Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09189
• Subject: NM_001318100.2
• Aligned Length: 2007
• Identities: 2004
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCATTGTGCAGACTCTGCCAGTGCCACTGGAGCCTGCTCCTGAAGCTGCCACTGCCCCACAAGCTCCAGT  74
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Sbjct    1  ATGGCCATTGTGCAGACTCTGCCAGTGCCACTGGAGCCTGCTCCTGAAGCTGCCACTGCCCCACAAGCTCCAGT  74

Query   75  CATGGGTAGTGTGAGCAGCCTTATCTCAGGCCGGCCCTGTCCCGGGGGGCCAGCTCCTCCCCGCCACCACGGCC  148
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Sbjct   75  CATGGGTAGTGTGAGCAGCCTTATCTCAGGCCGGCCCTGTCCCGGGGGGCCAGCTCCTCCCCGCCACCACGGCC  148

Query  149  CTCCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGCCTGCTACGGGGTGGCTATGAGGCACAGGAGCCGCTGTGC  222
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Sbjct  149  CTCCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGCCTGCTACGGGGTGGCTATGAGGCACAGGAGCCGCTGTGC  222

Query  223  CCAGCTGTGCCCCCTAGGAAGGCTGTCCCTGTCACCAGCTTCACCTACATCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTC  296
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Sbjct  223  CCAGCTGTGCCCCCTAGGAAGGCTGTCCCTGTCACCAGCTTCACCTACATCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTC  296

Query  297  ACCCCCCAGCCCAAGCAGTGATGTTGAGGATGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAATGCCCACCTCCGCGGCCCAC  370
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Sbjct  297  ACCCCCCAGCCCAAGCAGTGATGTTGAGGATGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAATGCCCACCTCCGCGGCCCAC  370

Query  371  CACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGCTGGAGAAGAACATGGAGAAGATCCTGATCCGCCCAACAGCCTTC  444
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Sbjct  371  CACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGCTGGAGAAGAACATGGAGAAGATCCTGATCCGCCCAACAGCCTTC  444

Query  445  AAGCCAGTGCTGCCCAAACCTCGAGGGGCTCCGTCCCTGCCTAGCTTCATGGGTCCTCGGGCCACCGGGCTGTC  518
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Sbjct  445  AAGCCAGTGCTGCCCAAACCTCGAGGGGCTCCGTCCCTGCCTAGCTTCATGGGTCCTCGGGCCACCGGGCTGTC  518

Query  519  TGGGAGCCAGGGCAGCCTGACGCAGCTGTTTGGGGGCCCTGCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCAG  592
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Sbjct  519  TGGGAGCCAGGGCAGCCTGACGCAGCTGTTTGGGGGCCCTGCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCAG  592

Query  593  CTGCTGACAAACCCCTGGCATTTAGTGGCTGGGCCAGTGGCTGCCCATCAGGGACGCTATCCGACTCTGGCCGA  666
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Sbjct  593  CTGCTGACAAACCCCTGGCATTTAGTGGCTGGGCCAGTGGCTGCCCATCAGGGACGCTATCCGACTCTGGCCGA  666

Query  667  AACTCACTGTCCAGCCTGCCCACCTACAGCACCGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAGCTCCCCAGGCGGGCACCT  740
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Sbjct  667  AACTCACTGTCCAGCCTGCCCACCTACAGCACCGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAGCTCCCCAGGCGGGCACCT  740

Query  741  GCCTTCCCATGGCTCTGGGCGAGGGGCACTGCCTGGGCCAGCCCGAGGGGTCCCTACTGGGCCCTCCCACTCAG  814
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Sbjct  741  GCCTTCCCATGGCTCTGGGCGAGGGGCACTGCCTGGGCCAGCCCGAGGGGTCCCTACTGGGCCCTCCCACTCAG  814

Query  815  ACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAGAGCACAGGCTCCCTAGGGGGCCGTTTGGCTGGGGGGCTTTTGGGCAGT  888
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Sbjct  815  ACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAGAGCACAGGCTCCCTAGGGGGCCGTGTGGCTGGGGGGCTTTTGGGCAGT  888

Query  889  GGTACTCGGGCCTCCCCTGACAGCAGCTCCTGTGGGGAGCGCTCACCACCACCCCCGCCTCCACCTCCTTCGGA  962
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Sbjct  889  GGTACTCGGGCCTCCCCTGACAGCAGCTCCTGTGGGGAGCGCTCACCACCACCCCCGCCTCCACCTCCTTCGGA  962

Query  963  TGAGGCCCTGCTGCACTGTGTCCTGGAAGGAAAGCTCCGAGACCGGGAGGCAGAGCTTCAGCAGCTGCGGGACA  1036
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Sbjct  963  TGAGGCCCTGCTGCACTGTGTCCTGGAAGGAAAGCTCCGAGACCGGGAGGCAGAGCTTCAGCAGCTGCGGGACA  1036

Query 1037  GTCTGGACGAGAATGAGGCTACCATGTGCCAGGCATACGAGGAGCGGCAGCGGCACTGGCAGCGAGAGCGTGAG  1110
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Sbjct 1037  GTCTGGACGAGAATGAGGCTACCATGTGCCAGGCATACGAGGAGCGGCAGCGGCACTGGCAGCGAGAGCGTGAG  1110

Query 1111  GCCCTGCGAGAGGACTGTGCGGCCCAGGCACAGCGGGCACAGCGGGCCCAACAGCTGCTGCAGCTGCAGGTGTT  1184
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Sbjct 1111  GCCCTGCGAGAGGACTGTGCGGCCCAGGCACAGCGGGCACAGCGGGCCCAACAGCTGCTGCAGCTGCAGGTGTT  1184

Query 1185  CCAGCTGCAGCAGGAGAAGCGGCAATTGCAGGATGACTTCGCACAGCTGCTGCAGGAGCGCGAACAGCTGGAGC  1258
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Sbjct 1185  CCAGCTGCAGCAGGAGAAGCGGCAATTGCAGGACGACTTCGCACAGCTGCTGCAGGAGCGCGAACAGCTGGAGC  1258

Query 1259  GGCGCTGCGCCACCTTGGAGCGGGAGCAGCGGGAGCTCGGGCCGAGGCTTGAGGAGACCAAGTGGGAGGTGTGC  1332
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Sbjct 1259  GGCGCTGCGCCACCTTGGAGCGGGAGCAGCGGGAGCTCGGGCCGAGGCTTGAGGAGACCAAGTGGGAGGTGTGC  1332

Query 1333  CAGAAATCAGGCGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAGCTGAAAGAGTCTCAGGCAGAGCTGGTGCAGAAGGGCAG  1406
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Sbjct 1333  CAGAAATCAGGCGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAGCTGAAAGAGTCTCAGGCAGAGCTGGTGCAGAAGGGCAG  1406

Query 1407  CGAGCTGGTGGCTCTGCGGGTGGCGCTGCGGGAGGCCCGTGCTACGCTGCGGGTCAGTGAGGGCCGTGCGCGGG  1480
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Sbjct 1407  CGAGCTGGTGGCTCTGCGGGTGGCGCTGCGGGAGGCCCGTGCTACGCTGCGGGTCAGTGAGGGCCGTGCGCGGG  1480

Query 1481  GTCTACAGGAGGCCGCCCGAGCTCGGGAGCTGGAGCTGGAAGCCTGTTCCCAGGAGCTGCAGCGACACCGCCAG  1554
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Sbjct 1481  GTCTACAGGAGGCCGCCCGAGCTCGGGAGCTGGAGCTGGAAGCCTGTTCCCAGGAGCTGCAGCGACACCGCCAG  1554

Query 1555  GAAGCTGAGCAGCTGCGGGAGAAAGCTGGGCAGTTGGATGCTGAGGCGGCCGGACTCCGGGAGCCCCCTGTGCC  1628
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Sbjct 1555  GAAGCTGAGCAGCTGCGGGAGAAAGCTGGGCAGTTGGATGCTGAGGCGGCCGGACTCCGGGAGCCCCCTGTGCC  1628

Query 1629  ACCTGCCACCGCTGACCCATTCCTCCTGGCGGAGAGTGATGAGGCCAAAGTGCAGCGGGCAGCAGCCGGGGTTG  1702
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Sbjct 1629  ACCTGCCACCGCTGACCCATTCCTCCTGGCAGAGAGTGATGAGGCCAAAGTGCAGCGGGCAGCAGCCGGGGTTG  1702

Query 1703  GGGGCAGCTTGCGGGCCCAGGTGGAGCGATTGCGGGTGGAGCTGCAGCGGGAGCGGCGGCGGGGTGAGGAGCAG  1776
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Sbjct 1703  GGGGCAGCTTGCGGGCCCAGGTGGAGCGATTGCGGGTGGAGCTGCAGCGGGAGCGGCGGCGGGGTGAGGAGCAG  1776

Query 1777  CGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGAGCAGGTGATCCGCTACCAGAAGCAGCT  1850
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Sbjct 1777  CGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGAGCAGGTGATCCGCTACCAGAAGCAGCT  1850

Query 1851  GCAGCACAACTACATCCAGATGTACCGGCGCAACCGGCAGCTAGAGCAGGAGCTGCAGCAGCTCAGCCTGGAGC  1924
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Sbjct 1851  GCAGCACAACTACATCCAGATGTACCGGCGCAACCGGCAGCTAGAGCAGGAGCTGCAGCAGCTCAGCCTGGAGC  1924

Query 1925  TGGAGGCCCGGGAGCTCGCTGACCTGGGCCTGGCCGAGCAGGCCCCCTGCATCTGCCTGGAGGAGATCACTGCT  1998
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Sbjct 1925  TGGAGGCCCGGGAGCTCGCTGACCTGGGCCTGGCCGAGCAGGCCCCCTGCATCTGCCTGGAGGAGATCACTGCT  1998

Query 1999  ACTGAGATC  2007
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Sbjct 1999  ACTGAGATC  2007