Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09276
• Subject: XM_006718732.2
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1793
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG  74
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Sbjct    1  ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG  74

Query   75  GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC  148

Query  149  TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG  222

Query  223  GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG  296

Query  297  GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG  370

Query  371  AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG  444

Query  445  CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA  518

Query  519  CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC  592

Query  593  GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC  666

Query  667  CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  667  CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATGGGATGAG  740

Query  741  GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA  814

Query  815  GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT  888
            ||||||||||                                                               |
Sbjct  815  GGCCCTTCAG---------------------------------------------------------------T  825

Query  889  TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC  899

Query  963  TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC  1036
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Sbjct  900  TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC  973

Query 1037  CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG  1110
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Sbjct  974  CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG  1047

Query 1111  GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT  1184
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Sbjct 1048  GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT  1121

Query 1185  TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122  TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG  1195

Query 1259  GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196  GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG  1269

Query 1333  ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270  ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT  1343

Query 1407  GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344  GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC  1417

Query 1481  ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418  ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC  1491

Query 1555  AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA  1628
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Sbjct 1492  AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA  1565

Query 1629  TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566  TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT  1639

Query 1703  GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640  GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT  1713

Query 1777  GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT  1850
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Sbjct 1714  GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT  1787

Query 1851  CTGGCAG  1857
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Sbjct 1788  CTGGCAG  1794