Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08805
- Subject:
- XM_017011180.1
- Aligned Length:
- 1536
- Identities:
- 1214
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCTGTAGGACCCCAGCATCCATCGTTTAAAAGAAGTTCTCTGGACACTTTCCACGGGTGTTGTCAGCAGCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAAACTGGAGCTCTCCCGTGGGACACAGACACCAAGCGCTGGAGGCCGGAGCTGAACTGGGATCTTGTGTGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATAATGCCTGGAAGGTCCATATCGCTAAGTTCTCCTTACTGGTTGGATTAATCTTTGGCTACCTAATAACTGGA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGCATTGCTGACTGGGTCGGCCGGCGGCCTGTGCTGCTGTTTTCCATCATCTTCATTCTGATCTTTGGACTGAC 296
Query 1 -------------------------ATGTTCAGCACACTCAGGTTCTTTGAAGGATTTTGCCTGGCTGGAATCA 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGGCACTGTCAGTGAATGTGACAATGTTCAGCACACTCAGGTTCTTTGAAGGATTTTGCCTGGCTGGAATCA 370
Query 50 TTCTCACCTTGTATGCTTTACGAATAGAGCTGTGCCCCCCTGGAAAACGGTTCATGATTACGATGGTGGCGAGC 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCTCACCTTGTATGCTTTACGAATAGAGCTGTGCCCCCCTGGAAAACGGTTCATGATTACGATGGTGGCGAGC 444
Query 124 TTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCCTCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGC 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCCTCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGC 518
Query 198 CCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTCATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGG 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTCATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGG 592
Query 272 CCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAAGAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGC 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAAGAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGC 666
Query 346 GACATCAAGGGTGTGATACCAGAGCTGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACATCAAGGGTGTGATACCAGAGCTGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGT 740
Query 420 GGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAGAACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAGAACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACC 814
Query 494 ACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGGCCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTAT 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGGCCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTAT 888
Query 568 ACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGTCCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGG 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGTCCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGG 962
Query 642 GCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACCGCCCTGGCCTCGCTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGT 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACCGCCCTGGCCTCACTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGT 1036
Query 716 ACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGATGAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGC 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGATGAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGC 1110
Query 790 ATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGAGCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTG 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGAGCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTG 1184
Query 864 TGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCCAGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACC 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCCAGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACC 1258
Query 938 AGAAAGGCTACTTCCTGCACCACATCATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTG 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAAAGGCTACTTCCTGCACCACATCATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTG 1332
Query 1012 CCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGCCTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCC 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGCCTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCC 1406
Query 1086 GCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTGCTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCG 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTGCTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCG 1480
Query 1160 CAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGAGGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGAGGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG 1536