Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09020
- Subject:
- XM_017009891.1
- Aligned Length:
- 1800
- Identities:
- 1733
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG 74
Query 75 CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC 148
Query 149 ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA 222
Query 223 CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG 296
Query 297 CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC 370
Query 371 ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG 444
Query 445 GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA 518
Query 519 TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGA-------------------------- 566
Query 593 ATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 ----------------------------------------CTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT 600
Query 667 GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA 674
Query 741 AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC 748
Query 815 AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG 822
Query 889 AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC 896
Query 963 CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC 970
Query 1037 AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG 1044
Query 1111 CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA 1118
Query 1185 AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG 1192
Query 1259 GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA 1266
Query 1333 TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT 1340
Query 1407 GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA 1414
Query 1481 TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT 1488
Query 1555 ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG 1562
Query 1629 TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT 1636
Query 1703 CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG 1710
Query 1777 CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1800
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1734