Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08959
- Subject:
- NM_001303451.2
- Aligned Length:
- 1848
- Identities:
- 1658
- Gaps:
- 189
Alignment
Query 1 ATGATGGAGGGAAGCAGGCAGACGCGAGTGTCTCGGCCATACAAGATCAGCGAATCATCAAAGGTATACCGCTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGAGGGAAGCAGGCAGACGCGAGTGTCTCGGCCATACAAGATCAGCGAATCATCAAAGGTATACCGCTG 74
Query 75 GGCCGACCACTCAAGCACGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGTCTCCGCGGGCTCTTCTGCGACGTCGTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCGACCACTCAAGCACGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGTCTCCGCGGGCTCTTCTGCGACGTCGTCC 148
Query 149 TGGTGGCCGATGAGCAGCGTGTGCCAGCCCATCGCAACCTGCTGGCCGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGTGGCCGATGAGCAGCGTGTGCCAGCCCATCGCAACCTGCTGGCCGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG 222
Query 223 TTCACCATCGGCATGCGGGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGATCGGCGCCTCCTACATTGGGCTCAAGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCACCATCGGCATGCGGGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGATCGGCGCCTCCTACATTGGGCTCAAGGC 296
Query 297 CGTGGTGGACTTCCTGTACGGCGGGGAGCTGGTGCTGGATGGCGGCAACATTGACTACGTCCTGGAGACGGCTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGTGGTGGACTTCCTGTACGGCGGGGAGCTGGTGCTGGATGGCGGCAACATTGACTACGTCCTGGAGACGGCTC 370
Query 371 ACCTGCTGCAGATCTGGACGGTGGTAGACTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGCTGCAGATCTGGACGGTGGTAGACTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAC 444
Query 445 CTGTACCTGCAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGCCTCAAGCGGCTTGATGCCTTCATCGATGGCTTCATCCTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGTACCTGCAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGCCTCAAGCGGCTTGATGCCTTCATCGATGGCTTCATCCTGAA 518
Query 519 CCACTTCGGCACGCTGTCCTTTACGCCCGACTTCCTGCAGAACGTCTCCATGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACTTCGGCACGCTGTCCTTTACGCCCGACTTCCTGCAGAACGTCTCCATGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA 592
Query 593 GCAGCAGCGAGGTGCAGCGGGAGTGTGAGCACGACCTCTTGCAGGCCGCCCTGCAGTGGCTGACGCAGCAGCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAGCAGCGAGGTGCAGCGGGAGTGTGAGCACGACCTCCTGCAGGCCGCCCTGCAGTGGCTGACGCAGCAGCCC 666
Query 667 GAGCGCGAGGCCCACGCCCGCCAGGTGCTGGAGAACATCCACTTCCCGCTCATCCCCAAGAACGACCTGCTGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGCGCGAGGCCCACGCCCGCCAGGTGCTGGAGAACATCCACTTCCCGCTCATCCCCAAGAACGACCTGCTGCA 740
Query 741 CCGCGTCAAGCCGGCCGTGTGCTCGCTGCTGCCCAAGGAGGCCAACTGCGAGGGCTTCATCGAGGAGGCCGTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCGTCAAGCCGGCCGTGTGCTCGCTGCTGCCCAAGGAGGCCAACTGCGAGGGCTTCATCGAGGAGGCCGTGC 814
Query 815 GCTACCACAACAACCTGGCGGCCCAGCCCGTCATGCAGACCAAGCGCACGGCGCTGCGCACCAACCAGGAGCGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTACCACAACAACCTGGCGGCCCAGCCCGTCATGCAGACCAAGCGCACGGCGCTGCGCACCAACCAGGAGCGC 888
Query 889 CTGCTGTTTGTGGGCGGCGAGGTCTCCGAGCGGTGTCTGGAGCTCAGTGACGACACCTGCTACCTGGACGCCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCTGTTTGTGGGCGGCGAGGTCTCCGAGCGGTGTCTGGAGCTCAGTGACGACACCTGCTACCTGGACGCCAA 962
Query 963 GAGCGAGCAGTGGGTCAAAGAGACGCCGCTGCCCGCCCGGCGGAGCCACCACTGTGTCGCGGTGCTGGGGGGCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGCGAGCAGTGGGTCAAAGAGACGCCGCTGCCCGCCCGGCGGAGCCACCACTGTGTCGCGGTGCTGGGGGGCT 1036
Query 1037 TCATCTTCATCGCCGGCGGCAGCTTCTCACGGGACAACGGAGGGGATGCGGCCTCCAATCTTCTTTATAGGTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCATCTTCATCGCCGGCGGCAGCTTCTCACGGGACAACGGAGGGGATGCGGCCTCCAATCTTCTTTAT------ 1104
Query 1111 GACCCCCGCTGTAAACAGTGGATCAAGGTGGCCTCCATGAACCAGCGCCGTGTGGATTTCTACCTTGCCTCCAT 1184
Sbjct 1105 -------------------------------------------------------------------------- 1104
Query 1185 CGAAGACATGCTGGTGGCCATCGGCGGCCGGAATGAGAACGGAGCGCTCTCTTCAGTAGAGACGTACAGTCCCA 1258
Sbjct 1105 -------------------------------------------------------------------------- 1104
Query 1259 AGACTGACTCCCGGTCCTATGTGGCCGGCTTGCCAAGGTTCACGTACGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 -----------------------------------AGGTTCACGTACGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC 1143
Query 1333 TTCGTGTACATCTCGGGGGGCCACGACTACCAAATTGGCCCCTACCGCAAGAACCTGCTATGCTACGACCACCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144 TTCGTGTACATCTCGGGGGGCCACGACTACCAAATTGGCCCCTACCGCAAGAACCTGCTATGCTACGACCACCG 1217
Query 1407 GACAGACGTGTGGGAGGAGCGGCGGCCCATGACCACGGCGCGCGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGTGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 GACAGACGTGTGGGAGGAGCGGCGGCCCATGACCACGGCGCGCGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGTGACA 1291
Query 1481 GCATCTACTCCATCGGGGGCAGCGATGACAACATCGAGTCCATGGAGCGCTTCGACGTGCTGGGCGTGGAGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 GCATCTACTCCATCGGGGGCAGCGATGACAACATCGAGTCCATGGAGCGCTTCGACGTGCTGGGCGTGGAGGCC 1365
Query 1555 TACAGCCCGCAGTGCAACCAGTGGACCCGCGTGGCGCCGCTGCTGCACGCCAACAGCGAGTCGGGCGTGGCAGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 TACAGCCCGCAGTGCAACCAGTGGACCCGCGTGGCGCCGCTGCTGCACGCCAACAGCGAGTCGGGCGTGGCAGT 1439
Query 1629 GTGGGAGGGCCGCATCTACATCCTGGGCGGCTACAGCTGGGAGAACACTGCCTTCTCCAAGACCGTGCAGGTGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 GTGGGAGGGCCGCATCTACATCCTGGGCGGCTACAGCTGGGAGAACACTGCCTTCTCCAAGACCGTGCAGGTGT 1513
Query 1703 ACGACCGCGAGGCCGACAAGTGGAGCAGGGGCGTCGACCTGCCCAAGGCCATCGCTGGCGGGTCCGCCTGTGTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 ACGACCGCGAGGCCGACAAGTGGAGCAGGGGCGTCGACCTGCCCAAGGCCATCGCTGGCGGGTCCGCCTGTGTC 1587
Query 1777 TGCGCCCTGGAGCCACGGCCAGAGGACAAGAAGAAGAAAGGCAAAGGCAAGAGGCACCAGGACCGGGGCCAG 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 TGCGCCCTGGAGCCACGGCCAGAGGACAAGAAGAAGAAAGGCAAAGGCAAGAGGCACCAGGACCGGGGCCAG 1659