Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09276
- Subject:
- XM_006508226.3
- Aligned Length:
- 1948
- Identities:
- 1530
- Gaps:
- 161
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 1 ATGGAGTCCCCGGGAGGCTCCGCCCCCCTGCTCGGGCTGGAGCTTTGCGCGGCCGCTAGGGACTCGGCGGCCAT 74
Query 3 GGCGGGGCCGGGCGTC---------CCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGC 67
|||.||.||.||||.| |||.|.||.|||||.||...||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCAGGACCTGGCGCCCCCTGCGATCCCTGCGCGCCCGCCGCTGTCTGGAAGCGCCACATCGTGCGGCAGCTGC 148
Query 68 GGCTTCGGGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCT 141
|||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 149 GGCATCGGGACCGCACGCAAAAGGCGCTCTTCCTGGAGCTAGTGCCGGCTTATAACCATCTCCTAGAGAAGGCT 222
Query 142 GAGCTGCTGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTC-CCACCACCCACCAGGGCC 214
||.|||||.|.||||||||||.|.|||.||.||.|.||.|||||...||.|| || |||||...||..|||.|.
Sbjct 223 GAACTGCTAGCCAAGTTCTCAGAAAAGTTGAAGTCCGAACCAAAGGATGCCA-TCTCCACCCGACATGAGGACT 295
Query 215 CCTGGGAGGAG---TCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAG 285
...|||||||| ||||.|...|.|.|.|||||||||.||||||..|.|.|.||||||||||||||||||.||
Sbjct 296 GGAGGGAGGAGGTCTCAGGGACAGGCCCTGACCAAGTCTCATCACCAGCCTCTCTGAGGGTGAAGTGGCAGCAG 369
Query 286 GAGGAGGAGGGGCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCAC 359
|||.||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||.|.|||
Sbjct 370 GAGAAGAAGGGGCTGCAGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGAAGAAGAGCGCAGCCCTAGACAC 443
Query 360 GCTGGAGTCGGAGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGG 433
.|||.||||..|||||.||.||.||||...||||.|||.|||||||.|||||.||||||.||||||.|..||||
Sbjct 444 CCTGCAGTCACAGCTGGAGGAGCGGCAGGACAGGTTGGAAGCCCTGCAGGCCTGCGTGGTGCAGCTACAGGAGG 517
Query 434 CGCGGGCGCAGCAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCG 507
|||||||.||||||.|||.||||.|||||||..|||..|||.||||.||.|..|||.|.|.||||||.|||.||
Sbjct 518 CGCGGGCTCAGCAGTCCCGGCAGCTGGAGGAACGGCAAGCGGAGAACGCAGCACAGAGAGAAGCCTATGAGACG 591
Query 508 CTGCGCGCGCACGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAG 581
||||.|..|||.|..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||..
Sbjct 592 CTGCTCCAGCAAGCTGTGCACCAGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCACGCGACTTGCTGGAGCA 665
Query 582 GCTCGTGCAGCGCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGG 655
|||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||..|.|||.|||||||.||||
Sbjct 666 GCTTGTGCAGCGTAAGGCGCGCGCCGCCGCTGAGCGCAATCTACGTAATGAGCGTAGAGAGAGGGCCAACCAGG 739
Query 656 CGCGGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGC 729
|.|.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||..|||..||||.||||..
Sbjct 740 CTCTGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAAGCGGCTAAGCGGACTGTGAGCATCAGCGAGATCCCAAACACTCTAGAA 813
Query 730 GATTGGATGAGGGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTG------AGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGC 797
|||.||| .||.|||| ||||||.|||||||.||.|||| .|||.|||..|...||||..||..|
Sbjct 814 GATGGGA----CGAAAGAA--GAGACTGTGGCTCTAGCTCCTGCCGCTCTGCCTGAGTTCTCAGAGAGTGAGAC 881
Query 798 TTGTGAGAAGTGGAAGAGGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGG 871
||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 882 TTGTGAAAAATGGAAGAGGCCTTTCA------------------------------------------------ 907
Query 872 TGAAGGGGCTTCTGGATTTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATC 945
||||| |||||.||.|||||||||||..|||||||.||.|||||||||||.|||||.|.|
Sbjct 908 -------GCTTC--------AAGAAAAGAAGAGGTCACTCGGTTGGGGGCGCACCTGAGCAGCGGTACCAAAGC 966
Query 946 ATCCCTGTGTGTGTGGCTGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAA 1019
|||||||||||||||.||||||.|.||||..|||.||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 967 ATCCCTGTGTGTGTGTCTGCCCAAATTCCCTCCCAGGCTCAGGATGTCTTGGATGCCCATCTCTCTGAGGTCAA 1040
Query 1020 TGCTGTTCGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATG 1093
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1041 TGCTGTTTGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGGCTGATCCACCTCTGGAATG 1114
Query 1094 TTGTGGGAAGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGAC 1167
||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1115 TTGTAGGAGGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAAGGAGCTGGCGGCAGCATCACCAGTGTGGATTTTGAC 1188
Query 1168 CCCTCGGGCTACCAGGTTTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTC 1241
|||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 1189 CCCTCAGGCTCCCAGGTTTTGGCAGCTACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGAGAGACTCAGTC 1262
Query 1242 CAAGGAGACACTGTCTGGACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGA 1315
||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1263 CAAGGAAACATTGTCCGGACACAAGGACAAAGTGACTGCTGCCAAATTCAAGCTAACAAGGCACCAGGCAGTGA 1336
Query 1316 CTGGGAGCCGCGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTT 1389
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1337 CTGGGAGCCGAGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTGGGCCGCGCCTACTGTTCCAGGACTATCAATGTACTT 1410
Query 1390 TCCTACTGTAATGACGTGGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTG 1463
||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1411 TCCTACTGCAATGACGTGGTGTGCGGGGACCACATCATCATCAGTGGCCACAATGACCAAAAGATCCGGTTCTG 1484
Query 1464 GGACAGCAGGGGGCCCCACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACG 1537
||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||..|||||||.|.|
Sbjct 1485 GGACAGCAGGGGCCCTCACTGCATCCAGGTCATCCCCGTGCAGGGCCGGGTTACCTCCCTGCACCTCAGCTATG 1558
Query 1538 ACCAACTGCACCTGCTCAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGC 1611
||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||.
Sbjct 1559 ACCAGCTGCATCTGCTTAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTTATCGACCTGCGAATCAGCAATATCCGA 1632
Query 1612 CAGGTGTTCAGGGCCGATGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTA 1685
||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1633 CAGGTGTTCAGGGCAGATGGCTTCAAGTGCAGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCTGACAGAAGCTA 1706
Query 1686 TGCACTGGCAGGCTCCTGTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTAC 1759
|||||||||||||||.|...|.||.|.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1707 TGCACTGGCAGGCTCTTCAAACGGCGACCTGTACATCTGGGATGTGAACACCGGGAAACTGGAGACCAGCCTAC 1780
Query 1760 AGGGACCCCATTGCGCTGCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAG 1833
||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||.|||||||.||||||||.||||.|.|||||.||||||||.
Sbjct 1781 AGGGACCCCACTGCACTGCTGTTAATGCCGTGGCTTGGTGCTTCTCCGGGAACCACGTTGTGAGTGTGGACCAA 1854
Query 1834 GGCAGGAAGGTTGTGCTCTGGCAG 1857
|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1855 GGCAGGAAGGTGGTGCTCTGGCAC 1878