Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09030
• Subject: NM_001199245.1
• Aligned Length: 775
• Identities: 604
• Gaps: 101

Alignment

Query   1  ATGAATGTGCGGAGGGTGGAAAGCATTTCGGCTCAGCTGGAGGAGGCCAGCTCTACAGGCGGTTTCCTGTACGC  74
                                                      |.||...|||||.||..||..||  |.|   
Sbjct   1  -------------------------------------------ATGCTGACTCTAGAGTGGGAGTC--GGA---  26

Query  75  TCAGAACAGCACCAAGCGCAG-------------CATTA-AAGAGCGGCTCATGAAGCTCTTGCCCTGC-TCA-  132
             ||.||.|||  ||   |||             .|||| |.|.|||.||| |||||        |||| ||| 
Sbjct  27  --AGGACTGCA--AA---CAGTGGGTATTGTTGTGATTATATGTGCGTCTC-TGAAG--------CTGCTTCAT  84

Query 133  --GCTGCCAAAACGTCGTCTCCTGCT--ATT-----CAAAACAGCGTGGAAGATGAACTGGAGATGGCCACCGT  197
             ||||..|            |||.|  |||     .||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  85  TTGCTGGGA------------CTGATTGATTTTTCGGAAGACAGCGTGGAAGATGAGCTGGAGATGGCTACTGT  146

Query 198  CAGGCATCGGCCCGAAGCCCTTGAGCTTCTGGAAGCCCAGAGCAAATTTACCAAGAAAGAGCTTCAGATCCTTT  271
           ||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 147  CAGGCATCGGCCTGAAGCCCTGGAGCTGCTGGAGGCCCAGAGCAAATTCACCAAGAAAGAGCTTCAGATTCTTT  220

Query 272  ACAGAGGATTTAAGAACGAATGCCCCAGTGGTGTTGTTAATGAAGAAACCTTCAAAGAGATTTACTCGCAGTTC  345
           ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 221  ACAGAGGATTTAAGAATGAATGCCCCAGTGGTGTTGTTAATGAAGAAACTTTCAAGGAGATTTACTCACAGTTC  294

Query 346  TTTCCACAGGGAGACTCTACAACATATGCACATTTTCTGTTCAATGCATTTGATACAGACCACAATGGAGCTGT  419
           |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 295  TTTCCACAGGGAGACTCCACCACATATGCACATTTTCTCTTCAATGCATTCGACACGGACCACAATGGAGCTGT  368

Query 420  GAGTTTCGAGGATTTCATCAAAGGTCTTTCCATTTTGCTCCGGGGGACAGTACAAGAAAAACTCAATTGGGCAT  493
           |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 369  GAGCTTTGAGGATTTCATCAAAGGTCTTTCCATTTTGCTTCGAGGGACAGTACAAGAAAAACTCAACTGGGCAT  442

Query 494  TTAATCTGTATGACATAAATAAAGATGGCTACATCACTAAAGAGGAAATGCTTGATATAATGAAAGCAATATAC  567
           |||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 443  TTAATTTGTATGACATAAACAAAGATGGCTACATCACTAAAGAAGAAATGCTGGACATAATGAAAGCAATCTAC  516

Query 568  GATATGATGGGTAAATGTACATATCCTGTCCTCAAAGAAGATGCTCCCAGACAACACGTTGAAACATTTTTTCA  641
           ||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 517  GACATGATGGGGAAATGCACATACCCGGTCCTCAAGGAAGATGCTCCCCGACAGCATGTGGAGACGTTCTTCCA  590

Query 642  GAAAATGGACAAAAATAAAGATGGGGTTGTTACCATAGATGAGTTCATTGAAAGCTGCCAAAAAGATGAAAACA  715
           |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 591  GAAGATGGACAAAAATAAAGATGGTGTCGTTACCATAGATGAGTTCATTGAAAGTTGCCAAAAAGATGAAAACA  664

Query 716  TAATGCGCTCCATGCAGCTCTTTGAAAATGTGATT  750
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 665  TAATGCGCTCCATGCAGCTCTTTGAAAATGTGATC  699