Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08894
• Subject: NM_001048183.3
• Aligned Length: 2106
• Identities: 2105
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGATCCATTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCCAGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGATCCATTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCCAGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGG  74

Query   75  AGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCTTTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCTTTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGA  148

Query  149  GGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTTTTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTTTTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCA  222

Query  223  AGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGAGCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGAGCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAG  296

Query  297  CGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATGCCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATGCCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGG  370

Query  371  AAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAAGAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAAGAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACT  444

Query  445  GGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGTACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGTACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAG  518

Query  519  ACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGGATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGGATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGT  592

Query  593  TCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACTGCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACTGCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAAT  666

Query  667  CTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGCTCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGCTCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCC  740

Query  741  AAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTCCCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTCCCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACC  814

Query  815  CTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTGTTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTGTTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCT  888

Query  889  AAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGCTGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGCTGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGA  962

Query  963  TGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTACCAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTACCAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCC  1036

Query 1037  CACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCATTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCATTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCA  1110

Query 1111  GAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCCCCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCCCCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCC  1184

Query 1185  CAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCTCTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCTCTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTC  1258

Query 1259  GAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATTCTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATTCTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTG  1332

Query 1333  CTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCTGGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCTGGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTAT  1406

Query 1407  TGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAACCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAACCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGA  1480

Query 1481  CACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCA  1554

Query 1555  GAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAGCTATCAGAGTGCTCTTGCCAACAAAGTGAA  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAGCTATCAGAGTGCTCTCGCCAACAAAGTGAA  1628

Query 1629  GAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTGAACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTGAACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTT  1702

Query 1703  GTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGAAACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGAAACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGA  1776

Query 1777  CCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAAAAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAAAAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACG  1850

Query 1851  AGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAACTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAACTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTC  1924

Query 1925  TGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTATGACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTATGACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAA  1998

Query 1999  CTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGAATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGAATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGA  2072

Query 2073  AGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA  2106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA  2106