Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09266
• Subject: XM_011244078.2
• Aligned Length: 1312
• Identities: 1016
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGCCTGCTAACCCGCCGGGCTGGTCATGGAGCGGCGACCCTGGCCCTTAGAGTAATCCATATGCAAAGAGT  74

Query    1  -------------------------------ATGGAGAGGAAAAACCCATCCAGAGAGAGCCCCAGAAGACTCT  43
                                           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  ACCTGTGCTCCGTCTTCCGGCCATCTTAGACATGGAGAGGAAAATCCCATCCAGAGAGAGCCCCAGAAGACTGT  148

Query   44  CTGCCAAAGTAGGCAAAGGCACAGAGATGAAGAAAGTGGCTCGTCAGTTTGGGATGGCTGCTGCTGAGTCAGAC  117
            |.|||||...||||..||||||.|||||||||||..|.||.||.|...||||..|||..||.|||||.||||||
Sbjct  149  CCGCCAAGCCAGGCCGAGGCACGGAGATGAAGAAGCTAGCGCGACCACTTGGCGTGGTGGCAGCTGACTCAGAC  222

Query  118  AAGGACTCTGGCTTTTCAGATGGGAGCTCGGAATGTCTGAGCTCTGCAGAGCAGATGGAGTCCGAGGACATGCT  191
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  AAGGACTCTGGCTTCTCAGATGGGAGCTCAGAATGTTTGAGCTCCGCAGAGCAGATGGAGTCAGAGGACATGCT  296

Query  192  GAGCGCCTTAGGCTGGAGCAGAGAAGACAGGCCGAGGCAGAACTCCAAAACTGCAAAGAATGCCTTCCCTACCC  265
            |||||||||.|||||.|..||||||||||.||.|||||||..|||||||.||||..|.|.||||.||||.||.|
Sbjct  297  GAGCGCCTTGGGCTGCAAGAGAGAAGACAAGCGGAGGCAGCCCTCCAAAGCTGCGGACACTGCCCTCCCCACGC  370

Query  266  TGTCTCCCATGGTCGTCATGAAGAATGTGCTTGTCAAACAGGGCAGCAGCTCATCCCAGCTCCAGTCGTGGACT  339
            ||.|.||.||||||||||||||||..|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  TGCCCCCTATGGTCGTCATGAAGAGCGTGCTGGTCAAGCAGGGCAGCAGCTCCTCCCAGCTTCAGTCCTGGACT  444

Query  340  GTCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCACAGCCACAGCTCTTATTCCTTCATCCACCTGTACCATCTCCTGT  413
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GTCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCGCAGCCACAGCTCTTTGTCCTTCATCCACCTGTGCCATCTCCTGT  518

Query  414  CAGTCCATGTCACACTGGTGAGAAAAAGTCCGACTCCAGGAACTACTTGCCCATTCTGAATTCTTACACCAAAA  487
            |||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  CAGCTCATGCCAGACTGGTGAGAAAAAGTCAGAATCCAGAAACTACTTGCCCATTCTAAATTCTTATACCAAAA  592

Query  488  TAGCCCCACATCCAGGCAAAAGGGGCCT---TTCCCTTGGCCCAGAAGAAAAAGGAACAAGTGGAGTGCAGAAG  558
            |||||||.||.||||||||.||||||||   ||         |||||||.|.||||||||||||.||...||||
Sbjct  593  TAGCCCCCCACCCAGGCAAGAGGGGCCTCAATT---------CAGAAGACAGAGGAACAAGTGGGGTATCGAAG  657

Query  559  AAAATCTGTACTGAGAGACTTGGGCCTAGCTTGTCTTCCAGTGAGCCAACCAAGGCTGGTGCTGTCCC------  626
            |||.||||.||.|||||||..|||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.||||       ||      
Sbjct  658  AAACTCTGCACGGAGAGACCGGGGCCAAGCCTGTCTTCCAGTGAGCCAGCCAAGACTGG-------CCGAGTAT  724

Query  627  -ATCCAGTCCCTCGACGCCAGCACCACCCAGCGCCAAACTTGCCGAGGACTCAGCTCTGCAGGGTGTGCCCTCT  699
             |||||||||.||.||.|||||.|||||||||.|||||||..|.||||||||..|||||||.||.||.|||||.
Sbjct  725  TATCCAGTCCTTCCACTCCAGCCCCACCCAGCTCCAAACTCACTGAGGACTCCACTCTGCAAGGAGTTCCCTCC  798

Query  700  CTGGTGGCAGGTGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCGGTATCCAGCAGTCACGTGGCTAAAGCTCCCAGTCTGAC  773
            ||.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CTTGGGGCTGGCGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCTGTGTCCAGCAGCCATGTGGCTAAAGCTCCCAGTCTGAC  872

Query  774  CTTCGCTTCCCCCGCCAGTCCTGTCTGCGCATCAGACAGCACTCTCCATGGGTTAGAGAGCAACTCTCCCCTTT  847
            .||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||..|||||||||.|||.||.||.|
Sbjct  873  TTTGGCTTCGCCCGCCAGCCCTGTGTGTGCGTCAGACAGCACTCTGCATGGCCTAGAGAGCAGCTCCCCTCTCT  946

Query  848  CACCACTGTCCGCTAATTATAGCTCACCTTTATGGGCTGCAGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAGATATCTTTTCA  921
            |.||||||||.||.|.|||.|..||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  947  CCCCACTGTCAGCCAGTTACACTTCACCTCTGTGGGCTGCGGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAGACATCTTCTCC  1020

Query  922  GAGCAGCGGCAGAGCAAACATAGGCGCTTTCAGAATACCCTAGTAGTCCTACATAAATCTGGTTTGCTGGAGAT  995
            ||||||.||||||.|||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1021  GAGCAGAGGCAGAACAAGCATAGGCGCTTTCAGAATACCTTAGTGGTCCTCCACAAGTCTGGTTTGCTGGAGAT  1094

Query  996  CACTTTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAATCAGGCAACTCAGGTAGAACTAGACCAGCTAAAGGAGCAAA  1069
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1095  CACTCTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAACCAAGCAACTCAGGCAGAGCTGGACCAGCTGAAGGAGCAAA  1168

Query 1070  CCCAGCTGTTTATAGAAGCCACCAAGAGCAGGGCCCCTCAGGCTTGGGCCAAGCTGCAGGCATCTTTAACACCT  1143
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||..|||||.||
Sbjct 1169  CCCAGATGTTTATAGAGGCCACCAAGAGCAGGGCTCCTCAGGCATGGGCCAAGTTGCAGGCATCACTAACATCT  1242

Query 1144  GGGTCCAGTAATACAGGCAGTGACCTAGAAGCATTCTCTGATCACCCAGCCATA  1197
            |||||||||.||.||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||.|.||
Sbjct 1243  GGGTCCAGTCATTCAGGCAGTGACCTAGACACGTTGTCTGATCACCCAGACGTA  1296