Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08862
• Subject: XM_011544253.1
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1170
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAACAGGGGAAACGGGCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAAGAGGGGAAACGGGCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCG  74

Query   75  CCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGGATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGGATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCG  148

Query  149  ACCGCTGCCTTCTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCGCTGCCTTCTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG  222

Query  223  TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC  296

Query  297  AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT  370

Query  371  ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAGGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA  444

Query  445  ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA  518

Query  519  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT  592

Query  593  ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA  666

Query  667  CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGATGACCAGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  667  CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGG----------------------------------------  700

Query  741  GGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAATGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGG  814
                                                                                   |||
Sbjct  701  -----------------------------------------------------------------------AGG  703

Query  815  ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG  777

Query  889  AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCGATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCAATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC  851

Query  963  CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG  925

Query 1037  AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG  999

Query 1111  GTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  GTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACT  1073

Query 1185  GGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGAAG  1147

Query 1259  AATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  AATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC  1173