Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09043
• Subject: NM_001321278.2
• Aligned Length: 1567
• Identities: 1366
• Gaps: 191

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGCTGTTTTCCATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAAT  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAAGCAGTTTTCCATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAAT  74

Query   75  CCCTTTTGGTCAGGACCATGGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTTTTGGTCAGGACCATGGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGA  148

Query  149  TTGTGAGGAATGCGGAGGACATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTGAGGAATGCGGAGGACATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGC  222

Query  223  CGTCCAAGCTTCACAATTTCAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCCAAGCTTCACAATTTCAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCAT  296

Query  297  CACATCAAAGAGGTATCAGCATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACATCAAAGAGGTATCAGCATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTA  370

Query  371  CAGTGCGCAGAATCCTCAAGGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGCGCAGAATCCTCAAGGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAA  444

Query  445  GTGCATGACAAGCTTAACTCTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCATGACAAGCTTAACTCTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGT  518

Query  519  AAACGGGGACTCTGGAAAGTCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACGGGGACTCTGGAAAGTCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTG  592

Query  593  GCTGCCACCCAACAACAGAGAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTGCCACCCAACAACAGAGAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGC  666

Query  667  TGCAAACAAGATGCTCTCATCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCAAACAAGATGCTCTCATCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCA  740

Query  741  TCCTGGGGACAGAGGGCCTGACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTGGGGACAGAGGGCCTGACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGG  814

Query  815  CTGCCCCAAATGAGGAATTGGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCCCCAAATGAGGAATTGGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTAT  888

Query  889  TTGCAACTCAGCCTAGAAGAGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGCAACTCAGCCTAGAAGAGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGA  962

Query  963  GCCTTTAACGATAGTGAAGCTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCTTTAACGATAGTGAAGCTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCT  1036

Query 1037  ACCATTACTTTCGAAGCAAGGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCATTACTTTCGAAGCAAGGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGG  1110

Query 1111  AAAGGCCCTCCATTTTACCATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGGCCCTCCATTTTACCATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCT  1184

Query 1185  CCGCAGGCCTCTCAGTTGGAAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCAGGCCTCTCAGTTGGAAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGC  1258

Query 1259  TGTGCTATTTGATTAAACCCTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTGCTATTTGATTAAACCCTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAA  1332

Query 1333  GTTCAGGAGGTGATTCTGAGTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAA----GACGATCTT-------  1395
            ||||||        |||...||      |.||.|  |.||...|||||  ||||    | |||||||       
Sbjct 1333  GTTCAG--------TCTCGCTC------TGTCGT--CCAGGCTGGAGT--CCAATGCTG-CGATCTTGGATCAC  1387

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1388  TGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTTAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCA  1461

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1462  CCACCACACACGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAAC  1535

Query 1396  -------------  1395
                         
Sbjct 1536  TCCTGACCTCAAG  1548