Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09020
• Subject: XM_006532841.3
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1589
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGATGGAGGAGCGTGC  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAATGCGACTTGTCTACGAACCCCGGATATCCTCCCGCTACTTCCAAAGGCCAGATGATGGAGGAGCGTGC  74

Query   18  CAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGG  91
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct   75  CAACCTAATGCACATGATGAAACTCAGCATTAAGGTCTTACTCCAGTCTGCCCTTAGCCTGGGACGCAGTCTGG  148

Query   92  ATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAG  165
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  ATGCAGACTATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCATTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTCAAG  222

Query  166  AAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATC  239
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  AAGAGTTTCATTGGCCAAAATAAGTCTTTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAAAAACTTTGTCCTGAAGCATC  296

Query  240  AGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATC  313
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AGATATAGCTACCAGTGTCAGGAATCTTCCAGAACTAAAGACAGCCGTGGGAAGAGGCAGAGCGTGGCTTTATC  370

Query  314  TTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTC  387
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||||||
Sbjct  371  TTGCTCTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTCCTCATAGACAACAAGCAGCTCCTAAGTGAGTTC  444

Query  388  TATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCT  461
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TATGAGCCCGAGGCCTTAATGATGGAGGAGGAAGGAATGGTGATCGTGGGTCTGCTGGTGGGACTCAACGTTCT  518

Query  462  CGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTA  535
            .||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||..||.|
Sbjct  519  GGATGCCAACCTCTGCTTAAAGGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTCGGGGTGATTGACTTCTCTCTCTGTCTGA  592

Query  536  AGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTG  609
            ||||.|..|||||||||||..|.||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGACGCACAGGATCTTGACAGCGGCAGAGAGCATGAAAGAATTACCGATGTCCTTGATCAGAAAAATTACGTG  666

Query  610  GAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAA  683
            ||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAGGAACTTAACCGGCACCTAAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAGACGAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACGAA  740

Query  684  CTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAA  757
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||.||||||.|.|
Sbjct  741  CTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGTTCCCTACAAAAAGAACAACAGCAGCTGA  814

Query  758  GAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAG  831
            |||||||.||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  815  GAGAACAGAACGAAGTAATTCGAGAAAGAAGCGAGAAGAGCGTGGAGATAACAAAACAGGACACCAAGGTTGAA  888

Query  832  CTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGA  905
            |||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  889  CTGGAGACTTATAAGCAGACCCGGCAGGGCCTGGATGAAATGTACAGCGATGTGTGGAAACAGCTGAAGGAGGA  962

Query  906  GAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAA  979
            ||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.|
Sbjct  963  GAAGAAAGTCCGACTGGAACTGGAAAAGGAGCTGGAGTTGCAGATTGGAATGAAGACGGAGATGGAGATCGCCA  1036

Query  980  TGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTC  1053
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  TGAAGTTGCTGGAGAAGGACACCCATGAGAAGCAAGACACGCTCGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAGGAAGTC  1110

Query 1054  AAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCAT  1127
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTATTAACTTACAGATGTTTCACAAAGTTCAGAGTGCAGAGAGCAGTTTACAGCAGAAGAATGAAGCCAT  1184

Query 1128  CACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGG  1201
            |.||||.||||||||||||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct 1185  CGCATCTTTTGAAGGAAAAACCACTCAGGTGATGTCCAGCATGAAGCAAATGGAGGAAAGGTTACAGCAGGCGG  1258

Query 1202  AGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTG  1275
            |.|||||.|||||||..||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||..|.|.||||||
Sbjct 1259  AACGGGCCAGGCAGGCGGCAGAAGAGCGAAGCCACAAGTTGCAGCAGGAGCTCAGCGGGAGGGGCAGTGCCCTG  1332

Query 1276  CAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAG  1349
            |||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CAGCTCCAGCTGTCCCAGCTGCGGGACCAATGCTCAGGTCTAGAGAAAGAACTGAAGTCAGAAAAAGAACAAAG  1406

Query 1350  ACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGG  1423
            |||.|||||.|||.|.|||.||||||..|||||||||||.||.|.|||.|||..||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1407  ACAAGCTCTCCAGAGAGAACTACAGCGTGAGAAAGACACCTCTTGTCTGCTCCAGACGGAGCTGCAGCAAGTGG  1480

Query 1424  AAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAA  1497
            ||||.|||||.||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|.||||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  AAGGCCTGAAGAAGGAGCTGCGGGAGCTCCAAGACGAGAAGGCAGAGTTACGGAAGGTCTGTGAGGAGCAGGAG  1554

Query 1498  CAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCA  1571
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..|
Sbjct 1555  CAAGCCCTCCAGGAAATGGGACTACACCTTAGCCAGTCCAAACTGAAGATGGAAGACATAAAGGAAGTAAATAA  1628

Query 1572  GGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCA  1645
            ||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||.||.|||||.||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  GGCACTGAAGGGCCACACATGGTTGAAAGATGACGAGGCAACACATTGTAAGCAGTGTGAGAAGGACTTCTCCA  1702

Query 1646  TTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCC  1719
            ||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTCTCGGAGGAAGCACCACTGCCGAAACTGTGGCCACATTTTCTGCAACACCTGCTCTAGCAACGAGCTGGCC  1776

Query 1720  CTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCAC  1793
            ||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGCCCTCCTACCCTAAGCCAGTGCGTGTGTGTGACAGCTGCCATACCCTGCTACTGCAGCGCTGCTCCTCCAC  1850

Query 1794  GGCCTCC  1800
            .||||||
Sbjct 1851  TGCCTCC  1857