Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08779
- Subject:
- NM_001370215.1
- Aligned Length:
- 1647
- Identities:
- 1466
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGCTCAGCTGCTGACTGATGAGGCACTGGAATCAGTGACGTTCAGGGATGTGACTGTGGACTTCACCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGGAGTGGCAGCAGCTGGAGCCTGCCCAGAAGGACCTGTACAGGGATGTCATGCTGGAGAACTACAGGAACC 148
Query 1 --------------------------------ATGAAAGAGTTGGATCCAAAGAATGACATTTCGGAAGACAAG 42
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Sbjct 149 TGGTCTCACTGGACTGGGAGACTAGACCTGAAATGAAAGAGTTGGATCCAAAGAATGACATTTCGGAAGACAAG 222
Query 43 CTCTCCGTTGTTGGGGAGGCCACGGGGGGACCCACGAGGAATGGTGCCAGGGGTCCTGGCTCAGAAGGAGTGTG 116
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Sbjct 223 CTCTCCGTTGTTGGGGAGGCCACGGGGGGACCCACGAGGAATGGTGCCAGGGGTCCTGGCTCAGAAGGAGTGTG 296
Query 117 GGAACCAGGCAGCTGGCCAGAGAGGCCGCGGGGAGATGCAGGTGCAGAGTGGGAGCCATTGGGAATTCCCCAGG 190
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Sbjct 297 GGAACCAGGCAGCTGGCCAGAGAGGCCGCGGGGAGATGCAGGTGCAGAGTGGGAGCCATTGGGAATTCCCCAGG 370
Query 191 GGAACAAACTCTTAGGGGGCTCAGTACCCGCATGTCATGAACTGAAGGCATTTGCCAACCAAGGCTGTGTCCTG 264
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Sbjct 371 GGAACAAACTCTTAGGGGGCTCAGTACCCGCATGTCATGAACTGAAGGCATTTGCCAACCAAGGCTGTGTCCTG 444
Query 265 GTCCCACCACGGCTGGACGACCCCACAGAAAAGGGGGCCTGTCCACCCGTAAGGCGTGGCAAGAACTTCTCCAG 338
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Sbjct 445 GTCCCACCACGGCTGGACGACCCCACAGAAAAGGGGGCCTGTCCACCCGTAAGGCGTGGCAAGAACTTCTCCAG 518
Query 339 CACTTCAGACCTCAGTAAGCCCCCCATGCCCTGCGAGGAGAAGAAAACCTACGACTGCAGCGAGTGTGGCAAGG 412
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Sbjct 519 CACTTCAGACCTCAGTAAGCCCCCCATGCCCTGCGAGGAGAAGAAAACCTACGACTGCAGCGAGTGTGGCAAGG 592
Query 413 CCTTTAGCCGAAGCTCGTCCCTGATAAAGCACCAAAGGATCCACACGGGAGAAAAGCCGTTTGAGTGTGACACC 486
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Sbjct 593 CCTTTAGCCGAAGCTCGTCCCTGATAAAGCACCAAAGGATCCACACGGGAGAAAAGCCGTTTGAGTGTGACACC 666
Query 487 TGTGGGAAGCACTTCATCGAGCGCTCGTCCCTCACCATCCACCAGCGGGTGCACACGGGCGAGAAGCCCTATGC 560
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Sbjct 667 TGTGGGAAGCACTTCATCGAGCGCTCGTCCCTCACCATCCACCAGCGGGTGCACACGGGCGAGAAGCCCTATGC 740
Query 561 CTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGCGCATGAACCTCACTGTGCACCAGCGCACGCACACGGGCGAGA 634
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Sbjct 741 CTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGCGCATGAACCTCACTGTGCACCAGCGCACGCACACGGGCGAGA 814
Query 635 AGCCGTATGTGTGCGACGTGTGTGGCAAGGCCTTCCGGAAGACTTCCTCTCTCACCCAGCACGAGCGGATCCAC 708
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Sbjct 815 AGCCGTATGTGTGCGACGTGTGTGGCAAGGCCTTCCGGAAGACTTCCTCTCTCACCCAGCACGAGCGGATCCAC 888
Query 709 ACGGGGGAGAAGCCCTACGCGTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGAACATGCACCTCATCGTGCACCA 782
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Sbjct 889 ACGGGGGAGAAGCCCTACGCGTGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGAACATGCACCTCATCGTGCACCA 962
Query 783 GCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGTGTGCCCCGAGTGCGGGCGAGCCTTCAGCCAGAACATGCACCTGA 856
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Sbjct 963 GCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGTGTGCCCCGAGTGCGGGCGAGCCTTCAGCCAGAACATGCACCTGA 1036
Query 857 CCGAGCACCAGCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGCCTGCAAGGAGTGCGGCAAGGCCTTCAACAAGAGC 930
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Sbjct 1037 CCGAGCACCAGCGCACGCACACCGGGGAGAAGCCGTACGCCTGCAAGGAGTGCGGCAAGGCCTTCAACAAGAGC 1110
Query 931 TCCTCTCTCACCCTGCACCAGAGGAACCACACCGGCGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGGCCTT 1004
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Sbjct 1111 TCCTCGCTCACCCTGCACCAGAGGAACCACACCGGCGAGAAGCCCTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGGCCTT 1184
Query 1005 CAGCCAGAGCTCCTACCTCATCCAGCACCAGCGCTTCCACATCGGCGTGAAGCCGTTCGAGTGCAGCGAGTGCG 1078
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Sbjct 1185 CAGCCAGAGCTCCTACCTCATCCAGCACCAGCGCTTCCACATCGGCGTGAAGCCGTTCGAGTGCAGCGAGTGCG 1258
Query 1079 GCAAGGCCTTCAGCAAGAACTCCTCGCTCACGCAGCACCAGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTACGAGTGC 1152
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Sbjct 1259 GCAAGGCCTTCAGCAAGAACTCCTCGCTCACGCAGCACCAGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTACGAGTGC 1332
Query 1153 TACATCTGCAAGAAGCACTTCACGGGGCGCTCGTCCCTCATCGTGCACCAGATCGTGCACACCGGGGAGAAGCC 1226
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Sbjct 1333 TACATCTGCAAGAAGCACTTCACGGGGCGCTCGTCCCTCATCGTGCACCAGATCGTGCACACCGGGGAGAAGCC 1406
Query 1227 CTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGAGCGCCTACCTCATCGAGCACCAGCGGATCCACACCG 1300
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Sbjct 1407 CTACGTGTGCGGCGAGTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGAGCGCCTACCTCATCGAGCACCAGCGGATCCACACCG 1480
Query 1301 GCGAGAAGCCGTACAGGTGCGGCCAGTGCGGGAAGTCCTTCATCAAGAACTCCTCCCTCACTGTGCACCAGCGG 1374
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Sbjct 1481 GCGAGAAGCCGTACAGGTGCGGCCAGTGCGGGAAGTCCTTCATCAAGAACTCCTCCCTCACTGTGCACCAGCGG 1554
Query 1375 ATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACCGATGCGGCGAGTGCGGGAAGACCTTCAGCCGCAACACGAACCTGACGCG 1448
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Sbjct 1555 ATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACCGATGCGGCGAGTGCGGGAAGACCTTCAGCCGCAACACGAACCTGACGCG 1628
Query 1449 CCACCTGCGGATTCACACC 1467
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Sbjct 1629 CCACCTGCGGATTCACACC 1647