Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09109
• Subject: XM_017018399.1
• Aligned Length: 1989
• Identities: 1448
• Gaps: 540

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGATGAAGACAGCCTCCGGGGACTACATCGACTCGTCATGGGAGCTGCGGGTGTTTGTGGGAGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCCAGAGGCCGAGTCGGTCACCCTGCGGGTCACTGGGGAGTCGCACATCGGCGGGGTGCTCCTGAAGATTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGAGCAGATCAATCGCAAGCAGGACTGGTCAGACCATGCTATTTGGTGGGAACAGAAGAGGCAGTGGCTGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGACCCACTGGACACTGGACAAGTACGGGATCCTGGCCGACGCACGCCTCTTCTTTGGGCCCCAGCACCGGCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CGTCATCCTTCGGTTGCCCAACCGCCGCGCACTGCGCCTCCGTGCCAGCTTCTCCCAGCCCCTCTTCCAGGCTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TGGCTGCCATCTGCCGCCTCCTCAGCATCCGGCACCCCGAGGAGCTGTCCCTGCTCCGGGCTCCTGAGAAGAAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAGAAGAAGAAGAAAGAGAAGGAGCCAGAGGAAGAGCTCTATGACTTGAGCAAGGTTGTCTTGGCTGGGGGCGT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GGCACCTGCACTGTTCCGGGGGATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC  592
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC  52

Query  593  TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG  126

Query  667  ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCTGGGGACGCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  127  ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCCGGGGACGCACT  200

Query  741  CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT  274

Query  815  ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC  348

Query  889  CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA  422

Query  963  CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC  496

Query 1037  TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTCGGCCCCGGAAGCTGACCCTGAAGGGCTACCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTCGGCCCCGGAAGCTGACCCTGAAGGGCTACCGC  570

Query 1111  CAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCCTGGGGACCCCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  CAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCCTGGGGACCCCAT  644

Query 1185  TCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGTTCTGCATTAAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  TCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGTTCTGCATTAAAC  718

Query 1259  TCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAGTATGCCCGCTGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  TCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAGTATGCCCGCTGG  792

Query 1333  ATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGAGGTGCAGGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  ATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGAGGTGCAGGCCAT  866

Query 1407  CCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCCCTGATGCCTCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCCCTGATGCCTCTG  940

Query 1481  CCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAGCAGCTCACCCCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  CCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAGCAGCTCACCCCA  1014

Query 1555  CGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTTCATCCAGGCCTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTTCATCCAGGCCTG  1088

Query 1629  GCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAGACGAGATCCTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAGACGAGATCCTGG  1162

Query 1703  GCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGGCGTTTCAGCAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  GCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGGCGTTTCAGCAAC  1236

Query 1777  ATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACATCAATGTGGCCTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  ATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACATCAATGTGGCCTT  1310

Query 1851  CAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGTCGACGCGGGAGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGTCGACGCGGGAGC  1384

Query 1925  GGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCCTTC  1989
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  GGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCCTTC  1449