Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09284
- Subject:
- XM_006530126.2
- Aligned Length:
- 3212
- Identities:
- 2640
- Gaps:
- 160
Alignment
Query 1 ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCGTCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGT 74
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 -----------------------------ATGGTTCATCGACAGAGCCCGGCAGGCACGAGAAGAGAGGCTGGT 45
Query 75 GCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTGTTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGC 148
|||||||||.||||||||..||||.||...|||||||||||..|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 46 GCAGAAGGAGCGGGAGCGCTCAGCGGTGACGATCCAGGCCCTAGTCCGCAGTTTCCTCTGCCGGAGGCGACTGC 119
Query 149 AGAGAGATATCAGGAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGATGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTT 222
|.|||||.|||
Sbjct 120 ACAGAGACATC--------------------------------------------------------------- 130
Query 223 TGTATTTTCAAGATTGCCAGGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAGAGATTTGAGAAGTT 296
|||||.|.||||||||
Sbjct 131 ----------------------------------------------------------AGAGACTGGAGAAGTT 146
Query 297 GTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAATGAGCCTAAGGTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTA 370
||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||...||.|
Sbjct 147 GTGTCGAAGCATCCTGAACAGCATGGATGCCGAGAATGAGCCAAAGGTGTGGTACGTGTCCCTGGCTCTCTCCA 220
Query 371 AGGACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGCTGTGATTTTCTCAAGCAGCTC 444
||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||.|||..|||||.||||||||||..||||...|||||||
Sbjct 221 AGGACCTCACGCTGCTGTGGATTAAGCAGATCAAGAGCATCCTGTGGCACTGCTGTGAGCTTCTGGGGCAGCTC 294
Query 445 AAGCCTGAAATCCTGCAGGACTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACACTTC 518
|||||.||.|||.|.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 295 AAGCCAGAGATCTTACAGGACTCCAGGCTCATCACGCTGTACCTCACCATGCTTGTGACCTTCACAGACACTTC 368
Query 519 AACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAGGTGAAAGTCTTCGACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATAATGG 592
|||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 369 AACATGGAAGATTCTCCGGGGAAAAGGTGAGAGCCTTCGGCCAGCCCTGAACCACATTTGCGCAAATATAATGG 442
Query 593 GACATCTCAACCAGCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAGATATTGTTAACCCGTGGCCTGGCAAGACCCCGTCCT 666
|.|||||||||||||.||||.||||.|||||..|||||.||.||.|.|||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 443 GCCATCTCAACCAGCGTGGACTTTACTCTGTATTGCAGGTACTGCTGACCCGAGGCCTGGCCAGGCCCCGGCCC 516
Query 667 TGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCTTTTTCTCTAGCGTTACGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCTCAGA 740
|||||.||||||||||..|||||||||||.||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 517 TGTCTGTCCAAAGGCATGTTAACAGCAGCCTTCTCTCTGGCCCTGCGCCCTGTGGTTGCTGCGCAGTTCTCAGA 590
Query 741 CAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTCTGGTGACTCATCTCAGCACAGTGACCC 814
||||||.||.||.||.|||.||||||||.|||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||.|||
Sbjct 591 CAATCTTATGCGACCATTCATCATCCACGTCATGTCGGTACCTGCTCTCGTGGCTCATCTCAGCACCGTGGCCC 664
Query 815 CTGAGCGCCTCACTGTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGACCAAGATCGA 888
|||||||||||...||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||...|||.|||
Sbjct 665 CTGAGCGCCTCGGCGTTTTAGAGTCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCGTCTTCCTGAGAGATAGAGACCGA 738
Query 889 TGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGCTTTGTCTAATGGGCAACCTCCTACACTTGGGCTC 962
|||||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 739 TGCCGCGATGCTTGTGAGAGTTTAGAAGGCTGCCATACCCTGTGTCTCATGGGCAATCTCCTGCACTTGGGCTC 812
Query 963 CCTCAGCCCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCAGACGCTGTGCTACTGTC 1036
||||||||.|||..||||||||||.||||..||||||||.|||||...||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 813 CCTCAGCCTCAGGCTGTTAGAGGAAGAGATGGATGGGTTTGTGAGCGCGCTCACGCAGATGCTGTGCTACTGTC 886
Query 1037 AGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATCTGTG 1110
|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct 887 AGAAGTACGTGGCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCACCCTGTGCTCGGCTGGTTTTCCCAACCTGTG 960
Query 1111 GATTATGGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTTCTTGTGGGGGGTGCCTCTGATCCG 1184
|||||.|||||.||.||.||.|||.||.||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 961 GATTACGGCCTCAATGATTCCATGTACCTGATCACCAAGCAGCTGCAGTTCCTGTGGGCGGTGCCTCTCATCCG 1034
Query 1185 GATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCAAGAAGCTACTGGAG-AGCCAGGAGCCAGCCCACG-------CACAGCC 1250
.||..|||||.|||||||||||||||.||||||.|||||| |..|| |||||.|||| || |.|||||
Sbjct 1035 CATTCTCTTCAGTGACATCCTGAGCAGGAAGCTGCTGGAGCATGCA-GAGCCGGCCC-CGGTGCAACCGCAGCC 1106
Query 1251 AGCATCCCCTCAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTCTCCTAAAGCGTGCTTTTCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGA 1324
..|.||.||.||||..||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1107 GTCCTCACCGCAGACGGTGCTCCCCGTGAAGAGCCTCCTCAAGCGTGCGTTTCAGAAGTCGGCTTCGGTTCGGA 1180
Query 1325 ATATTCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAACGGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTC 1398
|.||.|||||||||||.|||||....||.||||||||.||.||.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 1181 ACATCCTCAGGCCTGTTGGGGGCCGCCGTGTCGACTCCGCTGAGGTGCGGAAGGTCTGCAACATTTGCGTGCTC 1254
Query 1399 TACCAGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGGTCTCACTTACCTTGATGACCT 1472
|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1255 TACCAGACCTCGCTGACGACCCTCACCCAGATCCGCCTGCAGATCCTCACAGGTCTTACGTACCTGGATGACCT 1328
Query 1473 GCTTCCCAAACTGTGGGCATTTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGCCTGA 1546
|||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1329 GCTGCCCAAGCTCTGGGCGTTTATCTGTGAGCTGGGGCCCCACGGCGGGCTCAAGCTCTTCCTGGAGTGCCTGA 1402
Query 1547 ACAATGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCTGTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATC 1620
||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1403 ACAATGACACTGGAGAGTCCAAGCAGCTCCTGGCCATGCTGATGCTCTTCTGTGACTGTTCCCGGCACCTCATC 1476
Query 1621 ACAATCCTTGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTCACTATCTCCTC 1694
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1477 ACCATCCTCGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATCTCCTTCAAGCTGGAAGAGCTGGTCACCATCTCCTC 1550
Query 1695 TTTCCTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGGAATTGTAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC 1768
.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GTTCCTCAATTCCTTCGTGTTTAAGATGATCTGGGACGGAATTGTAGAGAATGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC 1624
Query 1769 TGTTCCAGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGGCGCTTCACCCCCGAGGAC 1842
||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|.||.||||||
Sbjct 1625 TGTTCCAGTCCGTCCATGGCTGGCTGATGGTGCTGTATGAGCGAGACTGCCGCCGGCGCTTTGCTCCGGAGGAC 1698
Query 1843 CACTGGCTGCGAAAGGATCTCAAACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGTT 1916
||||||||.||.|.|||.|||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||||.||||.|||...||||.|||.|
Sbjct 1699 CACTGGCTACGGAGGGACCTCAAGCCTGGTGTGCTCTTCCAGGAGCTCGACAAGGACCGAAGGAGGGCTCAGCT 1772
Query 1917 GATCCTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACAGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGG 1990
|.||||||||.|||||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|.||||||||.|||||
Sbjct 1773 GGTCCTGCAGCACATCCCCCACGTCGTGCCTCACAAGAACAGAGTTCTTCTGTTCCGGAACATGGTTATCAAGG 1846
Query 1991 AGAAGGAGAAACTGGGGCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCCGCCGGTCC 2064
||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||
Sbjct 1847 AGAAAGAGAAGCTGGGGCTTGTGGAGACCAGCTCTGCCTCTCCTCACGTCACCCACATCACCATCCGAAGGTCC 1920
Query 2065 AGGATGCTGGAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGGCAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAA 2138
.|||||.||||||||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1921 CGGATGTTGGAGGACGGCTACGAACAGCTCCGGCAGCTTTCCCAGCATGCCATGAAGGGTGTGATCCGAGTGAA 1994
Query 2139 GTTTGTCAATGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGGAGTTCTTGGAAGAGA 2212
|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||
Sbjct 1995 GTTTGTCAACGACCTCGGGGTGGACGAGGCTGGGATTGACCAGGATGGTGTCTTCAAGGAGTTTCTGGAAGAGA 2068
Query 2213 TCATCAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTGTTCAAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCA 2286
||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 2069 TCATCAAGAGGGTGTTTGACCCCGCACTCAACCTGTTCAAGACAACCAGCGGGGATGAGCGGCTGTACCCATCA 2142
Query 2287 CCCACATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGGAAGGCTGTGTA 2360
|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2143 CCCACGTCCTACATTCACGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGAAAGGCAGTGTA 2216
Query 2361 TGAGGGAATTGTGGTGGACGTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAGCGTCT 2434
||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TGAGGGGATCGTGGTAGATGTGCCCTTTGCCTCCTTCTTCCTGAGCCAGATGCTCGGGCACCACCACAGCGTCT 2290
Query 2435 TCTATAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAT 2508
||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2291 TCTACAGCTCCGTGGATGAGCTTCCCTCCCTGGACTCGGAGTTTTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAC 2364
Query 2509 GATGGGGACATCACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGCTTGTTTGCCATGA 2582
|||||.||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2365 GATGGAGACATCGCAGACCTCGGGCTGACGCTGTCTTACGATGAAGACGTCATGGGTCAGCTCGTCTGCCACGA 2438
Query 2583 ACTGATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTGTTACAAATGAAAATAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCACATT 2656
||||.||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2439 ACTGGTTCCCGGAGGGAAGACCATCCCGGTTACAGATGAGAACAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCGCATT 2512
Query 2657 TTCGAATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAGCGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAG 2730
|.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2513 TCCGAATGCACACTCAAATTAAAAACCAGACAGCTGCTCTTATCAGTGGCTTCCGTTCCATCATCAAGCCCGAG 2586
Query 2731 TGGATCCGAATGTTCTCAACTCCTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAAGA 2804
|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2587 TGGATCCGAATGTTCTCTACCCCTGAGCTTCAGCGCCTCATCTCCGGGGACAACGCTGAGATAGATCTGGAAGA 2660
Query 2805 TTTAAAGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGGAAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTC 2878
.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2661 CTTAAAGAAGCACACAGTGTACTACGGTGGCTTTCATGGGAGCCACAGGGTCATCATCTGGCTCTGGGATATCC 2734
Query 2879 TGGCCTCCGACTTCACACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGTTCGTGACCAGCTGCTCCAGACCCCCGCTC 2952
||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 2735 TGGCTTCCGACTTCACGCCTGAAGAAAGAGCCATGTTCCTGAAGTTTGTGACCAGCTGCTCCCGGCCCCCGCTC 2808
Query 2953 CTGGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTCCATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGACACCGGGGA 3026
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2809 CTAGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCGTTCTCCATCCGCTGTGTGGAAGTATCAGATGACCAGGACACTGGGGA 2882
Query 3027 CACTCTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAGCCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCT 3100
.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct 2883 TACCCTGGGCAGCGTCCTCAGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGAGGGAGCCAGGGGGGCGTCTGCCCACATCTT 2956
Query 3101 CCACCTGCTTCAACCTGCTCAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCC 3174
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 2957 CCACTTGCTTCAACCTGCTTAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTACTGCGAGAGAAACTACGCTATGCC 3030
Query 3175 ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC 3204
|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3031 ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAGCTCTCC 3060