Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09276
- Subject:
- XM_011545334.1
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1538
- Gaps:
- 318
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 370
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Sbjct 1 ----------------------ATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 52
Query 371 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 444
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Sbjct 53 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 126
Query 445 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 518
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Sbjct 127 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 200
Query 519 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 592
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Sbjct 201 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 274
Query 593 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 666
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Sbjct 275 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 348
Query 667 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAG 740
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Sbjct 349 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATGGGATGAG 422
Query 741 GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA 814
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Sbjct 423 GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA 496
Query 815 GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 888
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Sbjct 497 GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 570
Query 889 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 962
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Sbjct 571 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 644
Query 963 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 1036
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Sbjct 645 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 718
Query 1037 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 1110
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Sbjct 719 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 792
Query 1111 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 1184
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Sbjct 793 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 866
Query 1185 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 1258
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Sbjct 867 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 940
Query 1259 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1332
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Sbjct 941 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1014
Query 1333 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1406
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Sbjct 1015 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1088
Query 1407 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1480
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Sbjct 1089 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1162
Query 1481 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1554
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Sbjct 1163 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1236
Query 1555 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1628
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Sbjct 1237 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1310
Query 1629 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1702
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Sbjct 1311 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1384
Query 1703 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT 1776
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Sbjct 1385 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT 1458
Query 1777 GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT 1850
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Sbjct 1459 GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT 1532
Query 1851 CTGGCAG 1857
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Sbjct 1533 CTGGCAG 1539