Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08776
- Subject:
- XR_001738872.1
- Aligned Length:
- 3338
- Identities:
- 2806
- Gaps:
- 531
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACACTGTCCTCTCACAGAACAAGAAGGTATCTGGTCTACAAGAACTCGAGGCCTCACTGAAACGGAAAGCAAAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACAAAGAAACTTTATTTTAAAAACATGTCTTGGTCTCCCAAGAAGAGGGCAATTGGATTGCTCAGCCAGAATGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGAGTAGTTTTACAGAAAAAAGAGGACAATATTGGGATCACCTTTGACCTTTCCATTTGGAAATAATATTTTCT 222
Query 1 ---------------------------------------ATGAATTTCATAAAGGACAATGGCCGAGCCCTTAT 35
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGTTATAGAAAGGTGGGAAGCTTTCATCCAGAACAATGAATTTCATAAAGGACAATAGCCGAGCCCTTAT 296
Query 36 TCAAAGAATGGGAATGACTGTTATAAAGCAAATCACAGATGACCTATTTGTATGGAATGTTCTGAATCGCGAAG 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCAAAGAATGGGAATGACTGTTATAAAGCAAATCACAGATGACCTATTTGTATGGAATGTTCTGAATCGCGAAG 370
Query 110 AAGTAAACATCATTTGCTGCGAGAAGGTGGAGCAGGATGCTGCTAGAGGGATCATTCACATGATTTTGAAAAAG 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTAAACATCATTTGCTGCGAGAAGGTGGAGCAGGATGCTGCTAGAGGGATCATTCACATGATTTTGAAAAAG 444
Query 184 GGTTCAGAGTCCTGTAACCTCTTTCTTAAATCCCTTAAGGAGTGGAACTATCCTCTATTTCAGGACTTGAATGG 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTCAGAGTCCTGTAACCTCTTTCTTAAATCCCTTAAGGAGTGGAACTATCCTCTATTTCAGGACTTGAATGG 518
Query 258 ACAAAGTCTTTTTCATCAGACATCAGAAGGAGACTTGGACGATTTGGCTCAGGATTTAAAGGACTTGTACCATA 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACAAAGTCTTTTTCATCAGACATCAGAAGGAGACTTGGACGATTTGGCTCAGGATTTAAAGGACTTGTACCATA 592
Query 332 CCCCATCTTTTCTGAACTTTTATCCCCTTGGTGAAGATATTGACATTATTTTTAACTTGAAAAGCACCTTCACA 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCATCTTTTCTGAACTTTTATCCCCTTGGTGAAGATATTGACATTATTTTTAACTTGAAAAGCACCTTCACA 666
Query 406 GAACCTGTCCTGTGGAGGAAGGACCAACACCATCACCGCGTGGAGCAGCTGACCCTGAATGGCCTCCTGCAGGC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAACCTGTCCTGTGGAGGAAGGACCAACACCATCACCGCGTGGAGCAGCTGACCCTGAATGGCCTCCTGCAGGC 740
Query 480 TCTTCAGAGCCCCTGCATCATTGAAGGGGAATCTGGCAAAGGCAAGTCCACTCTGCTGCAGCGAATTGCCATGC 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCTTCAGAGCCCCTGCATCATTGAAGGGGAATCTGGCAAAGGCAAGTCCACTCTGCTGCAGCGAATTGCCATGC 814
Query 554 TCTGGGGCTCCGGAAAGTGCAAGGCTCTGACCAAGTTCAAATTCGTCTTCTTCCTCCGTCTCAGCAGGGCCCAG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTGGGGCTCCGGAAAGTGCAAGGCTCTGACCAAGTTCAAATTCGTCTTCTTCCTCCGTCTCAGCAGGGCCCAG 888
Query 628 GGTGGACTTTTTGAAACCCTCTGTGATCAACTCCTGGATATACCTGGCACAATCAGGAAGCAGACATTCATGGC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGGACTTTTTGAAACCCTCTGTGATCAACTCCTGGATATACCTGGCACAATCAGGAAGCAGACATTCATGGC 962
Query 702 CATGCTGCTGAAGCTGCGGCAGAGGGTTCTTTTCCTTCTTGATGGCTACAATGAATTCAAGCCCCAGAACTGCC 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATGCTGCTGAAGCTGCGGCAGAGGGTTCTTTTCCTTCTTGATGGCTACAATGAATTCAAGCCCCAGAACTGCC 1036
Query 776 CAGAAATCGAAGCCCTGATAAAGGAAAACCACCGCTTCAAGAACATGGTCATCGTCACCACTACCACTGAGTGC 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAAATCGAAGCCCTGATAAAGGAAAACCACCGCTTCAAGAACATGGTCATCGTCACCACTACCACTGAGTGC 1110
Query 850 CTGAGGCACATACGGCAGTTTGGTGCCCTGACTGCTGAGGTGGGGGATATGACAGAAGACAGCGCCCAGGCTCT 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGAGGCACATACGGCAGTTTGGTGCCCTGACTGCTGAGGTGGGGGATATGACAGAAGACAGCGCCCAGGCTCT 1184
Query 924 CATCCGAGAAGTGCTGATCAAGGAGCTTGCTGAAGGCTTGTTGCTCCAAATTCAGAAATCCAGGTGCTTGAGGA 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATCCGAGAAGTGCTGATCAAGGAGCTTGCTGAAGGCTTGTTGCTCCAAATTCAGAAATCCAGGTGCTTGAGGA 1258
Query 998 ATCTCATGAAGACCCCTCTCTTTGTGGTCATCACTTGTGCAATCCAGATGGGTGAAAGTGAGTTCCACTCTCAC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCTCATGAAGACCCCTCTCTTTGTGGTCATCACTTGTGCAATCCAGATGGGTGAAAGTGAGTTCCACTCTCAC 1332
Query 1072 ACACAAACAACGCTGTTCCATACCTTCTATGATCTGTTGATACAGAAAAACAAACACAAACATAAAGGTGTGGC 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACACAAACAACGCTGTTCCATACCTTCTATGATCTGTTGATACAGAAAAACAAACACAAACATAAAGGTGTGGC 1406
Query 1146 TGCAAGTGACTTCATTCGGAGCCTGGACCACTGTGGAGACCTAGCTCTGGAGGGTGTGTTCTCCCACAAGTTTG 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCAAGTGACTTCATTCGGAGCCTGGACCACTGTGGAGACCTAGCTCTGGAGGGTGTGTTCTCCCACAAGTTTG 1480
Query 1220 ATTTCGAACTGCAGGATGTGTCCAGCGTGAATGAGGATGTCCTGCTGACAACTGGGCTCCTCTGTAAATATACA 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATTTCGAACTGCAGGATGTGTCCAGCGTGAATGAGGATGTCCTGCTGACAACTGGGCTCCTCTGTAAATATACA 1554
Query 1294 GCTCAAAGGTTCAAGCCAAAGTATAAATTCTTTCACAAGTCATTCCAGGAGTACACAGCAGGACGAAGACTCAG 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCTCAAAGGTTCAAGCCAAAGTATAAATTCTTTCACAAGTCATTCCAGGAGTACACAGCAGGACGAAGACTCAG 1628
Query 1368 CAGTTTATTGACGTCTCATGAGCCAGAGGAGGTGACCAAGGGGAATGGTTACTTGCAGAAAATGGTTTCCATTT 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGTTTATTGACGTCTCATGAGCCAGAGGAGGTGACCAAGGGGAATGGTTACTTGCAGAAAATGGTTTCCATTT 1702
Query 1442 CGGACATTACATCCACTTATAGCAGCCTGCTCCGGTACACCTGTGGGTCATCTGTGGAAGCCACCAGGGCTGTT 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CGGACATTACATCCACTTATAGCAGCCTGCTCCGGTACACCTGTGGGTCATCTGTGGAAGCCACCAGGGCTGTT 1776
Query 1516 ATGAAGCACCTCGCAGCAGTGTATCAACACGGCTGCCTTCTCGGACTTTCCATCGCCAAGAGGCCTCTCTGGAG 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGAAGCACCTCGCAGCAGTGTATCAACACGGCTGCCTTCTCGGACTTTCCATCGCCAAGAGGCCTCTCTGGAG 1850
Query 1590 ACAGGAATCTTTGCAAAGTGTGAAAAACACCACTGAGCAAGAAATTCTGAAAGCCATAAACATCAATTCCTTTG 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAGGAATCTTTGCAAAGTGTGAAAAACACCACTGAGCAAGAAATTCTGAAAGCCATAAACATCAATTCCTTTG 1924
Query 1664 TAGAGTGTGGCATCCATTTATATCAAGAGAGTACATCCAAATCAGCCCTGAGCCAAGAATTTGAAGCTTTCTTT 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TAGAGTGTGGCATCCATTTATATCAAGAGAGTACATCCAAATCAGCCCTGAGCCAAGAATTTGAAGCTTTCTTT 1998
Query 1738 CAAGGTAAAAGCTTATATATCAACTCAGGGAACATCCCCGATTACTTATTTGACTTCTTTGAACATTTGCCCAA 1811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAAGGTAAAAGCTTATATATCAACTCAGGGAACATCCCCGATTACTTATTTGACTTCTTTGAACATTTGCCCAA 2072
Query 1812 TTGTGCAAGTGCCCTGGACTTCATTAAACTGGACTTTTATGGGGGAGCTATGGCTTCATGGGAAAAGGCTGCAG 1885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTGTGCAAGTGCCCTGGACTTCATTAAACTGGACTTTTATGGGGGAGCTATGGCTTCATGGGAAAAGGCTGCAG 2146
Query 1886 AAGACACAGGTGGAATCCACATGGAAGAGGCCCCAGAAACCTACATTCCCAGCAGGGCTGTATCTTTGTTCTTC 1959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AAGACACAGGTGGAATCCACATGGAAGAGGCCCCAGAAACCTACATTCCCAGCAGGGCTGTATCTTTGTTCTTC 2220
Query 1960 AACTGGAAGCAGGAATTCAGGACTCTGGAGGTCACACTCCGGGATTTCAGCAAGTTGAATAAGCAAGATATCAG 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AACTGGAAGCAGGAATTCAGGACTCTGGAGGTCACACTCCGGGATTTCAGCAAGTTGAATAAGCAAGATATCAG 2294
Query 2034 ATATCTGGGGAAAATATTCAGCTCTGCCACAAGCCTCAGGCTGCAAATAAAGAGATGTGCTGGTGTGGCTGGAA 2107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATATCTGGGGAAAATATTCAGCTCTGCCACAAGCCTCAGGCTGCAAATAAAGAGATGTGCTGGTGTGGCTGGAA 2368
Query 2108 GCCTCAGTTTGGTCCTCAGCACCTGTAAGAACATTTATTCTCTCATGGTGGAAGCCAGTCCCCTCACCATAGAA 2181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCCTCAGTTTGGTCCTCAGCACCTGTAAGAACATTTATTCTCTCATGGTGGAAGCCAGTCCCCTCACCATAGAA 2442
Query 2182 GATGAGAGGCACATCACATCTGTAACAAACCTGAAAACCTTGAGTATTCATGACCTACAGAATCAACGGCTGCC 2255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GATGAGAGGCACATCACATCTGTAACAAACCTGAAAACCTTGAGTATTCATGACCTACAGAATCAACGGCTGCC 2516
Query 2256 GG-----GTGGTCTGACTGACAGCTTGGGTAACTTGAAGAACCTTACAAAGCTCATAATGGATAACATAAAGAT 2324
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGGTATTGTGGTCTGACTGACAGCTTGGGTAACTTGAAGAACCTTACAAAGCTCATAATGGATAACATAAAGAT 2590
Query 2325 GAATGAAGAAGATGCTATAAAACTAGCTGAAGGCCTGAAAAACCTGAAGAAGATGTGTTTATTTCATTTGACCC 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GAATGAAGAAGATGCTATAAAACTAGCTGAAGGCCTGAAAAACCTGAAGAAGATGTGTTTATTTCATTTGACCC 2664
Query 2399 ACTTGTCTGACATTGGAGAGGGAATGGATTACATAGTCAAGTCTCTGTCAAGTGAACCCTGTGACCTTGAAGAA 2472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACTTGTCTGACATTGGAGAGGGAATGGATTACATAGTCAAGTCTCTGTCAAGTGAACCCTGTGACCTTGAAGAA 2738
Query 2473 ATTCAATTAGTCTCCTGCTGCTTGTCTGCAAATGCAGTGAAAATCCTAGCTCAGAATCTTCACAATTTGGTCAA 2546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ATTCAATTAGTCTCCTGCTGCTTGTCTGCAAATGCAGTGAAAATCCTAGCTCAGAATCTTCACAATTTGGTCAA 2812
Query 2547 ACTGAGCATTCTTGATTTATCAGAAAATTACCTGGAAAAAGATGGAAATGAAGCTCTTCATGAACTGATCGACA 2620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ACTGAGCATTCTTGATTTATCAGAAAATTACCTGGAAAAAGATGGAAATGAAGCTCTTCATGAACTGATCGACA 2886
Query 2621 GGATGAACGTGCTAGAACAGCTCACCGCACTGATGCTGCCCTGGGGCTGTGACGTGCAAGGCAGCCTGAGCAGC 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGATGAACGTGCTAGAACAGCTCACCGCACTGATGCTGCCCTGGGGCTGTGACGTGCAAGGCAGCCTGAGCAGC 2960
Query 2695 CTGTTGAAACATTTGGAGGAGGTCCCACAACTCGTCAAGCTTGGGTTGAAAAACTGGAGACTCACAGATACAGA 2768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CTGTTGAAACATTTGGAGGAGGTCCCACAACTCGTCAAGCTTGGGTTGAAAAACTGGAGACTCACAGATACAGA 3034
Query 2769 GATTAGAATTTTAGGTGCATTTTTTGGAAAGAACCCTCTGAAAAACTTCCAGCAGTTGAATTTGGCGGGAAATC 2842
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GATTAGAATTTTAGGTGCATTTTTTGGAAAGAACCCTCT----------------------------------- 3073
Query 2843 GTGTGAGCAGTGATGGATGGCTTGCCTTCATGGGTGTATTTGAGAATCTTAAGCAATTAGTGTTTTTTGACTTT 2916
Sbjct 3074 -------------------------------------------------------------------------- 3073
Query 2917 AGTACTAAAGAATTTCTACCTGATCCAGCATTAGTCAGAAAACTTAGCCAAGTGTTATCCAAGTTAACTTTTCT 2990
Sbjct 3074 -------------------------------------------------------------------------- 3073
Query 2991 GCAAGAAGCTAGGCTTGTTGGGTGGCAATTTGATGATGATGATCTCAGTGTTATTACAGGTGCTTTTAAACTAG 3064
Sbjct 3074 -------------------------------------------------------------------------- 3073
Query 3065 TAACCGCT 3072
Sbjct 3074 -------- 3073