Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09266
• Subject: XM_017315032.1
• Aligned Length: 1249
• Identities: 1016
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ------------------------------------------ATGGAGAGGAAAAACCCATCCAGAGAGAGCCC  32
                                                      |||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAAAGAGTACCTGTGCTCCGTCTTCCGGCCATCTTAGACATGGAGAGGAAAATCCCATCCAGAGAGAGCCC  74

Query   33  CAGAAGACTCTCTGCCAAAGTAGGCAAAGGCACAGAGATGAAGAAAGTGGCTCGTCAGTTTGGGATGGCTGCTG  106
            |||||||||.||.|||||...||||..||||||.|||||||||||..|.||.||.|...||||..|||..||.|
Sbjct   75  CAGAAGACTGTCCGCCAAGCCAGGCCGAGGCACGGAGATGAAGAAGCTAGCGCGACCACTTGGCGTGGTGGCAG  148

Query  107  CTGAGTCAGACAAGGACTCTGGCTTTTCAGATGGGAGCTCGGAATGTCTGAGCTCTGCAGAGCAGATGGAGTCC  180
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  149  CTGACTCAGACAAGGACTCTGGCTTCTCAGATGGGAGCTCAGAATGTTTGAGCTCCGCAGAGCAGATGGAGTCA  222

Query  181  GAGGACATGCTGAGCGCCTTAGGCTGGAGCAGAGAAGACAGGCCGAGGCAGAACTCCAAAACTGCAAAGAATGC  254
            ||||||||||||||||||||.|||||.|..||||||||||.||.|||||||..|||||||.||||..|.|.|||
Sbjct  223  GAGGACATGCTGAGCGCCTTGGGCTGCAAGAGAGAAGACAAGCGGAGGCAGCCCTCCAAAGCTGCGGACACTGC  296

Query  255  CTTCCCTACCCTGTCTCCCATGGTCGTCATGAAGAATGTGCTTGTCAAACAGGGCAGCAGCTCATCCCAGCTCC  328
            |.||||.||.|||.|.||.||||||||||||||||..|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  CCTCCCCACGCTGCCCCCTATGGTCGTCATGAAGAGCGTGCTGGTCAAGCAGGGCAGCAGCTCCTCCCAGCTTC  370

Query  329  AGTCGTGGACTGTCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCACAGCCACAGCTCTTATTCCTTCATCCACCTGTA  402
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTCCTGGACTGTCCAGCCCTCCTTTGAAGTGATCTCAGCGCAGCCACAGCTCTTTGTCCTTCATCCACCTGTG  444

Query  403  CCATCTCCTGTCAGTCCATGTCACACTGGTGAGAAAAAGTCCGACTCCAGGAACTACTTGCCCATTCTGAATTC  476
            ||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CCATCTCCTGTCAGCTCATGCCAGACTGGTGAGAAAAAGTCAGAATCCAGAAACTACTTGCCCATTCTAAATTC  518

Query  477  TTACACCAAAATAGCCCCACATCCAGGCAAAAGGGGCCT---TTCCCTTGGCCCAGAAGAAAAAGGAACAAGTG  547
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||   ||         |||||||.|.|||||||||||
Sbjct  519  TTATACCAAAATAGCCCCCCACCCAGGCAAGAGGGGCCTCAATT---------CAGAAGACAGAGGAACAAGTG  583

Query  548  GAGTGCAGAAGAAAATCTGTACTGAGAGACTTGGGCCTAGCTTGTCTTCCAGTGAGCCAACCAAGGCTGGTGCT  621
            |.||...|||||||.||||.||.|||||||..|||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.||||    
Sbjct  584  GGGTATCGAAGAAACTCTGCACGGAGAGACCGGGGCCAAGCCTGTCTTCCAGTGAGCCAGCCAAGACTGG----  653

Query  622  GTCCC-------ATCCAGTCCCTCGACGCCAGCACCACCCAGCGCCAAACTTGCCGAGGACTCAGCTCTGCAGG  688
               ||       |||||||||.||.||.|||||.|||||||||.|||||||..|.||||||||..|||||||.|
Sbjct  654  ---CCGAGTATTATCCAGTCCTTCCACTCCAGCCCCACCCAGCTCCAAACTCACTGAGGACTCCACTCTGCAAG  724

Query  689  GTGTGCCCTCTCTGGTGGCAGGTGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCGGTATCCAGCAGTCACGTGGCTAAAGCT  762
            |.||.|||||.||.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  725  GAGTTCCCTCCCTTGGGGCTGGCGGAAGTCCACAGACTCTTCAGCCTGTGTCCAGCAGCCATGTGGCTAAAGCT  798

Query  763  CCCAGTCTGACCTTCGCTTCCCCCGCCAGTCCTGTCTGCGCATCAGACAGCACTCTCCATGGGTTAGAGAGCAA  836
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||..|||||||||.
Sbjct  799  CCCAGTCTGACTTTGGCTTCGCCCGCCAGCCCTGTGTGTGCGTCAGACAGCACTCTGCATGGCCTAGAGAGCAG  872

Query  837  CTCTCCCCTTTCACCACTGTCCGCTAATTATAGCTCACCTTTATGGGCTGCAGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAG  910
            |||.||.||.||.||||||||.||.|.|||.|..||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  CTCCCCTCTCTCCCCACTGTCAGCCAGTTACACTTCACCTCTGTGGGCTGCGGAGCACCTCTGCCGCAGCCCAG  946

Query  911  ATATCTTTTCAGAGCAGCGGCAGAGCAAACATAGGCGCTTTCAGAATACCCTAGTAGTCCTACATAAATCTGGT  984
            |.|||||.||.||||||.||||||.|||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct  947  ACATCTTCTCCGAGCAGAGGCAGAACAAGCATAGGCGCTTTCAGAATACCTTAGTGGTCCTCCACAAGTCTGGT  1020

Query  985  TTGCTGGAGATCACTTTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAATCAGGCAACTCAGGTAGAACTAGACCAGCT  1058
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.|||.||.||||||||
Sbjct 1021  TTGCTGGAGATCACTCTGAAAACCAAGGAGTTGATTCGTCAGAACCAAGCAACTCAGGCAGAGCTGGACCAGCT  1094

Query 1059  AAAGGAGCAAACCCAGCTGTTTATAGAAGCCACCAAGAGCAGGGCCCCTCAGGCTTGGGCCAAGCTGCAGGCAT  1132
            .|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1095  GAAGGAGCAAACCCAGATGTTTATAGAGGCCACCAAGAGCAGGGCTCCTCAGGCATGGGCCAAGTTGCAGGCAT  1168

Query 1133  CTTTAACACCTGGGTCCAGTAATACAGGCAGTGACCTAGAAGCATTCTCTGATCACCCAGCCATA  1197
            |..|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||.|.||
Sbjct 1169  CACTAACATCTGGGTCCAGTCATTCAGGCAGTGACCTAGACACGTTGTCTGATCACCCAGACGTA  1233