Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08876
• Subject: NM_001286767.2
• Aligned Length: 1098
• Identities: 1061
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGACTGTCCGAAACATCGCCTCCATCTGTAATATGGGCACCAATGCCTCTGCTCTGGAAAAAGACATTGGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGTCCGAAACATCGCCTCCATCTGTAATATGGGCACCAATGCCTCTGCTCTGGAAAAAGACATTGGTCC  74

Query   75  AGAGCAGTTTCCAATCAATGAACACTATTTCGGATTGGTCAATTTTGGAAACACATGCTACTGTAACTCCGTGC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct   75  AGAGCAGTTTCCAATCAATGAACACTATTTCGGATTGGTCAAT-------------------------------  117

Query  149  TTCAGGCATTGTACTTCTGCCGTCCATTCCGGGAGAATGTGTTGGCATACAAGGCCCAGCAAAAGAAGAAGGAA  222
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  -----GCATTGTACTTCTGCCGTCCATTCCGGGAGAATGTGTTGGCATACAAGGCCCAGCAAAAGAAGAAGGAA  186

Query  223  AACTTGCTGACGTGCCTGGCGGACCTTTTCCACAGCATTGCCACACAGAAGAAGAAGGTTGGCGTCATCCCACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  AACTTGCTGACGTGCCTGGCGGACCTTTTCCACAGCATTGCCACACAGAAGAAGAAGGTTGGCGTCATCCCACC  260

Query  297  AAAGAAGTTCATTTCAAGGCTGAGAAAAGAGAATGATCTCTTTGATAACTACATGCAGCAGGATGCTCATGAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  AAAGAAGTTCATTTCAAGGCTGAGAAAAGAGAATGATCTCTTTGATAACTACATGCAGCAGGATGCTCATGAAT  334

Query  371  TTTTAAATTATTTGCTAAACACTATTGCGGACATCCTTCAGGAGGAGAAGAAACAGGAAAAACAAAATGGAAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TTTTAAATTATTTGCTAAACACTATTGCGGACATCCTTCAGGAGGAGAAGAAACAGGAAAAACAAAATGGAAAA  408

Query  445  TTAAAAAATGGCAACATGAACGAACCTGCGGAAAATAATAAACCAGAACTCACCTGGGTCCATGAGATTTTTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  TTAAAAAATGGCAACATGAACGAACCTGCGGAAAATAATAAACCAGAACTCACCTGGGTCCATGAGATTTTTCA  482

Query  519  GGGAACGCTTACCAATGAAACTCGATGCTTGAACTGTGAAACTGTTAGTAGCAAAGATGAAGATTTTCTTGACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  GGGAACGCTTACCAATGAAACTCGATGCTTGAACTGTGAAACTGTTAGTAGCAAAGATGAAGATTTTCTTGACC  556

Query  593  TTTCTGTTGATGTGGAGCAGAATACATCCATTACCCACTGTCTAAGAGACTTCAGCAACACAGAAACACTGTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  TTTCTGTTGATGTGGAGCAGAATACATCCATTACCCACTGTCTAAGAGACTTCAGCAACACAGAAACACTGTGT  630

Query  667  AGTGAACAAAAATATTATTGTGAAACATGCTGCAGCAAACAAGAAGCCCAGAAAAGGATGAGGGTAAAAAAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  AGTGAACAAAAATATTATTGTGAAACATGCTGCAGCAAACAAGAAGCCCAGAAAAGGATGAGGGTAAAAAAGCT  704

Query  741  GCCCATGATCTTGGCCCTGCACCTAAAGCGGTTCAAGTACATGGAGCAGCTGCACAGATACACCAAGCTGTCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  GCCCATGATCTTGGCCCTGCACCTAAAGCGGTTCAAGTACATGGAGCAGCTGCACAGATACACCAAGCTGTCTT  778

Query  815  ACCGTGTGGTCTTCCCTCTGGAACTCCGGCTCTTCAACACCTCCAGTGATGCAGTGAACCTGGACCGCATGTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  ACCGTGTGGTCTTCCCTCTGGAACTCCGGCTCTTCAACACCTCCAGTGATGCAGTGAACCTGGACCGCATGTAT  852

Query  889  GACTTGGTTGCGGTGGTCGTTCACTGTGGCAGTGGTCCTAATCGTGGGCATTATATCACTATTGTGAAAAGTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  GACTTGGTTGCGGTGGTCGTTCACTGTGGCAGTGGTCCTAATCGTGGGCATTATATCACTATTGTGAAAAGTCA  926

Query  963  CGGCTTCTGGCTTTTGTTTGATGATGACATTGTAGAGAAAATAGATGCTCAAGCTATTGAAGAATTCTATGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  CGGCTTCTGGCTTTTGTTTGATGATGACATTGTAGAGAAAATAGATGCTCAAGCTATTGAAGAATTCTATGGCC  1000

Query 1037  TGACGTCAGATATATCAAAAAATTCAGAATCTGGATATATTTTATTCTATCAGTCAAGAGAA  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1001  TGACGTCAGATATATCAAAAAATTCAGAATCTGGATATATTTTATTCTATCAGTCAAGAGAG  1062