACTGGGGCTTGGACTCATATAGTCATAAAG  1036

Query 1037  AAGATGCTTCAGCATTTCCAGGAAAACGAGCCTTAATTTCATTTCTTTCCTGGTTTGATTATTGTGATCAGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGATGCTTCAGCATTTCCAGGAAAACGAGCCTTAATTTCATTTCTTTCCTGGTTTGATTATTGTGATCAGCTC  1110

Query 1111  ATTAAGGAAGCCCAAAAGACTGCTGCTGTTGCTCTTGCCAAAGCTGTTCATGAAAGATTTTTCATTGGTGTTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTAAGGAAGCCCAAAAGACTGCTGCTGTTGCTCTTGCCAAAGCTGTTCATGAAAGATTTTTCATTGGTGTTAT  1184

Query 1185  GGAACCTCAATTAATGCAAACTTCTGAGATGGGTATTATCACATCCACTGCTCTGCTTCATCGCATCGTTCGGC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACCTCAATTAATGCAAACTTCTGAGATGGGTATTCTCACATCCACTGCTCTGCTTCATCGCATCGTTCGGC  1258

Query 1259  AAGTGACCTCTGATGTTTTGCTTCAAGAAATGGTGTTTTTTATCCTTGGAGAACAGAGGGAACCAGAAACTCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTGACCTCTGATGTTTTGCTTCAAGAAATGGTGTTTTTTATCCTTGGAGAACAGAGGGAACCAGAAACTCTG  1332

Query 1333  GCAGAAATCAGCAGACATCCTTTAAGGCATAGGTTAATTGAACATTGTGATCACATATCTGATGAGATAAGCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAGAAATCAGCAGACATCCTTTAAGGCATAGGTTAATTGAACATTGTGATCACATATCTGATGAGATAAGCAT  1406

Query 1407  AATGACATTACGAATGTTTGAACATCTTTTACAAAAACCCAATGAGCACATTCTTTACAACTTGGTCTTGAGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AATGACATTACGAATGTTTGAACATCTTTTACAAAAACCCAATGAGCACATTCTTTACAACTTGGTCTTGAGAA  1480

Query 1481  ATCTTGAAGAAAGAAATTATACAGAATATAAACCTTTGTGCCCAGAAGATAAAGATGTGGTAGAAAATGGATTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCTTGAAGAAAGAAATTATACAGAATATAAACCTTTGTGCCCAGAAGATAAAGATGTGGTAGAAAATGGATTG  1554

Query 1555  ATAGCAGGAGCAGTAGATCTGGAAGAAGATCCATTATTTACTGACATTTCACCAGAAAACACTTTGCCAAACCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATAGCAGGAGCAGTAGATCTGGAAGAAGATCCATTATTTACTGACATTTCACCAGAAAACACTTTGCCAAACCA  1628

Query 1629  AGAGTGGCTTAGTTCTTCACCTCCTGCTACTCCAGACCACCCCAAAAATGATGGAAAAACTGAAGTTCATAAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAGTGGCTTAGTTCTTCACCTCCTGCTACTCCAGACCACCCCAAAAATGATGGAAAAACTGAAGTTCATAAAA  1702

Query 1703  TTGTAAATAGTTTTCTCTGTCTGGTACCGGATGACGCAAAATCCTCCTACCATGTTGAGGGCACAGGATATGAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGTAAATAGTTTTCTCTGTCTGGTACCGGATGACGCAAAATCCTCCTACCATGTTGAGGGCACAGGATATGAC  1776

Query 1777  ACTTACCTCCGAGACGCTCATAGGCAGTTCCGAGACTACTGTGCTATCTGCTTAAGATGGGAGTGGCCTGGGTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACTTACCTCCGAGACGCTCATAGGCAGTTCCGAGACTACTGTGCTATCTGCTTAAGATGGGAGTGGCCTGGGTC  1850

Query 1851  TCCAAAAGCATTGGAAAAGTGCAATTTAGAAGCTGCTTTCTTTGAAGGTCATTTTTTGAAAGTGCTGTTCGACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCCAAAAGCATTGGAAAAGTGCAATTTAGAAGCTGCTTTCTTTGAAGGTCATTTTTTGAAAGTGCTGTTCGACA  1924

Query 1925  GAATGGGAAGAATTCTTGATCAGCCATATGATGTAAACTTACAAGTAACCTCAGTGTTATCTAGACTTTCTCTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GAATGGGAAGAATTCTTGATCAGCCATATGATGTAAACTTACAAGTAACCTCAGTGTTATCTAGACTTTCTCTC  1998

Query 1999  TTCCCTCATCCACACATCCACGAGTACCTTTTGGATCCTTACGTGAACCTCGCTCCTGGCTGTAGATCTCTCTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCCCTCATCCACACATCCACGAGTACCTTTTGGATCCTTACGTGAACCTCGCTCCTGGCTGTAGATCTCTCTT  2072

Query 2073  CTCTGTAATTGTCAGGGTTGTTGGAGACCTTATGCTTCGAATCCAGCGTATTCAAGACTTTACTCCCAAGCTTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTCTGTAATTGTCAGGGTTGTTGGAGACCTTATGCTTCGAATCCAGCGTATTCAAGACTTTACTCCCAAGCTTC  2146

Query 2147  TGTTAGTCAGAAAGCGGTTACTTGGTTTGGAACCTGAAGGCCCTA------------------TGC-AGACGTT  2201
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||| |||.|.|
Sbjct 2147  TGTTAGTCAGAAAGCGGTTACTTGGTTTGGAACCTGAAGGCCCTATTATTGACCACATCACACTGCTAGAGGGT  2220

Query 2202  GCCTTCATGGTGG-------------------------------------------------------------  2214
            |   |.||.|||.                                                             
Sbjct 2221  G---TGATTGTGTTAGAAGAGTTCTGTAAGGAGCTGGCGGCAATCGCATTTGTAAAATATCATGCTTCCTCCAC  2291

Query 2215  ----  2214
                
Sbjct 2292  ACCA  2295