Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09222
• Subject: NM_006001.3
• Aligned Length: 1352
• Identities: 1133
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA  148
            |||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAAACGGGTGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||||||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..|.||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC  666

Query  667  ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTACTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTATACCGTGG  962
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATTAATTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGCGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAATACCACAGCTGTTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGAGCAGAT--AGTGCTGACGGAGAG-  1329
            |||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|..|||  .|||  ||.|..||| 
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTG--GAAGCCGAGG  1330

Query 1330  --GATGAGGGTGAAGAGTAT  1347
              ||.||.||||||||.||.
Sbjct 1331  CTGAAGAAGGTGAAGAATAC  1350