Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08911
• Subject: NR_103728.1
• Aligned Length: 1265
• Identities: 930
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  -------------------------------------------ATGAGAACAGAGGCACAGGTGCCGGCCCTGC  31
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GGAAGTGGCTGTTTGGCTGCTGACAACATGAAGACTTCCTGCGATGAGAACAGAGGCACAGGTGCCGGCCCTGC  74

Query   32  AGCCCCCAGAACCTGGACTGGAGGGGGCCATGGGGCACCGGACCCTGGTCCTGCCCTGGGTGCTGCTGACCTTG  105
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   75  AGCCCCCAGAACCCGGACTGGAGGGGGCCATGGGGCGCCGGACCCTGGCCCTGCCCTGGGTGCTGCTGACCCTG  148

Query  106  TGTGTCACTGCGGGGACCCCGGAGGTGTGGGTTCAAGTTCGGATGGAGGCCACCGAGCTCTCGTCCTTCACCAT  179
            .||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGTGTCACTGCAGGGACCCCGGAGGTGTGAGTACAAGTTCGGATGGAGGCCACCGAGCTCTCGTCCTTCACCAT  222

Query  180  CCGTTGTGGGTTCCTGGGGTCTGGCTCCATCTCCCTGGTGACTGTGAGCTGGGGGGGCCCCGACGGTGCTGGGG  253
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct  223  CCGTTGTGGGTTCCTGGAGTCTGGCTCCATCTCCCTGGTGACTGTGAGCAGGGGGGGCCCCGATGGTGCTGGGG  296

Query  254  GGACCACGCTGGCTGTGTTGCACCCAGAACGTGGCATCCGGCAATGGGCCCCTGCTCGCCAGGCCCGCTGGGAA  327
            |||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCACGCTGGCTGTGTTGCACCCGGAACTTGGCATCCAGCAATGGGCCCCTGCTCGCCAGGCCCGCTGGGAA  370

Query  328  ACCCAGAGCAGCATCTCTCTCATCCTGGAAGGCTCTGGGGCCAGCAGCCCCTGCGCCAACACCACCTTCTGCTG  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCCAGAGCAGCATCTCTCTCATCCTGGAAGGCTCTGGGGCCAGCAGCCCCTGCGCCAACACCACCTTCTGCTG  444

Query  402  CAAGTTTGCGTCCTTCCCTGAGGGCTCCTGGGAGGCCTGTGGGAGCCTCCCGCCCAGCTCAGACCCAGGGCTCT  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGTTTGCGTCCTTCCCTGAGGGCTCCTGGGAGGCCTGTGGGAGCCTCCCGCCCAGCTCAGACCCAGGGCTCT  518

Query  476  CTGCCCCGCCGACTCCTGCCCCCATTCTGCGGGCAGACCTGGCCGGGATCTTGGGGGTCTCAGGAGTCCTCCTC  549
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  519  CTGTCCCGCCGACTCCTGCCCCCATTCTGCGGGCAGACCTGGCCGGGATCTTGGGGGTCTCAGGAGTCCTTCTC  592

Query  550  TTTGGCTGTGTCTACCTCCTTCATCTGCTGCGCCGACATAAGCACCGCCCTGCCCCTAGGCTCCAGCCGTCCCG  623
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  593  TTTGACTGTGGCTACCTCCTTCATCTGCTGTGCCGACAGAAGCACCGCCCTGCCCCTAGGCTCCAGCCATCCCA  666

Query  624  CACCAGCCCCCAGGCACCGAGAGCACGAGCATGGGCACCAAGCCAGGCCTCCCAGGCTGCTCTTCACGTCCCTT  697
            |||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  667  CACCAGCTCCTAGGCACTGAGAGCACGAGCATGGGCACCCAGCCAGGCCTCCCAGGCTGCTCTCCACGTCCCTT  740

Query  698  ATGCCACTATCAACACCAGCTGCCGCCCAGCTACTTTGGACACAGCTCACCCCC-ATGGGGGGCCGTCCTGGTG  770
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||| |..||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGCCACTATCAACACCAGCTGCTGCCCAGCTACTTTGGACACAGCTCACCCCCGACAGGGGGCCGTCCTGGTG  814

Query  771  GGCGTCACTCCCCACCCACGCTGCACACCGGCCCCAGGGCCCTGCCGCCTGGGCCTCCACACCCATCCCTGCAC  844
            |||.|||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  GGCATCACTCCCCACCCACACCGCACACTGGCCCCAGGGCCCTGCTGCCTGGGCCTCCACATCCATCCCTGCAC  888

Query  845  GTGGCAGCTTTGTCTCTGTTGAGAATGGACTCTACGCTCAGGCAGGGGAGAGGCCTCCTCACACTGGTCCCGGC  918
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||...|||||||||.|||
Sbjct  889  ATGGCAGCTTTGTCTCTGTTGAGAATGGACTCTACGCTTAGGCTGGGCAGAGGCCTCCCTGCACTGGTCCTGGC  962

Query  919  CTCACTCTTTTCCCTGACCCTCGGGGGCCCAGGGCCATGGAAGGACCCTTAGGAGTTCGA--------------  978
            ||||||||||||||||||||| .||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|              
Sbjct  963  CTCACTCTTTTCCCTGACCCT-TGGGGCCCAGGGCCATGGAGGGACCCTTAGGAGTTCAATGAGAGAGACCATG  1035

Query  979  --------------------------------------------------------------------------  978
                                                                                      
Sbjct 1036  AGGCCACTGGGCTTTCCCCTTCCCAGGCCTCCTGGGTGCCACCCCCTTACGTTATTCTTGGGCCTCTAATAAGT  1109

Query  979  --------------------------------------------------------------------------  978
                                                                                      
Sbjct 1110  GTCCCACAGGTGCCTGGCCAGGCCCACCTGCTGCAGATGTGGTCTGTGTGTGTGCATGTGTGGGTGTGTGTGGG  1183

Query  979  --------------------------------------------------------------------------  978
                                                                                      
Sbjct 1184  CACAGGTGTGAGTGTGTGAGCAACAGTACCCCATTCCAGTCGTTTCCTGCTGTGACTAAGTCAGCAACACAGTT  1257

Query  979  -------  978
                   
Sbjct 1258  CCTCTGA  1264