Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09099
- Subject:
- NM_001349804.1
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1322
- Gaps:
- 534
Alignment
Query 1 ATGTTTGTTCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTGTTCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAAT 74
Query 75 TAAACCAGACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAACCAGACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAG 148
Query 149 CCACAATAGACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCACAATAGACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCA 222
Query 223 GTAAGTCCCGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTAAGTCCCGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCG 296
Query 297 CTGGGCAGAACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGGGCAGAACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATG 370
Query 371 AAGATGTGTGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGATGTGTGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTC 444
Query 445 AGCAATCCACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCAATCCACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTT 518
Query 519 TATTTTGAACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATTTTGAACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAG 592
Query 593 TCACCAGGCCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCGGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TCACCAGGCCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCAGGC 666
Query 667 TATGAGGTGCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAGGTGCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGC 740
Query 741 AGATACTGGCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGATACTGGCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTC 814
Query 815 CATCTGCGCTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATCTGCGCTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGT 888
Query 889 GGCCTGCCACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCCTGCCACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACA 962
Query 963 ACATGTTAAGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACATGTTAAGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTG 1036
Query 1037 GTGTAAAGATTGTGGTAGTAGATGAAGCTGATACCATGTTAAAGATGGGTTTTCAACAACAAGTGCTTGACATT 1110
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGTAAAGATTGTGGTAGTAGATGAA------------------------------------------------ 1062
Query 1111 TTGGAAAACATTCCTAATGATTGTCAGACCATTTTGGTTTCAGCCACAATTCCAACTAGCATAGAACAGCTAGC 1184
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1185 AAGCCAGCTTCTGCATAATCCTGTGAGAATTATCACTGGAGAAAAGAACCTACCTTGTGCCAATGTACGTCAGA 1258
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1259 TTATTTTGTGGGTAGAAGACCCAGCCAAAAAGAAAAAATTATTTGAAATTTTAAATGATAAGAAACTCTTTAAG 1332
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1333 CCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTTTGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGG 1406
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1407 GCTGAAAAGAATATCTATACATTCGGAGAAGTCGCAAATAGAAAGGAAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAG 1480
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1481 GAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCTAGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTC 1554
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1555 AATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGATTGGAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 ------------------------------------------ATTGGAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGG 1094
Query 1629 AACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGGGATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 AACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGGGATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAG 1168
Query 1703 GATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGACCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 GATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGACCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGAT 1242
Query 1777 AAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATATTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 AAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATATTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTC 1316
Query 1851 TCAGAAA 1857
|||||||
Sbjct 1317 TCAGAAA 1323
