Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08875
• Subject: NM_022826.4
• Aligned Length: 2112
• Identities: 2110
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT  74

Query   75  GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAAT  148

Query  149  ATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAG  222

Query  223  GGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTG  296

Query  297  TACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCATAGTCAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCATAGTCAAG  370

Query  371  TTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATTTGGAGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATTTGGAGAGA  444

Query  445  AGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCATCATATGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCATCATATGT  518

Query  519  TCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACAGTTGAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACAGTTGAATA  592

Query  593  CATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGATTCCAGAAATTCTTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGACTCCAGAAATTCTTTA  666

Query  667  AGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTACAGTTCAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTACAGTTCAAG  740

Query  741  TAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGAATCTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGAATCTTCTG  814

Query  815  ACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTTTTTTTTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTTTTTTTTCA  888

Query  889  CGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCAAGAATCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCAAGAATCTT  962

Query  963  GACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGAAGCTTCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGAAGCTTCTC  1036

Query 1037  AGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGTCAGATTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGTCAGATTCA  1110

Query 1111  GAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAATAGATGCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAATAGATGCAC  1184

Query 1185  ACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATACATCATCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATACATCATCTA  1258

Query 1259  GATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTGGAGCTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTGGAGCTGCT  1332

Query 1333  GCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCGGCTCAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCGGCTCAAGG  1406

Query 1407  TGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCCCCAGCACTTGGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  TGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCTCCAGCACTTGGGA  1480

Query 1481  GTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATGGTAAAAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATGGTAAAAGT  1554

Query 1555  GATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTTTTAGAGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTTTTAGAGGA  1628

Query 1629  CTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTTGCTGATAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTTGCTGATAG  1702

Query 1703  AGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGGCCAAAATT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGGCCAAAATT  1776

Query 1777  AACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAACCTGGAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAACCTGGAGGA  1850

Query 1851  TTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTCTGGTCTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTCTGGTCTCT  1924

Query 1925  ACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAACCAAGCACA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAACCAAGCACA  1998

Query 1999  CGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATCTCGAAACTTCAGAGGATGATTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATCTCGAAACTTCAGAGGATGATTC  2072

Query 2073  CGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC  2112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC  2112