Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09234
• Subject: XM_011243572.1
• Aligned Length: 1125
• Identities: 974
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGGGTCCCAGGTCTCGGTGGAATCGGGAGCTCTGCACGTGGTGATTGTGGGTGGGGGCTTTGGCGGGATCGC  74
            |||||||||||||||||||||||..|.|||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGGGTCCCAGGTCTCGGTGGATACAGGAGCCGTGCACGTGGTGATCGTGGGCGGGGGCTTCGGAGGGATAGC  74

Query   75  AGCAGCCAGCCAGCTGCAGGCCCTGAACGTCCCCTTCATGCTGGTGGACATGAAGGACTCCTTCCACCACAATG  148
            .||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGCCAGCCAGCTGCAGGCGCTGAATGTCCCCTTCATGCTGGTGGATATGAAGGACTCCTTCCACCACAATG  148

Query  149  TGGCTGCTCTCCGAGCCTCCGTGGAGACAGGGTTCGCCAAAAAGACATTCATTTCTTACTCGGTGACTTTCAAG  222
            ||||.||.|||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.||||||
Sbjct  149  TGGCAGCCCTCCGGGCCTCCGTGGAGAGCGGGTTCGCCAAAAAGACATTCATTTCGTACTCTGCGACCTTCAAG  222

Query  223  GACAACTTCCGGCAGGGGCTAGTAGTGGGGATAGACCTGAAGAACCAGATGGTGCTGCTGCAGGGTGGCGAGGC  296
            |||||||||||.|||||...|||..|.||.||||||.|||||||||.|||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GACAACTTCCGCCAGGGCAAAGTGATTGGCATAGACTTGAAGAACCGGATGGTGTTGCTACAGGGTGGCGAGGC  296

Query  297  CCTGCCCTTCTCTCATCTTATCCTGGCCACGGGCAGCACTGGGCCCTTCCCGGGCAAGTTTAATGAGGTTTCCA  370
            |.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.
Sbjct  297  CTTGCCCTTCTCACATCTTATCCTGGCCACAGGCAGCACCGGACCCTTCCCTGGCAAGTTTAACGAGGTGTCCT  370

Query  371  GCCAGCAGGCCGCTATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAGGCAGGTCCAGCGCTCACGGTTCATCGTGGTGGTG  444
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCAGGCAGCCATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAAGCAGATCCAGCGCTCACAATTCATCGTGGTGGTG  444

Query  445  GGAGGAGGCTCGGCTGGAGTGGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACAGAATATCCTGAGAAAGAGGTCACTCTCAT  518
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GGAGGCGGCTCTGCAGGAGTAGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACCGAGTACCCTGAGAAGGAGGTCACTCTTAT  518

Query  519  TCACTCCCAAGTGGCCCTGGCTGACAAGGAGCTCCTGCCCTCCGTCCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC  592
            .||||||..|||..|||||||.||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACTCCAGAGTACCCCTGGCCGACAAGGAACTCCTGCCCTGTGTGCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC  592

Query  593  GGAAGGGCGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAATCTGGAGGAGCTGCCTCTCAATGAGTATCGAGAG  666
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  593  GGAAGGGTGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAACCTGGAGGAACTGCCTCGCAATGAGTATCGGGAG  666

Query  667  TACATCAAAGTGCAGACGGACAAAGGCACAGAGGTGGCCACCAACCTGGTGATTCTCTGCACCGGCATCAAGAT  740
            ||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||..||.||||||||
Sbjct  667  TACATCAAGGTGGAGACAGACAAGGGCACGGAGGTGGCCACCAACATGGTGATTGTGTGCAATGGGATCAAGAT  740

Query  741  CAACAGCTCCGCCTACCGCAAAGCATTT---GAGAGCAGACTAGCCAGCAGTGGTGCTCTGAGAGTGAACGAGC  811
            |||||||||.||||||||||..||||||   |||||.||.||.||.||||.|||||||||||.||||||||||.
Sbjct  741  CAACAGCTCTGCCTACCGCAGTGCATTTGCAGAGAGTAGGCTGGCTAGCAATGGTGCTCTGAAAGTGAACGAGT  814

Query  812  ACCTCCAGGTGGAGGGCCACAGCAACGTCTACGCCATTGGTGACTGTGCCGACGT---GAGGACGCCCAAGATG  882
            .||||||||||||.||..|||||||..|.||.||||||||||||||||||||  |   .|||| ||||||||||
Sbjct  815  TCCTCCAGGTGGAAGGTTACAGCAATATTTATGCCATTGGTGACTGTGCCGA--TACCAAGGA-GCCCAAGATG  885

Query  883  GCCTATCTTGCCGGCCTCCACGCCAACATCGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCTGTGAAGCAGCGGCCTCTCCA  956
            |||||.|..||.|||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||..||||||||.||||.|||.|
Sbjct  886  GCCTACCACGCTGGCCTGCATGCCAATGTTGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCCATGAAGCAGAGGCCACTCAA  959

Query  957  GGCCTACAAGCCGGGTGCACTGACGTTCCTCCTGTCCATGGGGAGAAATGACGGTGTGGGCCAAATCAGTGGCT  1030
            .||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  960  AGCTTACAAGCCAGGTGCGCTGACATTCCTCCTGTCCATGGGCAGAAATGATGGCGTGGGTCAGATCAGTGGCT  1033

Query 1031  TCTATGTGGGCCGGCTCATGGTTCGGCTGACCAAGAGCCGGGACCTGTTCGTCTCTACGAGCTGGAAAACCATG  1104
            ||||.||.|||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||..||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1034  TCTACGTAGGCCGCCTCATGGTGCGGCTGGCCAAGAGCAGGGACCTTCTCATCTCCACAAGCTGGAAAACCATG  1107

Query 1105  AGGCAGTCTCCACCT  1119
            .|||||||||||||.
Sbjct 1108  CGGCAGTCTCCACCG  1122