Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09284
- Subject:
- XM_024449269.1
- Aligned Length:
- 3208
- Identities:
- 2614
- Gaps:
- 587
Alignment
Query 1 ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCGTCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTGTTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAGAGATATCAGGAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGATGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TGTATTTTCAAGATTGCCAGGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAGAGATTTGAGAAGTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAATGAGCCTAAGGTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGCTGTGATTTTCTCAAGCAGCTC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AAGCCTGAAATCCTGCAGGACTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACACTTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAGGTGAAAGTCTTC----GACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATA 588
..|||.|| ||||.|||.| ||.|| ||||| ||| |||
Sbjct 1 ----ATGAATAT----------AAAGTTGATA-TCATCCTCTGACCA------------ATT-----AAA---- 38
Query 589 ATGGGACATCTCAACCAGCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAGATATTGTTAACCCGTGGCCTGGCAAGACCCCG 662
|||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 -----ACAT-TC------------TTTT-----------CAGATATTGTTAACCCGTGGCCTGGCAAGACCCCG 83
Query 663 TCCTTGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCTTTTTCTCTAGCGTTACGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCT 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 TCCTTGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCTTTTTCTCTAGCGTTACGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCT 157
Query 737 CAGACAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTCTGGTGACTCATCTCAGCACAGTG 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CAGACAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTCTGGTGACTCATCTCAGCACAGTG 231
Query 811 ACCCCTGAGCGCCTCACTGTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGACCAAGA 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 ACCCCTGAGCGCCTCACTGTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGACCAAGA 305
Query 885 TCGATGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGCTTTGTCTAATGGGCAACCTCCTACACTTGG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 TCGATGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGCTTTGTCTAATGGGCAACCTCCTACACTTGG 379
Query 959 GCTCCCTCAGCCCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCAGACGCTGTGCTAC 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 GCTCCCTCAGCCCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCAGACGCTGTGCTAC 453
Query 1033 TGTCAGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATC 1106
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 TGTCGGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATC 527
Query 1107 TGTGGATTATGGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTTCTTGTGGGGGGTGCCTCTGA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 TGTGGATTATGGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTTCTTGTGGGGGGTGCCTCTGA 601
Query 1181 TCCGGATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCAAGAAGCTACTGGAGAGCCAGGAGCCAGCCCACGCACAGCCAGCA 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 TCCGGATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCAAGAAGCTACTGGAGAGCCAGGAGCCAGCCCACGCACAGCCAGCA 675
Query 1255 TCCCCTCAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTCTCCTAAAGCGTGCTTTTCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGAATAT 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 TCCCCTCAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTCTCCTAAAGCGTGCTTTTCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGAATAT 749
Query 1329 TCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAACGGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTCTACC 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 TCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAACGGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTCTACC 823
Query 1403 AGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGGTCTCACTTACCTTGATGACCTGCTT 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 AGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGGTCTCACTTACCTTGATGACCTGCTT 897
Query 1477 CCCAAACTGTGGGCATTTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGCCTGAACAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CCCAAACTGTGGGCATTTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGCCTGAACAA 971
Query 1551 TGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCTGTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATCACAA 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 TGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCTGTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATCACAA 1045
Query 1625 TCCTTGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTCACTATCTCCTCTTTC 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 TCCTTGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTCACTATCTCCTCTTTC 1119
Query 1699 CTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGGAATTGTAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGCTGTT 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 CTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGGAATTGTAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGCTGTT 1193
Query 1773 CCAGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGGCGCTTCACCCCCGAGGACCACT 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 CCAGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGGCGCTTCACCCCCGAGGACCACT 1267
Query 1847 GGCTGCGAAAGGATCTCAAACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGTTGATC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 GGCTGCGAAAGGATCTCAAACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGTTGATC 1341
Query 1921 CTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACAGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGGAGAA 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1342 CTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACAGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGGAGAA 1415
Query 1995 GGAGAAACTGGGGCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCCGCCGGTCCAGGA 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416 GGAGAAACTGGGGCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCCGCCGGTCCAGGA 1489
Query 2069 TGCTGGAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGGCAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAAGTTT 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 TGCTGGAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGGCAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAAGTTT 1563
Query 2143 GTCAATGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGGAGTTCTTGGAAGAGATCAT 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564 GTCAATGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGGAGTTCTTGGAAGAGATCAT 1637
Query 2217 CAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTGTTCAAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCACCCA 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 CAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTGTTCAAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCACCCA 1711
Query 2291 CATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGGAAGGCTGTGTATGAG 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 CATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGGAAGGCTGTGTATGAG 1785
Query 2365 GGAATTGTGGTGGACGTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAGCGTCTTCTA 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786 GGAATTGTGGTGGACGTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAGCGTCTTCTA 1859
Query 2439 TAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTATGATG 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTATGATG 1933
Query 2513 GGGACATCACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGCTTGTTTGCCATGAACTG 2586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 GGGACATCACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGCTTGTTTGCCATGAACTG 2007
Query 2587 ATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTGTTACAAATGAAAATAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCACATTTTCG 2660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2008 ATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTGTTACAAATGAAAATAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCACATTTTCG 2081
Query 2661 AATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAGCGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAGTGGA 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 AATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAGCGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAGTGGA 2155
Query 2735 TCCGAATGTTCTCAACTCCTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAAGATTTA 2808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 TCCGAATGTTCTCAACTCCTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAAGATTTA 2229
Query 2809 AAGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGGAAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTCTGGC 2882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2230 AAGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGGAAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTCTGGC 2303
Query 2883 CTCCGACTTCACACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGTTCGTGACCAGCTGCTCCAGACCCCCGCTCCTGG 2956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 CTCCGACTTCACACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGTTCGTGACCAGCTGCTCCAGACCCCCGCTCCTGG 2377
Query 2957 GATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTCCATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGACACCGGGGACACT 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2378 GATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTCCATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGACACCGGGGACACT 2451
Query 3031 CTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAGCCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCTCCAC 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 CTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAGCCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCTCCAC 2525
Query 3105 CTGCTTCAACCTGCTCAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCCATCA 3178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 CTGCTTCAACCTGCTCAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCCATCA 2599
Query 3179 GCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC 3204
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 GCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC 2625