Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09263
• Subject: NM_145977.2
• Aligned Length: 1667
• Identities: 1458
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGGTCCAGAGGCTGTGGGTGAGCCGCCTGCTGCGGCACCGGAAAGCCCAGCTCTTGCTGGTCAACCTGCTAAC  74
            |||.|||||||||||||||..|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGATCCAGAGGCTGTGGGCCAGCCGTCTGCTACGGCACCGGAAAGCTCAGCTCCTGCTGGTCAACCTGCTCAC  74

Query   75  CTTTGGCCTGGAGGTGTGTTTGGCCGCAGGCATCACCTATGTGCCGCCTCTGCTGCTGGAAGTGGGGGTAGAGG  148
            ||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct   75  CTTTGGCCTGGAGGTGTGCCTGGCTGCCGGCATTACCTATGTGCCACCCCTTCTGCTGGAAGTCGGGGTGGAGG  148

Query  149  AGAAGTTCATGACCATGGTGCTGGGCATTGGTCCAGTGCTGGGCCTGGTCTGTGTCCCGCTCCTAGGCTCAGCC  222
            ||||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAATTCATGACCATGGTGTTGGGCATTGGCCCAGTGCTAGGCCTGGTTTCTGTTCCACTCCTAGGCTCAGCC  222

Query  223  AGTGACCACTGGCGTGGACGCTATGGCCGCCGCCGGCCCTTCATCTGGGCACTGTCCTTGGGCATCCTGCTGAG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||..|||||.||||..|||||||.||
Sbjct  223  AGTGACCAGTGGCGTGGGCGCTATGGCCGCCGGAGACCCTTTATCTGGGCTTTGTCCCTGGGTGTCCTGCTAAG  296

Query  297  CCTCTTTCTCATCCCAAGGGCCGGCTGGCTAGCAGGGCTGCTGTGCCCGGATCCCAGGCCCCTGGAGCTGGCAC  370
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||.|||.||..||||||||||||||.||||.|
Sbjct  297  CCTCTTTCTCATCCCGAGGGCTGGCTGGCTGGCAGGACTGCTGTACCCAGACACCAGGCCCCTGGAGTTGGCCC  370

Query  371  TGCTCATCCTGGGCGTGGGGCTGCTGGACTTCTGTGGCCAGGTGTGCTTCACTCCACTGGAGGCCCTGCTCTCT  444
            ||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||.
Sbjct  371  TGCTGATCTTGGGAGTGGGGCTGCTGGACTTTTGTGGCCAGGTGTGCTTTACTCCATTGGAGGCCTTACTCTCC  444

Query  445  GACCTCTTCCGGGACCCGGACCACTGTCGCCAGGCCTACTCTGTCTATGCCTTCATGATCAGTCTTGGGGGCTG  518
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GACCTCTTCCGGGACCCAGACCACTGCCGCCAAGCCTTCTCTGTCTACGCCTTCATGATCAGCCTTGGGGGCTG  518

Query  519  CCTGGGCTACCTCCTGCCTGCCATTGACTGGGACACCAGTGCCCTGGCCCCCTACCTGGGCACCCAGGAGGAGT  592
            |||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  519  CCTGGGCTACCTCTTACCTGCCATTGACTGGGACACCAGCGTTCTGGCCCCCTACCTGGGTACTCAGGAAGAAT  592

Query  593  GCCTCTTTGGCCTGCTCACCCTCATCTTCCTCACCTGCGTAGCAGCCACACTGCTGGTGGCTGAGGAGGCAGCG  666
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||.|.||||||||.|||.|.|||.|.||||||||||..
Sbjct  593  GCCTCTTTGGCCTCCTCACCCTCATTTTCCTCATCTGCATGGCAGCCACTCTGTTTGTGACGGAGGAGGCAGTA  666

Query  667  CTGGGCCCCACCGAGCCAGCAGAAGGGCTGTCGGCCCCCTCCTTGTCGCCCCACTGCTGTCCATGCC----GGG  736
            ||||||||..|||||||.|||||||||.|||.||.|.|..||.||||||.||..|||||.|||||||    .||
Sbjct  667  CTGGGCCCACCCGAGCCGGCAGAAGGGTTGTTGGTCTCTGCCGTGTCGCGCCGATGCTGCCCATGCCACGTTGG  740

Query  737  CCCGCTTGGCTTTCCGGAACCTGGGCGCCCTGCTTCCCCGGCTGCACCAGCTGTGCTGCCGCATGCCCCGCACC  810
            ||    |||||||||||||.|||||..|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  741  CC----TGGCTTTCCGGAATCTGGGTACCCTGTTTCCCCGGCTGCAGCAGCTGTGCTGCCGCATGCCTCGCACC  810

Query  811  CTGCGCCGGCTCTTCGTGGCTGAGCTGTGCAGCTGGATGGCACTCATGACCTTCACGCTGTTTTACACGGATTT  884
            ||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  811  CTACGCCGACTCTTTGTGGCTGAGCTGTGCAGCTGGATGGCACTTATGACTTTCACACTGTTCTACACGGACTT  884

Query  885  CGTGGGCGAGGGGCTGTACCAGGGCGTGCCCAGAGCTGAGCCTGGCACCGAGGCCCGGAGACACTATGATGAAG  958
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CGTGGGAGAGGGGCTGTACCAGGGTGTACCCAGAGCCGAGCCAGGCACCGAGGCCCGGAGACACTATGATGAAG  958

Query  959  GCGTTCGGATGGGCAGCCTGGGGCTGTTCCTGCAGTGCGCCATCTCCCTGGTCTTCTCTCTGGTCATGGACCGG  1032
            ||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  959  GCATTCGAATGGGCAGCCTGGGGCTCTTCCTGCAGTGTGCCATCTCCCTGGTCTTCTCCCTGGTCATGGACAGG  1032

Query 1033  CTGGTGCAGCGATTCGGCACTCGAGCAGTCTATTTGGCCAGTGTG--GCAGCTTTCCCTGTGGCTGCCGGTGCC  1104
            |||||.|||...||||||||.||..||||||||.|||||||||||  | |.|||| |||||||||||||.||||
Sbjct 1033  CTGGTACAGAAGTTCGGCACACGGTCAGTCTATCTGGCCAGTGTGATG-ACCTTT-CCTGTGGCTGCCGCTGCC  1104

Query 1105  ACATGCCTGTCCCACAGTGTGGCCGTGGTGACAGCTTCAGCCGCCCTCACCGGGTTCACCTTCTCAGCCCTGCA  1178
            ||.||||||||||||||.||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1105  ACCTGCCTGTCCCACAGCGTGGTGGTAGTGACAGCCTCAGCTGCCCTCACCGGGTTCACCTTCTCGGCCTTGCA  1178

Query 1179  GATCCTGCCCTACACACTGGCCTCCCTCTACCACCGGGAGAAGCAGGTGTTCCTGCCCAAATACCGAGGGGACA  1252
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1179  GATCCTGCCTTACACGCTCGCCTCCCTCTACCACCGTGAGAAGCAGGTGTTCCTGCCCAAATACCGAGGGGACG  1252

Query 1253  CTGGAGGT-GCTAGCAGTGAGGACAGCCTGATGACCAGCTTCCTGCCAGGCCCTAAGCCTGGAGCTCCCTTCCC  1325
            |||||||| || |||.||||||||||||.||..|||||||||.||||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1253  CTGGAGGTAGC-AGCGGTGAGGACAGCCAGACAACCAGCTTCTTGCCAGGCCCTAAGCCAGGAGCTCTCTTCCC  1325

Query 1326  TAATGGACACGTGGGTGCTGGAGGCAGTGGCCTGCTCCCACCTCCACCCGCGCTCTGCGGGGCCTCTGCCTGTG  1399
            .||||||||||||||..||||..||||.|||.|.||..|.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1326  CAATGGACACGTGGGCTCTGGCAGCAGCGGCATCCTGGCCCCTCCACCTGCACTCTGTGGGGCCTCTGCCTGCG  1399

Query 1400  ATGTCTCCGTACGTGTGGTGGTGGGTGAGCCCACC-GAGGCCAGGGTGGTTCCGGGCCGGGGCATCTGCCTGGA  1472
            ||||||||.|.||.||||||||||||||| ||||| |||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1400  ATGTCTCCATGCGAGTGGTGGTGGGTGAG-CCACCTGAGGCCAGGGTTGTTACGGGACGGGGCATTTGCCTGGA  1472

Query 1473  CCTCGCCATCCTGGATAGTGCCTTCCTGCTGTCCCAGGTGGCCCCATCCCTGTTTATGGGCTCCATTGTCCAGC  1546
            |||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  CCTGGCCATTCTGGACAGTGCCTTTCTGCTGTCCCAGGTGGCTCCGTCCCTGTTCATGGGCTCCATTGTCCAGC  1546

Query 1547  TCAGCCAGTCTGTCACTGCCTATATGGTGTCTGCCGCAGGCCTGGGTCTGGTCGCCATTTACTTTGCTACACAG  1620
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  TGAGCCACTCTGTCACTGCCTATATGGTATCAGCTGCAGGCTTGGGTCTGGTCGCCATTTACTTTGCTACACAG  1620

Query 1621  GTAGTATTTGACAAGAGCGACTTGGCCAAATACTCAGCG  1659
            |||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1621  GTAGTGTTTGACAAGAACGACTTGGCCAAATACTCAGTG  1659