Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09109
- Subject:
- XM_011545295.2
- Aligned Length:
- 2001
- Identities:
- 1448
- Gaps:
- 552
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGATGAAGACAGCCTCCGGGGACTACATCGACTCGTCATGGGAGCTGCGGGTGTTTGTGGGAGAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACCCAGAGGCCGAGTCGGTCACCCTGCGGGTCACTGGGGAGTCGCACATCGGCGGGGTGCTCCTGAAGATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGAGCAGATCAATCGCAAGCAGGACTGGTCAGACCATGCTATTTGGTGGGAACAGAAGAGGCAGTGGCTGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGACCCACTGGACACTGGACAAGTACGGGATCCTGGCCGACGCACGCCTCTTCTTTGGGCCCCAGCACCGGCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CGTCATCCTTCGGTTGCCCAACCGCCGCGCACTGCGCCTCCGTGCCAGCTTCTCCCAGCCCCTCTTCCAGGCTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGCTGCCATCTGCCGCCTCCTCAGCATCCGGCACCCCGAGGAGCTGTCCCTGCTCCGGGCTCCTGAGAAGAAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAGAAGAAGAAGAAAGAGAAGGAGCCAGAGGAAGAGCTCTATGACTTGAGCAAGGTTGTCTTGGCTGGGGGCGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GGCACCTGCACTGTTCCGGGGGATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC 52
Query 593 TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG 126
Query 667 ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCTGGGGACGCACT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 127 ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCCGGGGACGCACT 200
Query 741 CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT 274
Query 815 ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC 348
Query 889 CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA 422
Query 963 CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC 496
Query 1037 TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTC------------GGCCCCGGAAGCTGACCCTG 1098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTCGCATCCCACGAAGGCCCCGGAAGCTGACCCTG 570
Query 1099 AAGGGCTACCGCCAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCC 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AAGGGCTACCGCCAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCC 644
Query 1173 TGGGGACCCCATTCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGT 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 TGGGGACCCCATTCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGT 718
Query 1247 TCTGCATTAAACTCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TCTGCATTAAACTCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAG 792
Query 1321 TATGCCCGCTGGATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGA 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TATGCCCGCTGGATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGA 866
Query 1395 GGTGCAGGCCATCCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCC 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 GGTGCAGGCCATCCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCC 940
Query 1469 CTGATGCCTCTGCCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAG 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CTGATGCCTCTGCCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAG 1014
Query 1543 CAGCTCACCCCACGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CAGCTCACCCCACGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTT 1088
Query 1617 CATCCAGGCCTGGCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAG 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 CATCCAGGCCTGGCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAG 1162
Query 1691 ACGAGATCCTGGGCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGG 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 ACGAGATCCTGGGCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGG 1236
Query 1765 CGTTTCAGCAACATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACAT 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CGTTTCAGCAACATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACAT 1310
Query 1839 CAATGTGGCCTTCAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGT 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CAATGTGGCCTTCAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGT 1384
Query 1913 CGACGCGGGAGCGGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCC 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 CGACGCGGGAGCGGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCC 1458
Query 1987 TTC 1989
|||
Sbjct 1459 TTC 1461