Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09284
• Subject: NM_001331219.1
• Aligned Length: 1070
• Identities: 793
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDFFKADDPESTKRSAL  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQL  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  KPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRP  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTHLSTVTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDR  296
                 .||||||||||||.||||||||.|||.||.|||||||.|||||.||||.||||||||||||.||||.||
Sbjct    1  -----MLTAAFSLALRPVVAAQFSDNLMRPFIIHVMSVPALVAHLSTVAPERLGVLESHDMLRKFIVFLRDRDR  69

Query  297  CRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLTQTLCYCQKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|.||||.|||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct   70  CRDACESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSLRLLEEEMDGFVSALTQMLCYCQKYVAQKKSNLTHWHPVLGWFSQPV  143

Query  371  DYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFCDILSKKLLESQEPA--HAQPASPQNVLPVKSLLKRAFQKSASVRN  442
            |||||.||.||||||||||.||||||.|.||||.||||..|||  ..||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  144  DYGLNDSMYLITKQLQFLWAVPLIRILFSDILSRKLLEHAEPAPVQPQPSSPQTVLPVKSLLKRAFQKSASVRN  217

Query  443  ILRPVGGKRVDSAEVQKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN  516
            |||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  ILRPVGGRRVDSAEVRKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN  291

Query  517  NDTEESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL  590
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  NDTGESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL  365

Query  591  FQSVHGWLMVLYERDCRRRFTPEDHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE  664
            ||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||||.||.||||.||.||||.||||||||||.||.||
Sbjct  366  FQSVHGWLMVLYERDCRRRFAPEDHWLRRDLKPGVLFQELDKDRRRAQLVLQHIPHVVPHKNRVLLFRNMVIKE  439

Query  665  KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI  513

Query  739  IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVF  812
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQMLGHHHSVF  587

Query  813  YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDITDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHF  886
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct  588  YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDIADLGLTLSYDEDVMGQLVCHELVPGGKTIPVTDENKISYIHLMAHF  661

Query  887  RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL  735

Query  961  ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS  1034
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ASDFTPEERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS  809

Query 1035  TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS  843