Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09266
• Subject: XM_006515710.3
• Aligned Length: 1459
• Identities: 1016
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGGGCTGGTCGGTGGGCACGAGGGTTGTTTACCGAGTGAGTGTCCCGGTCCTTCGTTTAGGAGCCAGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACAGGTGCACCGTCTATTGCAGAGGCCTGCGGTCGCCTACTTTTACTGGTCATTTCTCCTGGCTGGTTGGCTAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCAGGCGCGGTGCCAACGATGGGGACGCGAGGAAGAAGGTGGCTTGTGCCAAAGTAATCCATATGCAAAGAGTA  222

Query    1  ------------------------------ATGGAGAGGAAAAACCCATCCAGAGAGAGCCCCAGAAGACTCTC  44
                                          |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CCTGTGCTCCGTCTTCCGGCCATCTTAGACATGGAGAGGAAAATCCCATCCAGAGAGAGCCCCAGAAGACTGTC  296

Query   45  TGCCAAAGTAGGCAAAGGCACAGAGATGAAGAAAGTGGCTCGTCAGTTTGGGATGGCTGCTGCTGAGTCAGACA  118
            .|||||...||||..||||||.|||||||||||..|.||.||.|...||||..|||..||.|||||.|||||||
Sbjct  297  CGCCAAGCCAGGCCGAGGCACGGAGATGAAGAAGCTAGCGCGACCACTTGGCGTGGTGGCAGCTGACTCAGACA  370

Query  119  AGGACTCTGGCTTTTCAGATGGGAGCTCGGAATGTCTGAGCTCTGCAGAGCAGATGGAGTCCGAGGACATGCTG  192
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AGGACTCTGGCTTCTCAGATGGGAGCTCAGAATGTTTGAGCTCCGCAGAGCAGATGGAGTCAGAGGACATGCTG  444

Query  193  AGCGCCTTAGGCTGGAGCAGAGAAGACAGGCCGAGGCAGAACTCCAAAACTGCAAAGAATGCCTTCCCTACCCT  266
            ||||||||.|||||.|..||||||||||.||.|||||||..|||||||.||||..|.|.||||.||||.||.||
Sbjct  445  AGCGCCTTGGGCTGCAAGAGAGAAGACAAGCGGAGGCAGCCCTCCAAAGCTGCGGACACTGCCCTCCCCACGCT  518

Query  267  GTCTCCCATGGTCGTCATGAAGAATGTGCTTGTCAAACAGGGCAGCAGCTCATCCCAGCTCCAGTCGTGGACTG  340
            |.|.||.||||||||||||||||..|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  GCCCCCTATGGTCGTCATGAAGAGCGTGCTGGTCAAGCAGGGCAGCAGCTCCTCCCAGCTTCAGTCCTGGACTG  592

Query  341  TCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCACAGCCACAGCTCTTATTCCTTCATCCACCTGTACCATCTCCTGTC  414
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCGCAGCCACAGCTCTTTGTCCTTCATCCACCTGTGCCATCTCCTGTC  666

Query  415  AGTCCATGTCACACTGGTGAGAAAAAGTCCGACTCCAGGAACTACTTGCCCATTCTGAATTCTTACACCAAAAT  488
            ||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  667  AGCTCATGCCAGACTGGTGAGAAAAAGTCAGAATCCAGAAACTACTTGCCCATTCTAAATTCTTATACCAAAAT  740

Query  489  AGCCCCACATCCAGGCAAAAGGGGCCT---TTCCCTTGGCCCAGAAGAAAAAGGAACAAGTGGAGTGCAGAAGA  559
            ||||||.||.||||||||.||||||||   ||         |||||||.|.||||||||||||.||...|||||
Sbjct  741  AGCCCCCCACCCAGGCAAGAGGGGCCTCAATT---------CAGAAGACAGAGGAACAAGTGGGGTATCGAAGA  805

Query  560  AAATCTGTACTGAGAGACTTGGGCCTAGCTTGTCTTCCAGTGAGCCAACCAAGGCTGGTGCTGTCCC-------  626
            ||.||||.||.|||||||..|||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.||||       ||       
Sbjct  806  AACTCTGCACGGAGAGACCGGGGCCAAGCCTGTCTTCCAGTGAGCCAGCCAAGACTGG-------CCGAGTATT  872

Query  627  ATCCAGTCCCTCGACGCCAGCACCACCCAGCGCCAAACTTGCCGAGGACTCAGCTCTGCAGGGTGTGCCCTCTC  700
            |||||||||.||.||.|||||.|||||||||.|||||||..|.||||||||..|||||||.||.||.|||||.|
Sbjct  873  ATCCAGTCCTTCCACTCCAGCCCCACCCAGCTCCAAACTCACTGAGGACTCCACTCTGCAAGGAGTTCCCTCCC  946

Query  701  TGGTGGCAGGTGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCGGTATCCAGCAGTCACGTGGCTAAAGCTCCCAGTCTGACC  774
            |.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  947  TTGGGGCTGGCGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCTGTGTCCAGCAGCCATGTGGCTAAAGCTCCCAGTCTGACT  1020

Query  775  TTCGCTTCCCCCGCCAGTCCTGTCTGCGCATCAGACAGCACTCTCCATGGGTTAGAGAGCAACTCTCCCCTTTC  848
            ||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||..|||||||||.|||.||.||.||
Sbjct 1021  TTGGCTTCGCCCGCCAGCCCTGTGTGTGCGTCAGACAGCACTCTGCATGGCCTAGAGAGCAGCTCCCCTCTCTC  1094

Query  849  ACCACTGTCCGCTAATTATAGCTCACCTTTATGGGCTGCAGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAGATATCTTTTCAG  922
            .||||||||.||.|.|||.|..||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1095  CCCACTGTCAGCCAGTTACACTTCACCTCTGTGGGCTGCGGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAGACATCTTCTCCG  1168

Query  923  AGCAGCGGCAGAGCAAACATAGGCGCTTTCAGAATACCCTAGTAGTCCTACATAAATCTGGTTTGCTGGAGATC  996
            |||||.||||||.|||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1169  AGCAGAGGCAGAACAAGCATAGGCGCTTTCAGAATACCTTAGTGGTCCTCCACAAGTCTGGTTTGCTGGAGATC  1242

Query  997  ACTTTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAATCAGGCAACTCAGGTAGAACTAGACCAGCTAAAGGAGCAAAC  1070
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1243  ACTCTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAACCAAGCAACTCAGGCAGAGCTGGACCAGCTGAAGGAGCAAAC  1316

Query 1071  CCAGCTGTTTATAGAAGCCACCAAGAGCAGGGCCCCTCAGGCTTGGGCCAAGCTGCAGGCATCTTTAACACCTG  1144
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||..|||||.|||
Sbjct 1317  CCAGATGTTTATAGAGGCCACCAAGAGCAGGGCTCCTCAGGCATGGGCCAAGTTGCAGGCATCACTAACATCTG  1390

Query 1145  GGTCCAGTAATACAGGCAGTGACCTAGAAGCATTCTCTGATCACCCAGCCATA  1197
            ||||||||.||.||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||.|.||
Sbjct 1391  GGTCCAGTCATTCAGGCAGTGACCTAGACACGTTGTCTGATCACCCAGACGTA  1443