Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08761
• Subject: NM_145505.4
• Aligned Length: 2304
• Identities: 1855
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGTTCTCCAAGTTCACCTCCATCCTGCAGCACGCCGTGGAGGCGCTTGCACCTTCTCTTCCTTTACAAGAAGA  74
            ||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCTCCAAGCTTACGTCCATCCTGCAGCATGCCGTGGAGGCGCTCGCACCGTCTCTCCCGTTACAAGAAGA  74

Query   75  TTTTGTTTATCACTGGAAGGCAATTACCCATTACTACATAGAGACTTCAGATGATAAAGCCCCAGTGACCGATA  148
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TTTTGTTTATCACTGGAAGGCGATTACACACTACTACATAGAAACTTCAGATGATAAAGCCCCAGTGACCGACA  148

Query  149  CAAATATTCCATCGCATCTGGAACAGATGTTAGATATACTGGTTCAAGAAGAAAATGAACGGGAATCTGGAGAG  222
            ||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CAAACATCCCATCCCACCTGGAACAGATGTTAGACATCCTGGTCCAAGAAGAAAATGAGCGGGAATCTGGAGAG  222

Query  223  ACAGGGCCATGTATGGAATATTTGCTTCATCACAAGATCTTGGAAACATTATATACCTTGGGGAAAGCTGATTG  296
            |||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct  223  ACAGGGCCATGCATGGAATACCTGCTCCATCACAAGATCTTGGAAACGTTATACACCTTAGGGAAAGCCGACTG  296

Query  297  TCCTCCGGGAATGAAACAGCAGGTTTTGGTTTTCTATACGAAACTTCTGGGAAGAATCCGGCAGCCACTACTTC  370
            .|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  CCCTCCAGGAATGAAGCAGCAGGTTTTGGTGTTCTATACCAAGCTTCTGGGACGAATCCGGCAGCCCCTGCTTC  370

Query  371  CACACATTAACGTGCACAGGCCAGTGCAGAAATTAATTAGACTCTGTGGTGAAGTCCTAGCAACACCAACAGAA  444
            |||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.
Sbjct  371  CACACATCAACGTACACAGGCCTGTGCAGAAATTAATTCGACTCTGTGGTGAGGTCCTTGCAACGCCAACGGAG  444

Query  445  AATGAAGAGATTCAGTTTCTTTGCATTGTGTGTGCGAAGCTGAAACAGGACCCCTACCTGGTTAACTTTTTCCT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||
Sbjct  445  AATGAAGAGATCCAGTTTCTCTGCATCGTGTGTGCAAAGCTGAAACAGGATCCCTACTTGGTCAACTTTTTCCT  518

Query  519  AGAGAATAAGATGAAA-TCATTGGCTTCCAAAGGAGTACCAAATGTAATTTCAGAAGATACATTAAAAGGTCAG  591
            .|||||.|| ||.||| ||..|||..||||.|||||..|..|.|||.||.|||||.|||.....||||||||||
Sbjct  519  GGAGAACAA-ATCAAAGTCCCTGGTGTCCAGAGGAGCTCTGAGTGTCATCTCAGAGGATGGCCCAAAAGGTCAG  591

Query  592  GATTCCTTGTCAACAGA--TACAGGACAGTCCCGTCAACCAGAGGAACTATCTGGTGCTACTGGAATGGAGCAA  663
            ||..|...||||..|||  | || |.||||.||..||.||..||||.||.||.|||||||||||..||||||..
Sbjct  592  GACCCGGGGTCAGGAGACGT-CA-GCCAGTGCCAGCAGCCCCAGGAGCTGTCAGGTGCTACTGGGGTGGAGCCC  663

Query  664  ACAGAATTGGAAGATGAGCCTCCTCATCAGATGGATCACCTGTCCACAAGCTTGGATAACCTCAGTGTCACCTC  737
            ||.||.|.|||.||.|||||.|||||.|||||||||.|||||||..|||||.|.|||.||||||.|||||||||
Sbjct  664  ACGGAGTCGGAGGAAGAGCCCCCTCACCAGATGGATGACCTGTCTGCAAGCCTAGATGACCTCAATGTCACCTC  737

Query  738  ACTGCCAGAGGCCTCGGTTGTTTGTCCAAATCAGGATTACAATTTAGTGAATTCTTTGTTAAATCTTACTAGAA  811
            ||||||.||||||||.|..||..|.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  738  ACTGCCGGAGGCCTCTGCCGTCCGGCCAAACCAGGACTACAACTTAGTGAATTCTTTGTTAAACCTGACAAGAA  811

Query  812  GTCCTGATGGCAGAATAGCTGTGAAGGCATGTGAAGGCTTGATGCTGTTAGTAAGTTTGCCAGAGCCTGCGGCT  885
            |||||||.|||.|.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||..|.||.||||||||||||
Sbjct  812  GTCCTGACGGCCGGATAGCTGTGAAGGCCTGCGAGGGCTTGATGCTCTTGGTGAGCCTACCGGAGCCTGCGGCT  885

Query  886  GCAAAGTGCCTTACACAGAGCACTTGCTTGTGTGAACTACTGACAGACAGACTTGCCTCCCTGTACAAGGCCCT  959
            ||.|||||||||.|.||||||||.|||.||||.||.||.|||||.|.||||||..||||||||||||||||.||
Sbjct  886  GCCAAGTGCCTTGCTCAGAGCACCTGCCTGTGCGAGCTGCTGACCGGCAGACTCACCTCCCTGTACAAGGCTCT  959

Query  960  ACCTCAGTCAGTGGATCCGTTAGATATTGAAACCGTGGAAGCAATTAACTGGGGCTTGGACTCATATAGTCATA  1033
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  960  ACCTCAGTCAGTGGACCCCTTAGACATTGAAACCGTGGAGGCAGTTAACTGGGGGTTGGACTCATACAGCCATA  1033

Query 1034  AAGAAGATGCTTCAGCATTTCCAGGAAAACGAGCCTTAATTTCATTTCTTTCCTGGTTTGATTATTGTGATCAG  1107
            |||||||.|||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1034  AAGAAGACGCTTCGGCGTTCCCGGGGAAGCGGGCCTTAATTTCATTTCTTTCCTGGTTCGATTACTGTGATCAG  1107

Query 1108  CTCATTAAGGAAGCCCAAAAGACTGCTGCTGTTGCTCTTGCCAAAGCTGTTCATGAAAGATTTTTCATTGGTGT  1181
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||.||.||..|||||||
Sbjct 1108  CTCATCAAGGAGGCACAAAAGACTGCTGCTGTTGCTCTCGCCAAAGCCATCCACGAAAGGTTCTTTGTTGGTGT  1181

Query 1182  TATGGAACCTCAATTAATGCAAACTTCTGAGATGGGTATTATCACATCCACTGCTCTGCTTCATCGCATCGTTC  1255
            .||||||||.||..|.|||||.||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||..||||.||.||||||||.|
Sbjct 1182  CATGGAACCCCAGCTGATGCAGACCTCTGAGATGGGGATTCTGACCTCGACGGCCTTGCTGCACCGCATCGTCC  1255

Query 1256  GGCAAGTGACCTCTGATGTTTTGCTTCAAGAAATGGTGTTTTTTATCCTTGGAGAACAGAGGGAACCAGAAACT  1329
            |||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  GGCAAGTGACCTCAGACGTCCTGCTTCAGGAAATGGTGGTCTTCATCCTCGGAGAACAGAGGGAGCCAGAAACT  1329

Query 1330  CTGGCAGAAATCAGCAGACATCCTTTAAGGCATAGGTTAATTGAACATTGTGATCACATATCTGATGAGATAAG  1403
            |||.|||||||.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1330  CTGTCAGAAATTAGCAGACATCCTCTAAGACATAGGTTAATCGAACATTGCGATCACATATCTGATGAGATCAG  1403

Query 1404  CATAATGACATTACGAATGTTTGAACATCTTTTACAAAAACCCAATGAGCACATTCTTTACAACTTGGTCTTGA  1477
            |||.|||||..|..|.||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1404  CATCATGACCCTGAGGATGTTTGAGCATCTCCTACAAAAGCCCAATGAACACATCCTCTACAACCTGGTCTTGA  1477

Query 1478  GAAATCTTGAAGAAAGAAATTATACAGAATATAAACCTTTGTGCCCAGAAGATAAAGATGTGGTAGAAAATGGA  1551
            ||||.||.|||||||||||.|||||.||..|.|||||||..|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1478  GAAACCTGGAAGAAAGAAACTATACGGAGAACAAACCTTCCTGCCCGGAAGACAAGGACGTGGTGGAGAACGGG  1551

Query 1552  TTGATAGCAGGAGCAGTAGATCTGGAAGAAGATCCATTATTTACTGACATTTCACCAGAAAACACTTTGCCAAA  1625
            .||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||
Sbjct 1552  CTGATAGCAGGCGCCGTAGATCTGGAGGAAGATCCATTATTTACTGACATTTCACCAGATAACACTCTGCCCAA  1625

Query 1626  CCAAGAGTGGCTTAGTTCTTCAC-CTCCTGCTACTCCAGACCACCCCAAAAATGATGGAAAAACTGAAGTTCAT  1698
            ||||||||||.||.||||..|.| |.||.||    ||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1626  CCAAGAGTGGATTTGTTCACCCCGCACCAGC----CCAGACCATCCCAAAAATGATGGCAAGACGGAAGTGCAT  1695

Query 1699  AAAATTGTAAATAGTTTTCTCTGTCTGGTACCGGATGACGCAAAATCCTCCTACCATGTTGAGGGCACAGGATA  1772
            |||.|.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1696  AAAGTGGTCAACAGTTTTCTCTGTCTAGTGCCAGATGACGCAAAGTCCTCCTACCACGTGGAGGGCACCGGCTA  1769

Query 1773  TGACACTTACCTCCGAGACGCTCATAGGCAGTTCCGAGACTACTGTGCTATCTGCTTAAGATGGGAGTGGCCTG  1846
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|
Sbjct 1770  TGACACCTACCTCCGAGACGCCCACAGGCAGTTCCGAGACTACTGTGCTATCTGCTCACGATGGGAGTGGCCAG  1843

Query 1847  GGTCTCCAAAAGCATTGGAAAAGTGCAATTTAGAAGCTGCTTTCTTTGAAGGTCATTTTTTGAAAGTGCTGTTC  1920
            |..|.||.|||.||.||||.|||||..|..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 1844  GAGCCCCCAAACCACTGGAGAAGTGTGACCTAGAAGCAGCCTTCTTTGAAGGACATTTTTTGAAAGTTTTATTT  1917

Query 1921  GACAGAATGGGAAGAATTCTTGATCAGCCATATGATGTAAACTTACAAGTAACCTCAGTGTTATCTAGACTTTC  1994
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||..|.||.||.|||||||||.|.||.|||||.||
Sbjct 1918  GACAGAATGGGAAGAATTCTCGATCAGCCGTACGATGTGAATCTGCAGGTGACCTCAGTGCTGTCCAGACTCTC  1991

Query 1995  TCTCTTCCCTCATCCACACATCCACGAGTACCTTTTGGATCCTTACGTGAACCTCGCTCCTGGCTGTAGATCTC  2068
            .||.||||||||.|||||||..|||||||||||..|||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 1992  GCTGTTCCCTCACCCACACACGCACGAGTACCTCCTGGATCCTTACATCAACCTGGCCTCTGGCTGCAGGTCTC  2065

Query 2069  TCTTCTCTGTAATTGTCAGGGTTGTTGGAGACCTTATGCTTCGAATCCAGCGTATTCAAGACTTTACTCCCAAG  2142
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 2066  TCTTCTCTGTGATTGTCAGGGTTGTTGGTGACCTCATGGTTCGAATCCAGCGCATTCAAGACTTCACCCCCAAG  2139

Query 2143  CTTCTGTTAGTCAGAAAGCGGTTACTTGGTTTGGAACCTGAAGGCCCTATGCAGACGTTGCCTTCA------TG  2210
            |||||..|.||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||     |||||.|..||      ||
Sbjct 2140  CTTCTCCTGGTCAGAAAGCGGCTGCTTGGCTTGGAGCCTGAAGGCCCCAT-----CGTTGACCACATCACACTG  2208

Query 2211  GTGG----------------------------------------------------------------------  2214
            .|||                                                                      
Sbjct 2209  CTGGAGGGTGTGATTGTGTTAGAGGAGTTCTGCAAGGAGCTGGCGGCCATTGCCTTTGTTAAGTACCACGCTTC  2282

Query 2215  ----------  2214
                      
Sbjct 2283  CGCCACGCCG  2292