Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09276
• Subject: XR_950094.1
• Aligned Length: 2144
• Identities: 1750
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGC  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GGGCGGGAGGAACGCGCCGCTAGGCGGGAGAGCGCGGCCATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGC  74

Query   36  GCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCGGGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGG  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCGGGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGG  148

Query  110  TGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGCTGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCA  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGCTGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCA  222

Query  184  AACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAGGAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACT  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAGGAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACT  296

Query  258  GGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGGGCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGG  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGGGCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGG  370

Query  332  TGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGGAGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTG  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGGAGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTG  444

Query  406  GAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAGCAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAGCAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAA  518

Query  480  TGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCACGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCACGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCC  592

Query  554  AGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGCGCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGC  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGCGCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGC  666

Query  628  AACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAG  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAG  740

Query  702  CATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAGGGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGC  775
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATGGGATGAGGGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGC  814

Query  776  CAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGAGGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGAGGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACG  888

Query  850  CTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGATTTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGC  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGATTTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGC  962

Query  924  CCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGCTGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGCTGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGG  1036

Query  998  ATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGAC  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGAC  1110

Query 1072  CGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAG  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAG  1184

Query 1146  CATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGTTTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCT  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGTTTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCT  1258

Query 1220  GGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTGGACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAG  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTGGACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAG  1332

Query 1294  CTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTG  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1333  CTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATT-  1405

Query 1368  CTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGTGGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACA  1441
                                                                                      
Sbjct 1406  --------------------------------------------------------------------------  1405

Query 1442  ATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCCACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTC  1515
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  -------------------------------GGGGCCCCACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTC  1448

Query 1516  ACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTCAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGA  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  ACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTCAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGA  1522

Query 1590  CCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGATGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTG  1663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523  CCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGATGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTG  1596

Query 1664  TGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCTGTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACC  1737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597  TGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCTGTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACC  1670

Query 1738  GGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCTGCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAG  1811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671  GGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCTGCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAG  1744

Query 1812  CCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCTCTGGCAG----------------------------  1857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 1745  CCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCTCTGGCAGTAGGGCCACGACCTGCCTGCCTGGGCTG  1818

Query 1858  --------------------------------------------------------------------------  1857
                                                                                      
Sbjct 1819  GAGCTCTTGCCCGAAGCCTGAAGCTTCCTTCGGCGCCATGCAGGGGTTGGGGTTGGGACTGGAGCTGGCCTTGG  1892

Query 1858  --------------------------------------------------------------------------  1857
                                                                                      
Sbjct 1893  GATTTAATGGGGAAGAAGGCCTGGCAGGACCTGGCCTGTTTGTTTAAAAATGAAGTATGGGTTGGGGGATTACG  1966

Query 1858  ------------------------------------------------------------------------  1857
                                                                                    
Sbjct 1967  CTAGTTTTTCTTTGTATTTTTATCTCTATCTCCTCACTTTTTCTCCCAAAGTAGAAAAAAATGATATCTGAA  2038