Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09020
• Subject: NM_172557.2
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1589
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGCCCGCGGAGAATGCCGCCGGGCGGGGCAGGATTCGGAGCCGGAGCCGGAGCGGGAGCCGGAGTCCGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCGGGGCCGGAGCCTGAGCCCCAAGCAGGCCTAGAGTCCGGGGAAGCGTTCGAGATCGTGGACCGGAGCCAGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCCGAGTCCCGGCGAGCTGCGGAGTGCGTCGCGGCCTCGAGTGGCCGACAGCTGGTCGGCGCCCATCCTGACG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTGGCGCGCAGAGCCACCGGGAACCTGTCGGCGAGCTGCGGCAGCGCGCTGCGCGCGGCCGCGGGGCTGGGAGA  296

Query    1  ----------------------------------------ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGA  34
                                                    |||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CGGCGGCGGCGGCGGGGAGCGCGCAGCTTCCAAAGGCCAGATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTAATGCACATGA  370

Query   35  TGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCC  108
            |||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct  371  TGAAACTCAGCATTAAGGTCTTACTCCAGTCTGCCCTTAGCCTGGGACGCAGTCTGGATGCAGACTATGCCCCC  444

Query  109  TTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCA  182
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCATTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTCAAGAAGAGTTTCATTGGCCA  518

Query  183  AAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTG  256
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  519  AAATAAGTCTTTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAAAAACTTTGTCCTGAAGCATCAGATATAGCTACCAGTG  592

Query  257  TCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAG  330
            ||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  TCAGGAATCTTCCAGAACTAAAGACAGCCGTGGGAAGAGGCAGAGCGTGGCTTTATCTTGCTCTCATGCAAAAG  666

Query  331  AAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTT  404
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  AAACTGGCAGATTATCTGAAAGTCCTCATAGACAACAAGCAGCTCCTAAGTGAGTTCTATGAGCCCGAGGCCTT  740

Query  405  AATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCT  478
            ||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  AATGATGGAGGAGGAAGGAATGGTGATCGTGGGTCTGCTGGTGGGACTCAACGTTCTGGATGCCAACCTCTGCT  814

Query  479  TGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTT  552
            |.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||..||.|||||.|..|||||||||
Sbjct  815  TAAAGGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTCGGGGTGATTGACTTCTCTCTCTGTCTGAAGGACGCACAGGATCTT  888

Query  553  GATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCA  626
            ||..|.||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GACAGCGGCAGAGAGCATGAAAGAATTACCGATGTCCTTGATCAGAAAAATTACGTGGAGGAACTTAACCGGCA  962

Query  627  CTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAG  700
            |.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTAAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAGACGAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACGAACTCAAAGCTTCAAGAAG  1036

Query  701  AGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTA  774
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||.||||||.|.||||||||.||.|||.||
Sbjct 1037  AGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGTTCCCTACAAAAAGAACAACAGCAGCTGAGAGAACAGAACGAAGTA  1110

Query  775  ATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCA  848
            ||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  ATTCGAGAAAGAAGCGAGAAGAGCGTGGAGATAACAAAACAGGACACCAAGGTTGAACTGGAGACTTATAAGCA  1184

Query  849  AACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGG  922
            .||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..|||
Sbjct 1185  GACCCGGCAGGGCCTGGATGAAATGTACAGCGATGTGTGGAAACAGCTGAAGGAGGAGAAGAAAGTCCGACTGG  1258

Query  923  AACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAG  996
            ||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1259  AACTGGAAAAGGAGCTGGAGTTGCAGATTGGAATGAAGACGGAGATGGAGATCGCCATGAAGTTGCTGGAGAAG  1332

Query  997  GACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACA  1070
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  GACACCCATGAGAAGCAAGACACGCTCGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAGGAAGTCAAAGCTATTAACTTACA  1406

Query 1071  GATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAA  1144
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1407  GATGTTTCACAAAGTTCAGAGTGCAGAGAGCAGTTTACAGCAGAAGAATGAAGCCATCGCATCTTTTGAAGGAA  1480

Query 1145  AAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGA  1218
            ||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||..||||.|||||.|||||||..
Sbjct 1481  AAACCACTCAGGTGATGTCCAGCATGAAGCAAATGGAGGAAAGGTTACAGCAGGCGGAACGGGCCAGGCAGGCG  1554

Query 1219  GCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCA  1292
            ||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||..|.|.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1555  GCAGAAGAGCGAAGCCACAAGTTGCAGCAGGAGCTCAGCGGGAGGGGCAGTGCCCTGCAGCTCCAGCTGTCCCA  1628

Query 1293  GCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCG  1366
            |||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct 1629  GCTGCGGGACCAATGCTCAGGTCTAGAGAAAGAACTGAAGTCAGAAAAAGAACAAAGACAAGCTCTCCAGAGAG  1702

Query 1367  AATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAG  1440
            ||.||||||..|||||||||||.||.|.|||.|||..||.|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AACTACAGCGTGAGAAAGACACCTCTTGTCTGCTCCAGACGGAGCTGCAGCAAGTGGAAGGCCTGAAGAAGGAG  1776

Query 1441  TTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAAT  1514
            .||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|.||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGCGGGAGCTCCAAGACGAGAAGGCAGAGTTACGGAAGGTCTGTGAGGAGCAGGAGCAAGCCCTCCAGGAAAT  1850

Query 1515  GGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACG  1588
            |||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||.
Sbjct 1851  GGGACTACACCTTAGCCAGTCCAAACTGAAGATGGAAGACATAAAGGAAGTAAATAAGGCACTGAAGGGCCACA  1924

Query 1589  CCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCAC  1662
            |.|||.|||||||||||||.||.|||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1925  CATGGTTGAAAGATGACGAGGCAACACATTGTAAGCAGTGTGAGAAGGACTTCTCCATTTCTCGGAGGAAGCAC  1998

Query 1663  CACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAA  1736
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1999  CACTGCCGAAACTGTGGCCACATTTTCTGCAACACCTGCTCTAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCTAA  2072

Query 1737  GCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  1800
            |||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2073  GCCAGTGCGTGTGTGTGACAGCTGCCATACCCTGCTACTGCAGCGCTGCTCCTCCACTGCCTCC  2136