Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09099
Subject:
NM_001349802.3
Aligned Length:
626
Identities:
535
Gaps:
76

Alignment

Query   1  MFVPRSLKIKRNANDDGKSCVAKIIKPDPEDLQLDKSRDVPVDAVATEAATIDRHISESCPFPSPGGQLAEVHS  74
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Sbjct   1  MFVPRSLKIKRNANDDGKSCVAKIIKPDPEDLQLDKSRDVPVDAVATEAATIDRHISESCPFPSPGGQLAEVHS  74

Query  75  VSPEQGAKDSHPSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPICVVCGRYGEYICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKL  148
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Sbjct  75  VSPEQGAKDSHPSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPICVVCGRYGEYICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKL  148

Query 149  SNPQKADSEPESPLNASYVYKEHPFILNLQEDQIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SNPQKADSEPESPLNASYVYKEHPFILNLQEDQIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSG  222

Query 223  YEVPTPIQMQMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRALFESKTPSALILTPTRELAIQIERQAKELMS  296
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Sbjct 223  YEVPTPIQMQMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRALFESKTPSALILTPTRELAIQIERQAKELMS  296

Query 297  GLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCGVKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDI  370
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Sbjct 297  GLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCGVKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDI  370

Query 371  LENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRIITGEKNLPCANVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFK  444
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Sbjct 371  LENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRIITGEKNLPCANVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFK  444

Query 445  PPVLVFVDCKLGADLLSEAVQKITGLKRISIHSEKSQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVV  518
           |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  PPVLVFVDCKLGADLLSEAVQKITGLKSISIHSEKSQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVV  518

Query 519  NFDMPSSMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNN-------SKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQK  585
           ||||||||||||||     ....|......||..       ..|                              
Sbjct 519  NFDMPSSMDEYVHQ-----STHHNQYEVYSINRGMVQEVTCHPR------------------------------  557

Query 586  RKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK  619
                                             
Sbjct 558  ----------------------------------  557