Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09071
• Subject: NR_045104.2
• Aligned Length: 2283
• Identities: 1552
• Gaps: 729

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGACGGACTGTGTCCGGCGATGGGCACGGGCATTTCTTCGTTTATAGCTGTCTGTTTGCATTCTGATTGG  74

Query    1  ----------------------ATGCCGACAGTGGGGGTAATGGATGTATCCCTTTCCATGACCCGACCTGTGT  52
                                  |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACACTGGGATCATTTTCATCATGCCGACAGTGGTGGTAATGGATGTATCCCTTTCCATGACCCGACCTGTGT  148

Query   53  CTATTGAGGGGTCCGAGGAATACCAGCGTAAGCACCTAGCAGCCCATGGTTTAACGATGCTGTTTGAGCACATG  126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTATTGAGGGGTCCGAGGAATACCAGCGTAAGCACCTAGCAGCCCATGGTTTAACGATGCTGTTTGAGCACATG  222

Query  127  GCCACAAATTACAAGCTTGAATTTACAGCACTTGTGGTTTTTTCATCACTTTGGGAGTTGATGGTCCCCTTCAC  200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCACAAATTACAAGCTTGAATTTACAGCACTTGTGGTTTTTTCATCACTTTGGGAGTTGATGGTCCCCTTCAC  296

Query  201  GAGAGATTATAATACCCTACAGGAAGCACTAAGTAATATGGATGATTATGACAAAACCTGCTTGGAGTCTGCAT  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGAGATTATAATACCCTACAGGAAGCACTAAGTAATATGGATGATTATGACAAAACCTGCTTGGAGTCTGCAT  370

Query  275  TAGTTGGTGTTTGCAATATCGTTCAGCAAGAATGGGGTGGTGCAATTCCTTGCCAGGTTGTCCTGGTGACAGAC  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGTTGGTGTTTGCAATATCGTTCAGCAAGAATGGGGTGGTGCAATTCCTTGCCAGGTTGTCCTGGTGACAGAC  444

Query  349  GGCTGTCTTGGCATTGGTAGAGGGTCACTGCGACATTCCCTAGCCACTCAAAATCAACGAAGTGAGAGCAACAG  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTGTCTTGGCATTGGTAGAGGGTCACTGCGACATTCCCTAGCCACTCAAAATCAACGAAGTGAGAGCAACAG  518

Query  423  GTTTCCACTACCTTTTCCTTTCCCATCTAAGTTATATATCATGTGCATGGCGAATTTGGAGGAGCTCCAGAGCA  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTCCACTACCTTTTCCTTTCCCATCTAAGTTATATATCATGTGCATGGCGAATTTGGAGGAGCTCCAGAGCA  592

Query  497  CCGATTCCTTGGAATGCCTTGAACGTCTCATAGATTTAAACAATGGTGAAGGGCAGATTTTTACTATTGATGGC  570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGATTCCTTGGAATGCCTTGAACGTCTCATAGATTTAAACAATGGTGAAGGGCAGATTTTTACTATTGATGGC  666

Query  571  CCCCTGTGCTTGAAGAATGTACAGTCTATGTTTGGAAAACTGATAGATTTGGCATATACGCCTTTCCATGCTGT  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCCTGTGCTTGAAGAATGTACAGTCTATGTTTGGAAAACTGATAGATTTGGCATATACGCCTTTCCATGCTGT  740

Query  645  TCTCAAGTGTGGCCACCTAACTGCTGATGTACAAGTCTTCCCCAGGCCAGAACCTTTTGTTGTAGATGAAGAAA  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTCAAGTGTGGCCACCTAACTGCTGATGTACAAGTCTTCCCCAGGCCAGAACCTTTTGTTGTAGATGAAGAAA  814

Query  719  TTGATCCTATCCCTAAAGTCATTAACACAGATTTGGAAATAGTGGGATTTATTGATATAGCTGATATTTCAAGT  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGATCCTATCCCTAAAGTCATTAACACAGATTTGGAAATAGTGGGATTTATTGATATAGCTGATATTTCAAGT  888

Query  793  CCCCCAGTTCTGTCCAGACATCTGGTCTTACCTATAGCACTTAACAAAGAAGGTGATGAGGTGGGTACTGGCAT  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCCCAGTTCTGTCCAGACATCTGGTCTTACCTATAGCACTTAACAAAGAAGGTGATGAGGTGGGTACTGGCAT  962

Query  867  CACTGATGACAATGAAGATGAAAATTCAGCCAATCAGATTGCAGGCAAAATACCCAACTTTTGTGTCCTGCTCC  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACTGATGACAATGAAGATGAAAATTCAGCCAATCAGATTGCAGGCAAAATACCCAACTTTTGTGTCCTGCTCC  1036

Query  941  ATGGTAGCCTAAAAGTGGAAGGAATGGTAGCGATTGTTCAATTAGGTCCTGAATGGCATGGAATGCTCTACTCC  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGTAGCCTAAAAGTGGAAGGAATGGTAGCGATTGTTCAATTAGGTCCTGAATGGCATGGAATGCTCTACTCC  1110

Query 1015  CAAGCTGACAGCAAGAAGAAATCAAACCTCATGATGTCTCTCTTTGAGCCTGGCCCAGAACCTCTCCCATGGCT  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAAGCTGACAGCAAGAAGAAATCAAACCTCATGATGTCTCTCTTTGAGCCTGGCCCAGAACCTCTCCCATGGCT  1184

Query 1089  AGGGAAAATGGCACAGTTGGGTCCTATTTCAGATGCTAAAGAAAACCCTTATGGCGAGGATGACAATAAGAGTC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGGAAAATGGCACAGTTGGGTCCTATTTCAGATGCTAAAGAAAACCCTTATGGCGAGGATGACAATAAGAGTC  1258

Query 1163  CATTCCCCCTGCAGCCCAAAAACAAACGCAGTTATGCCCAGAATGTGACTGTCTGGATCAAACCCAGCGGCCTA  1236
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  CATTCCCCCTGCAGCCCAAAAACAAACGCAGTTATGCCCAGAATGTGACTGTCTGGATCAAACCCAGCGGCCTG  1332

Query 1237  CAGACAGATGTACAGAAGATTTTAAGAAATGCAAGGAAACTACCTGAAAAAACACAGACATTCTATAAGGAGCT  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGACAGATGTACAGAAGATTTTAAGAAATGCAAGGAAACTACCTGAAAAAACACAGACATTCTATAAGGAGCT  1406

Query 1311  GAACCGTTTGCGAAAGGCCGCTCTAGCCTTTGGTTTCCTGGACCTGCTGAAAGGGGTGGCTGACATGCTGGAAA  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAACCGTTTGCGAAAGGCCGCTCTAGCCTTTGGTTTCCTGGACCTGCTGAAAGGGGTGGCTGACATGCTGGAAA  1480

Query 1385  GGGAATGCACACTGCTGCCTGAGACAGCCCACCCTGATGCTGCATTCCAGCTGACCCATGCTGCCCAGCAGCTC  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGAATGCACACTGCTGCCTGAGACAGCCCACCCTGATGCTGCATTCCAGCTGACCCATGCTGCCCAGCAGCTC  1554

Query 1459  AAGCTGGCCAGTACCGGCACCTCTGAGTATGCCGCTTATGACCAGAACATCACACCTTTGCACACGGACTTCTC  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGCTGGCCAGTACCGGCACCTCTGAGTATGCCGCTTATGACCAGAACATCACACCTTTGCACACGGACTTCTC  1628

Query 1533  TGGGAGCAGCACTGAAAGAATT----------------------------------------------------  1554
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 1629  TGGGAGCAGCACTGAAAGAATTTGAAACTGACTTTTGGAGCTTTCCTTCTTTTTTCATTTCAACTGAAAATGCT  1702

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 1703  TTAGGTAAAAACCTTTCCAGTATGTTCACCTCTAGAATAGCCACCCAAAGACCTTCCTGAGGCTGCCTCAGAAG  1776

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 1777  CACCACTTGCTGTTTTGAATGACTCTACTAGTATGAGAAGGATGTGAAGGTGGTTGGCTGGTTGGGCTTTAACT  1850

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 1851  TCCTGGGATTCATAATTTTTAAGCTTGGAAGATAGCTGCTGTTCCCATGATGGGCACATTTCCTGAGAAGCTTG  1924

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 1925  AATGACTGATGAGCATAGAGCACCCCTGCCTTCCTCAGGAAACCTGACCGGCAGGGGCTCTCTGGCTTCCTGAA  1998

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 1999  AGCTTCACCTCTTCCCTCGTTTATATCTCAACTGTAAGGGCATTTTCAAGCTTCTGTTCATGGAATGAGCAACT  2072

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 2073  CAGACTGTCTGGAGCTTGCTGAGTACAAACACACCACCACTAAGTTTCAGAACTTTCCTTAGAACTTGGGCAAA  2146

Query 1555  --------------------------------------------------------------------------  1554
                                                                                      
Sbjct 2147  ATGTGGTGGTAACTCTTAAGTGCTTTTGGTATCTCTTGAGATTCTAACTTTTAAAGAGCAACCATTAATGTGTA  2220

Query 1555  ---------------------------------------------------------------  1554
                                                                           
Sbjct 2221  AAATGATTCCTATTATTCAAGGTTTTTTTTTAATGAAAATAAAATATTTGATTTTCTAGAAAA  2283