Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09276
- Subject:
- XM_011545332.1
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1743
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG 74
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Sbjct 1 ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG 74
Query 75 GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC 148
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Sbjct 75 GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC 148
Query 149 TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG 222
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Sbjct 149 TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG 222
Query 223 GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG 296
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Sbjct 223 GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG 296
Query 297 GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 370
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Sbjct 297 GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 370
Query 371 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 444
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Sbjct 371 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 444
Query 445 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 518
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Sbjct 445 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 518
Query 519 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 592
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Sbjct 519 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 592
Query 593 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 666
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Sbjct 593 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 666
Query 667 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAG 740
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Sbjct 667 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGA------------------------------ 710
Query 741 GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA 814
Sbjct 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Query 815 GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 888
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Sbjct 711 ----------GTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 774
Query 889 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 962
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Sbjct 775 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 848
Query 963 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 1036
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Sbjct 849 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 922
Query 1037 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 1110
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Sbjct 923 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 996
Query 1111 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 1184
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Sbjct 997 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 1070
Query 1185 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 1258
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Sbjct 1071 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 1144
Query 1259 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1332
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Sbjct 1145 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1218
Query 1333 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1406
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Sbjct 1219 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1292
Query 1407 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1480
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Sbjct 1293 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1366
Query 1481 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1554
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Sbjct 1367 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1440
Query 1555 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1628
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Sbjct 1441 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1514
Query 1629 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1702
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Sbjct 1515 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1588
Query 1703 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT 1776
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Sbjct 1589 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT 1662
Query 1777 GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT 1850
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Sbjct 1663 GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT 1736
Query 1851 CTGGCAG 1857
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Sbjct 1737 CTGGCAG 1743