Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08942
• Subject: XM_011542141.3
• Aligned Length: 1263
• Identities: 1007
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  ATGTACGCCTTTGTGCGGTTCCTGGAGGACAACGTCTGCTACGCGCTGCCCGTGTCGTGCGTGCGCGACTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCCGCTCGCGGCTGGATTTTGACAACCAGAAGGTGTACGCCGTGTACCGGGGCCCGGAGGAATTGGGCGCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCCGAGAGCCCCCCGCGCGCCCCCCGCGACTGGGGCGCGCTGTTGCTCCACAAGGCCCAGATCCTGGCGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGAAGACAAATCTGACCTTGAAAACAGTGTGATGCAGAAGAAAATAAAAATCCCCAAGCTTTCTCTTAATCA  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGCAGAAGAAAATAAAAATCCCCAAGCTTTCTCTTAATCA  41

Query  297  TGTAGAAGAAGATGGAGAGGTTAAAGATTATGGGGAAGAAGATTTACAGCTTAGACACATCAAGAGACCTGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  TGTAGAAGAAGATGGAGAGGTTAAAGATTATGGGGAAGAAGATTTACAGCTTAGACACATCAAGAGACCTGAGG  115

Query  371  GGCGGAAGCCGAGCGAAGTGGCGCACAAGAGCATCGAGGCAGTGGTGGCTCGGCTAGAGAAGCAGAACGGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  GGCGGAAGCCGAGCGAAGTGGCGCACAAGAGCATCGAGGCAGTGGTGGCTCGGCTAGAGAAGCAGAACGGCCTG  189

Query  445  AGCCTGGGCCATAGCACGTGTCCGGAAGAGGTCTTCGTGGAGGCCTCGCCAGGCACAGAGGACATGGACAGTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  AGCCTGGGCCATAGCACGTGTCCGGAAGAGGTCTTCGTGGAGGCCTCGCCAGGCACAGAGGACATGGACAGTCT  263

Query  519  AGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGAGGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCAGCAACAGGAAGAGATGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  AGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGAGGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCAGCAACAGGAAGAGATGC  337

Query  593  GCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGAGGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGAAGCTCAAGGAGTACGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  GCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGAGGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGAAGCTCAAGGAGTACGGG  411

Query  667  GCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGACCTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTGCTGCTCCTGAGGCTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  412  GCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGACCTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTGCTGCTCCTGCGGCTTGG  485

Query  741  CAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAAGTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCCGGAGTTACGGAGCACTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  CAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAAGTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCCGGAGTTACGGAGCACTT  559

Query  815  TCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACCCCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACAAGTATATCCTAGACAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  TCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACCCCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACAAGTATATCCTAGACAAT  633

Query  889  GGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTTGATGAGGAGAAATGGCACCAGCTACAAGTAACCCAAGGAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  GGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTTGATGAGGAGAAATGGCACCAGCTACAAGTAACCCAAGGAGA  707

Query  963  TTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGATTTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAACAGAAGCGTCACAGGCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  TTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGATTTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAACAGAAGCGTCACAGGCG  781

Query 1037  TCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTAAACCACCCCTCTCGCCTCACAAACTAAGCATCGTCAGAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  TCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTAAACCACCCCTCTCGCCTCACAAACTAAGCATCGTCAGAGAG  855

Query 1111  TGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTGGATGAAACTGAAATTGCACAGAGACTCTCCAAAGTCAACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  TGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTGGATGAAACTGAAATTGCACAGAGACTCTCCAAAGTCAACAA  929

Query 1185  GTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAAATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAGGGAAGCAAAATACAATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  GTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAAATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAGGGAAGCAAAATACAATT  1003

Query 1259  TGCAA  1263
            |||||
Sbjct 1004  TGCAA  1008