Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08862
• Subject: NM_022743.2
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1105
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAACAGGGGAAACGGGCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGGATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACCGCTGCCTTCTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG  222
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------ATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG  45

Query  223  TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC  119

Query  297  AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT  193

Query  371  ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAGGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA  267

Query  445  ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA  341

Query  519  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT  415

Query  593  ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA  489

Query  667  CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGATGACCAGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGATGACCAGTGA  563

Query  741  GGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAATGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  GGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAATGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGG  637

Query  815  ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG  711

Query  889  AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCGATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCAATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC  785

Query  963  CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG  859

Query 1037  AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG  933

Query 1111  GTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  GTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACT  1007

Query 1185  GGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  GGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGAAG  1081

Query 1259  AATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  AATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC  1107