Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08876
• Subject: XM_006504268.3
• Aligned Length: 1099
• Identities: 1000
• Gaps: 23

Alignment

Query    1  ATG-ACTGTCCGAAACATCGCCTCCATCTGTAATATGGGCACCAATGCCTCTGCTCTGGAAAAAGACATTGGTC  73
            ||| |||||            .||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGAACTGT------------TTCCA----------GGGCACCAATGCCTCTGCTCTGGAAAAAGACATTGGAC  52

Query   74  CAGAGCAGTTTCCAATCAATGAACACTATTTCGGATTGGTCAATTTTGGAAACACATGCTACTGTAACTCCGTG  147
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  CAGAGCAGTTTCCGATCAATGAACACTACTTCGGATTGGTCAATTTTGGAAACACATGCTACTGTAACTCCGTG  126

Query  148  CTTCAGGCATTGTACTTCTGCCGTCCATTCCGGGAGAATGTGTTGGCATACAAGGCCCAGCAAAAGAAGAAGGA  221
            |||||.||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  127  CTTCAAGCGCTGTACTTCTGCCGGCCGTTCCGGGAGAATGTGTTGGCATACAAGGCCCAGCAAAAAAAGAAGGA  200

Query  222  AAACTTGCTGACGTGCCTGGCGGACCTTTTCCACAGCATTGCCACACAGAAGAAGAAGGTTGGCGTCATCCCAC  295
            ||||.||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  AAACCTGTTGACATGCCTGGCAGACCTTTTCCACAGCATTGCCACGCAGAAGAAGAAGGTTGGCGTCATCCCAC  274

Query  296  CAAAGAAGTTCATTTCAAGGCTGAGAAAAGAGAATGATCTCTTTGATAACTACATGCAGCAGGATGCTCATGAA  369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  275  CAAAGAAGTTCATTTCAAGGCTGAGGAAAGAGAACGATCTCTTTGATAACTACATGCAGCAGGATGCTCACGAG  348

Query  370  TTTTTAAATTATTTGCTAAACACTATTGCGGACATCCTTCAGGAGGAGAAGAAACAGGAAAAACAAAATGGAAA  443
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  349  TTCTTAAATTATTTGCTAAACACTATTGCGGACATCCTGCAGGAAGAGAAGAAACAGGAAAAACAAAACGGGAA  422

Query  444  ATTAAAAAATGGCAACATGAACGAACCTGCGGAAAATAATAAACCAGAACTCACCTGGGTCCATGAGATTTTTC  517
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  423  GTTAAAAAACGGCAACATGAACGAACCAGCCGAGAACAATAAGCCAGAACTCACCTGGGTCCACGAGATTTTTC  496

Query  518  AGGGAACGCTTACCAATGAAACTCGATGCTTGAACTGTGAAACTGTTAGTAGCAAAGATGAAGATTTTCTTGAC  591
            |||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  AGGGAACACTCACTAACGAAACTCGATGCTTGAACTGTGAAACTGTGAGTAGCAAAGATGAAGATTTTCTTGAC  570

Query  592  CTTTCTGTTGATGTGGAGCAGAATACATCCATTACCCACTGTCTAAGAGACTTCAGCAACACAGAAACACTGTG  665
            ||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  571  CTCTCTGTCGATGTGGAACAGAACACCTCCATCACCCACTGTCTGAGAGACTTCAGCAACACAGAAACGCTGTG  644

Query  666  TAGTGAACAAAAATATTATTGTGAAACATGCTGCAGCAAACAAGAAGCCCAGAAAAGGATGAGGGTAAAAAAGC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  645  TAGTGAACAAAAATATTATTGTGAAACATGTTGCAGCAAACAGGAGGCTCAGAAGAGGATGAGGGTAAAAAAGC  718

Query  740  TGCCCATGATCTTGGCCCTGCACCTAAAGCGGTTCAAGTACATGGAGCAGCTGCACAGATACACCAAGCTGTCT  813
            ||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  719  TGCCCATGATTTTGGCCCTGCACCTCAAGAGGTTCAAGTACATGGAACAGCTCCACAGGTACACCAAGCTGTCT  792

Query  814  TACCGTGTGGTCTTCCCTCTGGAACTCCGGCTCTTCAACACCTCCAGTGATGCAGTGAACCTGGACCGCATGTA  887
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  793  TACCGGGTGGTCTTCCCTCTGGAACTCCGGCTCTTCAACACCTCCAGCGATGCTGTGAACCTGGACCGCATGTA  866

Query  888  TGACTTGGTTGCGGTGGTCGTTCACTGTGGCAGTGGTCCTAATCGTGGGCATTATATCACTATTGTGAAAAGTC  961
            ||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  867  TGACCTGGTTGCTGTGGTCGTTCACTGTGGAAGTGGTCCTAACCGTGGGCATTACATCACCATCGTAAAAAGTC  940

Query  962  ACGGCTTCTGGCTTTTGTTTGATGATGACATTGTAGAGAAAATAGATGCTCAAGCTATTGAAGAATTCTATGGC  1035
            |.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  941  ATGGCTTCTGGCTGTTGTTTGATGACGACATTGTAGAGAAAATAGACGCTCAAGCCATTGAGGAATTCTATGGT  1014

Query 1036  CTGACGTCAGATATATCAAAAAATTCAGAATCTGGATATATTTTATTCTATCAGTCAAGAGAA  1098
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1015  CTAACGTCAGATATATCAAAAAATTCAGAATCTGGATATATTTTATTCTATCAATCAAGAGAA  1077