Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09020
- Subject:
- NM_025158.5
- Aligned Length:
- 2124
- Identities:
- 1799
- Gaps:
- 324
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCGACCGGGAAGGCGGCTGCGCTGCTGGGCGGGGGCGGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGAGCCGGGGCCGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCCGGGTCAGCGCTTGAGCCGGGAGAAGAGTTTGAGATCGTGGACCGAAGCCAGCTGCCCGGCCCAGGCGACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCGGAGCGCAACGAGGCCGCGGGCGGCCGAGGGCTGGTCGGCGCCCATCCTGACCCTGGCACGCAGGGCCACC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGAACCTGTCGGCGAGCTGCGGGAGCGCGCTGCGCGCGGCCGCGGGGCTGGGCGGCGGGGACAGCGGGGACGG 296
Query 1 ----------------------------ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACGGCGCGCGCAGCTTCTAAGTGCCAGATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA 370
Query 47 TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC 444
Query 121 TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT 518
Query 195 CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC 592
Query 269 CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT 666
Query 343 TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA 740
Query 417 AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG 814
Query 491 ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG 888
Query 565 GAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCAC 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCAC 962
Query 639 AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG 1036
Query 713 CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA 1110
Query 787 AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG 1184
Query 861 TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG 1258
Query 935 AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG 1332
Query 1009 AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA 1406
Query 1083 AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG 1480
Query 1157 TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGG 1230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGG 1554
Query 1231 AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA 1628
Query 1305 ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG 1702
Query 1379 AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT 1776
Query 1453 CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT 1850
Query 1527 CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG 1924
Query 1601 ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC 1998
Query 1675 TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT 2072
Query 1749 GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 2124