Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08854
- Subject:
- XM_011516467.3
- Aligned Length:
- 1797
- Identities:
- 1507
- Gaps:
- 288
Alignment
Query 1 ATGGCTTCACTGAGAAGAGTCAAAGTGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTAGCCGGCTTCGTGCTCTTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCACTGAGAAGAGTCAAAGTGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTAGCCGGCTTCGTGCTCTTCCT 74
Query 75 GGCCAAGTGCCGGCCCATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCGCGCGCCGAGGTGGCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCAAGTGCCGGCCCATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCGCGCGCCGAGGTGGCCA 148
Query 149 ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCCTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCCTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTG 222
Query 223 TACCGGCAGCTGAATGGCTTATCCAAATCCCTTGGGCTCATTGAAGGTTATGGTGGGCGGGGTAAAGGGGGCCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCGGCAGCTGAATGGCTTATCCAAATCCCTTGGGCTCATTGAAGGTTATGGTGGGCGGGGTAAAGGGGGCCT 296
Query 297 TCCGGCTACTCTTTCCCCGGCTGAAGAAGAAAAGGCTAAGGGACCCCATGAGAAGTATGGCTACAATTCATACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCGGCTACTCTTTCCCCGGCTGAAGAAGAAAAGGCTAAGGGACCCCATGAGAAGTATGGCTACAATTCATACC 370
Query 371 TCAGTGAAAAAATTTCACTGGACCGTTCCATTCCGGATTATCGTCCCACCAAGTGTAAGGAGCTCAAGTACTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGTGAAAAAATTTCACTGGACCGTTCCATTCCGGATTATCGTCCCACCAAGTGTAAGGAGCTCAAGTACTCC 444
Query 445 AAGGACCTGCCCCAGATATCCATCATATTCATCTTCGTGAACGAGGCCCTGTCGGTGATCCTGCGGTCCGTGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGGACCTGCCCCAGATATCCATCATATTCATCTTCGTGAACGAGGCCCTGTCGGTGATCCTGCGGTCCGTGCA 518
Query 519 CAGTGCCGTCAATCACACGCCCACACACCTGCTGAAGGAAATCATTCTGGTGGATGACAACAGCGACGAAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGCCGTCAATCACACGCCCACACACCTGCTGAAGGAAATCATTCTGGTGGATGACAACAGCGACGAAGAGG 592
Query 593 AGCTGAAGGTCCCCCTAGAGGAGTATGTCCACAAACGCTACCCCGGGCTGGTGAAGGTGGTAAGAAATCAGAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCTGAAGGTCCCCCTAGAGGAGTATGTCCACAAACGCTACCCCGGGCTGGTGAAGGTGGTAAGAAATCAGAAG 666
Query 667 AGGGAAGGCCTGATCCGCGCTCGCATTGAGGGCTGGAAGGTGGCTACCGGGCAGGTCACTGGCTTCTTTGATGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGGGAAGGCCTGATCCGCGCTCGCATTGAGGGCTGGAAGGTGGCTACCGGGCAGGTCACTGGCTTCTTTGATGC 740
Query 741 CCACGTGGAATTCACCGCTGGCTGGGCTGAGCCGGTTCTATCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGTGTGATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCACGTGGAATTCACCGCTGGCTGGGCTGAGCCGGTTCTATCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGTGTGATCC 814
Query 815 TCCCCTCCATTGACAACATCAAACAGGACAACTTTGAGGTGCAGCGGTACGAGAACTCGGCCCACGGGTACAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCCCTCCATTGACAACATCAAACAGGACAACTTTGAGGTGCAGCGGTACGAGAACTCGGCCCACGGGTACAGC 888
Query 889 TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGACCCTTCTCTCCCCATCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGACCCTTCTCTCCCCATCAG 962
Query 963 GACCCCAGCCATGATAGGCTGCTCGTTCGTGGTCAACAGGAAGTTCTTCGGTGAAATTGGTCTTCTGGATCCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACCCCAGCCATGATAGGCTGCTCGTTCGTGGTCAACAGGAAGTTCTTCGGTGAAATTGGTCTTCTGGATCCTG 1036
Query 1037 GCATGGATGTATACGGAGGAGAAAATATTGAACTGGGAATCAAGGTATGGCTCTGTGGGGGCAGCATGGAGGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCATGGATGTATACGGAGGAGAAAATATTGAACTGGGAATCAAGGTATGGCTCTGTGGGGGCAGCATGGAGGTC 1110
Query 1111 CTTCCTTGCTCACGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAGCCATATAATAGCAACATTGGCTTCTACACCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTCCTTGCTCACGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAGCCATATAATAGCAACATTGGCTTCTACACCAA 1184
Query 1185 GAGGAATGCTCTTCGCGTTGCTGAGGTCTGGATGGACGATTACAAGTCTCATGTGTACATAGCGTGGAACCTGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGGAATGCTCTTCGCGTTGCTGAGGTCTGGATGGACGATTACAAGTCTCATGTGTACATAGCGTGGAACCTGC 1258
Query 1259 CGCTGGAGAATCCGGGAATTGACATCGGTGATGTCTCCGAAAGAAGAGCATTAAGGAAAAGTTTAAAGTGTAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGCTGGAGAATCCGGGAATTGACATCGGTGATGTCTCCGAAAGAAGAGCATTAAGGAAAAGTTTAAAGTGTAAG 1332
Query 1333 AATTTCCAGTGGTACCTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAATAATACCGTTGCTTACGGGGAGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATTTCCAGTGGTACCTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAATAATACCGTTGCTTACGGGGAGCT 1406
Query 1407 TCGCAACAACAAGGCAAAAGACGTCTGCTTGGACCAGGGGCCGCTGGAGAACCACACAGCAATATTGTATCCGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCGCAACAACAAGGCAAAAGACGTCTGCTTGGACCAGGGGCCGCTGGAGAACCACACAGCAATATTGTATCCGT 1480
Query 1481 GCCATGGCTGGGGACCACAGCTTGCCCGCTACACCAA---GGAAGGCTTCCTGCACTTGGGTGCCCTGGGGACC 1551
|||||||||||||||||||| || |.||.||
Sbjct 1481 GCCATGGCTGGGGACCACAG---------------AAATGGAAAAGC--------------------------- 1512
Query 1552 ACCACACTCCTCCCCGACACCCGCTGCCTGGTGGACAACTCCAAGAGTCGGCTGCCCCAGCTCCTGGACTGCGA 1625
Sbjct 1513 -------------------------------------------------------------------------- 1512
Query 1626 CAAGGTCAAGAGCAGCCTGTACAAGCGCTGGAACTTCATCCAGAATGGAGCCATCATGAACAAGGGCACGGGAC 1699
Sbjct 1513 -------------------------------------------------------------------------- 1512
Query 1700 GCTGCCTGGAGGTGGAGAACCGGGGCCTGGCTGGCATCGACCTCATCCTCCGCAGCTGCACAGGTCAGAGGTGG 1773
Sbjct 1513 -------------------------------------------------------------------------- 1512
Query 1774 ACCATTAAGAACTCCATCAAG 1794
Sbjct 1513 --------------------- 1512