Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08854
• Subject: NM_145218.3
• Aligned Length: 1794
• Identities: 1605
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTTCACTGAGAAGAGTCAAAGTGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTAGCCGGCTTCGTGCTCTTCCT  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||..|
Sbjct    1  ATGGCTTCACTGAGGAGAGTCAAAGTGTTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTGGCCGGCTTCGTGATCTTTTT  74

Query   75  GGCCAAGTGCCGGCCCATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCGCGCGCCGAGGTGGCCA  148
            |||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  GGCTAAGTGTCGGCCTATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCTCGCGCAGAGGTGGCCA  148

Query  149  ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCCTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCTTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTC  222

Query  223  TACCGGCAGCTGAATGGCTTATCCAAATCCCTTGGGCTCATTGAAGGTTATGGTGGGCGGGGTAAAGGGGGCCT  296
            |||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  223  TACAGGCAGCTTAATGGCTTATCTAAATCCCTCGGGCTCATCGAAGGGTATGGTGGGAGGGGCAAAGGAGGCCT  296

Query  297  TCCGGCTACTCTTTCCCCGGCTGAAGAAGAAAAGGCTAAGGGACCCCATGAGAAGTATGGCTACAATTCATACC  370
            |||.||.||.||||||||..|||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TCCTGCCACCCTTTCCCCCTCTGAAGAAGAAAAAGCCAAAGGACCTCATGAGAAATATGGCTACAATTCCTACC  370

Query  371  TCAGTGAAAAAATTTCACTGGACCGTTCCATTCCGGATTATCGTCCCACCAAGTGTAAGGAGCTCAAGTACTCC  444
            ||||||||||.||.||..|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  TCAGTGAAAAGATCTCCTTGGACCGGTCTATTCCAGATTATCGTCCTACCAAGTGTAAGGAGCTCAAATATTCC  444

Query  445  AAGGACCTGCCCCAGATATCCATCATATTCATCTTCGTGAACGAGGCCCTGTCGGTGATCCTGCGGTCCGTGCA  518
            |||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct  445  AAGGAGTTGCCCCAGATATCCATCATCTTCATCTTCGTGAATGAGGCCCTGTCTGTGATACTTCGGTCAGTCCA  518

Query  519  CAGTGCCGTCAATCACACGCCCACACACCTGCTGAAGGAAATCATTCTGGTGGATGACAACAGCGACGAAGAGG  592
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  CAGCGCTGTCAATCACACACCCACACACCTGCTGAAGGAGATCATCCTGGTGGATGACAACAGTGATGAAGAGG  592

Query  593  AGCTGAAGGTCCCCCTAGAGGAGTATGTCCACAAACGCTACCCCGGGCTGGTGAAGGTGGTAAGAAATCAGAAG  666
            |||||||||.||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|||
Sbjct  593  AGCTGAAGGCCCCCTTGGAAGAGTACGTCCACAAACGCTACCCTGGGCTGGTGAAGGTGGTACGCAATCAAAAG  666

Query  667  AGGGAAGGCCTGATCCGCGCTCGCATTGAGGGCTGGAAGGTGGCTACCGGGCAGGTCACTGGCTTCTTTGATGC  740
            .|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|.|||.||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  667  CGAGAAGGCCTGATCCGAGCACGCATCGAGGGCTGGAAAGCGGCCACTGGCCAGGTCACTGGCTTTTTCGATGC  740

Query  741  CCACGTGGAATTCACCGCTGGCTGGGCTGAGCCGGTTCTATCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGTGTGATCC  814
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  741  TCACGTGGAATTCACTGCTGGCTGGGCTGAGCCCGTTCTGTCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGGGTCATCC  814

Query  815  TCCCCTCCATTGACAACATCAAACAGGACAACTTTGAGGTGCAGCGGTACGAGAACTCGGCCCACGGGTACAGC  888
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCCTCCATCGACAACATCAAGCAGGACAACTTCGAAGTGCAGCGCTACGAGAACTCCGCCCACGGGTACAGC  888

Query  889  TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGACCCTTCTCTCCCCATCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGATCCCTCTCTCCCCATCAG  962

Query  963  GACCCCAGCCATGATAGGCTGCTCGTTCGTGGTCAACAGGAAGTTCTTCGGTGAAATTGGTCTTCTGGATCCTG  1036
            .||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  AACACCAGCCATGATTGGCTGCTCATTTGTGGTCAACAGGAAATTCTTTGGTGAAATTGGTCTGCTGGACCCTG  1036

Query 1037  GCATGGATGTATACGGAGGAGAAAATATTGAACTGGGAATCAAGGTATGGCTCTGTGGGGGCAGCATGGAGGTC  1110
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GAATGGATGTGTACGGAGGAGAGAATATTGAACTTGGGATCAAGGTATGGCTCTGTGGTGGCAGCATGGAGGTC  1110

Query 1111  CTTCCTTGCTCACGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAGCCATATAATAGCAACATTGGCTTCTACACCAA  1184
            |||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  CTTCCATGTTCAAGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAACCGTATAACAGTAACATCGGCTTTTACACCAA  1184

Query 1185  GAGGAATGCTCTTCGCGTTGCTGAGGTCTGGATGGACGATTACAAGTCTCATGTGTACATAGCGTGGAACCTGC  1258
            |||||||||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  GAGGAATGCATTGCGAGTAGCCGAGGTCTGGATGGACGACTACAAGTCACATGTGTACATAGCGTGGAATCTGC  1258

Query 1259  CGCTGGAGAATCCGGGAATTGACATCGGTGATGTCTCCGAAAGAAGAGCATTAAGGAAAAGTTTAAAGTGTAAG  1332
            |.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  CTCTGGAGAATCCAGGCATCGATATCGGTGATGTCTCAGAAAGAAAAGCATTAAGGAAAAGTTTGAAATGTAAG  1332

Query 1333  AATTTCCAGTGGTACCTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAATAATACCGTTGCTTACGGGGAGCT  1406
            ||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.||||||||
Sbjct 1333  AATTTCCAGTGGTATTTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAACAACACTATCGCCTATGGGGAGCT  1406

Query 1407  TCGCAACAACAAGGCAAAAGACGTCTGCTTGGACCAGGGGCCGCTGGAGAACCACACAGCAATATTGTATCCGT  1480
            |||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.|
Sbjct 1407  TCGTAATAATAAGGCCAAGGACGTCTGTCTGGACCAGGGGCCACTGGAAAACCACACAGCAATACTGTACCCAT  1480

Query 1481  GCCATGGCTGGGGACCACAGCTTGCCCGCTACACCAAGGAAGGCTTCCTGCACTTGGGTGCCCTGGGGACCACC  1554
            ||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GCCACGGTTGGGGACCACAGCTCGCCCGCTACACCAAGGAAGGGTTCCTGCACTTAGGTGCTCTGGGGACCACC  1554

Query 1555  ACACTCCTCCCCGACACCCGCTGCCTGGTGGACAACTCCAAGAGTCGGCTGCCCCAGCTCCTGGACTGCGACAA  1628
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1555  ACTCTCCTCCCTGATACCCGCTGCCTGGTGGACAACTCCAAGAGTCGGTTGCCGCAGCTCCTGGATTGTGACAA  1628

Query 1629  GGTCAAGAGCAGCCTGTACAAGCGCTGGAACTTCATCCAGAATGGAGCCATCATGAACAAGGGCACGGGACGCT  1702
            |||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1629  GGTCAAGAGCAGCTTGTACAAGCGTTGGAACTTCATCCAGAATGGAGCCATCATGAATAAGGGCACAGGGCGCT  1702

Query 1703  GCCTGGAGGTGGAGAACCGGGGCCTGGCTGGCATCGACCTCATCCTCCGCAGCTGCACAGGTCAGAGGTGGACC  1776
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||.|.
Sbjct 1703  GCCTAGAGGTGGAGAACCGGGGCCTGGCCGGCATCGACCTAATCCTTCGAAGCTGTACTGGACAGAGATGGGCA  1776

Query 1777  ATTAAGAACTCCATCAAG  1794
            ||.|||||..||||||||
Sbjct 1777  ATCAAGAATCCCATCAAG  1794