Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09257
Subject:
XM_017018462.2
Aligned Length:
1041
Identities:
898
Gaps:
141

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74

Query   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148

Query  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222

Query  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296

Query  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370

Query  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444

Query  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTGGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTAGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518

Query  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592

Query  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666

Query  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740

Query  741  TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAAAGGACGGAGAACGTGACCTTGAAGAAGCCAGAAACTTTTCCAAAAAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAAAGGACGGAGAACGTGACCTTGAAGAAGCCAGAAACTTTTCCAAAAAATC  814

Query  815  AAAGGAGAGTGTTTCGAGCTCCTGATCTGAAAGGAATGCTAGAAGTGTTTAGAGAGCTGACAGATGTCCGACGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGGAGAGTGTTTCGAGCTCCTGATCTGAAAGGAATGCTAGAAGTGTTTAGAGAGCTGACAGATGTCCGACGC  888

Query  889  TACTGGGGTAAGGAGAAGTCACATTATCATAAGCCACCCTGCGGCTTATCATTATTATTATCTTTATCTTTTAG  962
            ||||||        ||||.|                                                      
Sbjct  889  TACTGG--------GAAGAC------------------------------------------------------  900

Query  963  AATTTTATGTTCTCTATTAGGCTCATGTTTTAAGATTTATGATTCTCCTTCCAAGACACACATAACTTACCCCT  1036
                                                                                      
Sbjct  901  --------------------------------------------------------------------------  900

Query 1037  CCTTA  1041
                 
Sbjct  901  -----  900