Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09288
- Subject:
- NM_001077188.2
- Aligned Length:
- 1935
- Identities:
- 1814
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGGCACTTCCTGCGTGTGCAGTCCGGGAGTTCGAGCCGCCGCGGCAACCGGAGCGAGGAGCGCCCGTCCGCAC 74
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Sbjct 1 ATGGCACTGCCTGCGTGTGCAGTCCGGGAGTTCGAGCCGCCGCGGCAACCGGAGCGAGGAGCGCCCGTCCGCAC 74
Query 75 CACCTGTCCCCGCCGGCATTCCAGAGTAGAGGCCGAATTGGCAGCGAGCCGGCCCGGGTCGGTCGCCGCCTCAG 148
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Sbjct 75 CACCTGTCCCCGCCGGCATTCCAGAGTAGAGGCCGAATTGGCAGCGAGCCGGCCCGGGTCGGTCGCCGCCTCAG 148
Query 149 TTCGCGCGGGCCCTCCTAGGGGTGTGTCTCACGGATTCCACACCCGGCCGCTCCTGGACAAGCCCCGAAAGGCG 222
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Sbjct 149 TTCGCGCGGGCCCTCCTAGGGGTGTGTCTCACGGATTCCACACCCGGCCGCTCCTGGACAAGCCCCGAAAGGCG 222
Query 223 TCTTCTTCCCTGGCGGGAGCCGCGTGCGCCCCGCTTTTCGCGCTGCTGTCCCGGGGCCGCCGCAGGCGGATGCA 296
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Sbjct 223 TCTTCTTCCCTGGCGGGAGCCGCGTGCGCCCCGCTTTTCGCGCTGCTGTCCCGGGGCCGCCGCAGGCGGATGCA 296
Query 297 CGTCCTCAGGCGACGCTGGGACCTGGGCTCCCTCTGCCGGGCCCTGCTCACTCGGGGCCTGGCCGCCCTGGGCC 370
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Sbjct 297 CGTCCTCAGGCGACGCTGGGACCTGGGCTCCCTCTGCCGGGCCCTGCTCACTCGGGGCCTGGCCGCCCTGGGCC 370
Query 371 ACTCGCTGAAGCACGTGCTCGGTGCGATCTTCTCCAAGATTTTCGGCCCCATGGCCAGCGTCGGGAACATGGAT 444
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Sbjct 371 ACTCGCTGAAGCACGTGCTCGGTGCGATCTTCTCCAAGATTTTCGGCCCCATGGCCAGCGTCGGGAACATGGAT 444
Query 445 GAGAAATCCAACAAGCTGCTGCTAGCTTTGGTGATGCTCTTCCTATTTGCCGTGATCGTCCTCCAATACGTGTG 518
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Sbjct 445 GAGAAATCCAACAAGCTGCTGCTAGCTTTGGTGATGCTCTTCCTATTTGCCGTGATCGTCCTCCAATACGTGTG 518
Query 519 CCCCGGCACAGAATGCCAGCTCCTCCGCCTGCAGGCGTTCAGCTCCCCGGTGCCGGACCCGTACCGCTCGGAGG 592
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Sbjct 519 CCCCGGCACAGAATGCCAGCTCCTCCGCCTGCAGGCGTTCAGCTCCCCGGTGCCGGACCCGTACCGCTCGGAGG 592
Query 593 ATGAGAGCTCCGCCAGGTTCGTGCCCCGCTACAATTTCACCCGCGGCGACCTCCTGCGCAAGGTAGACTTCGAC 666
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Sbjct 593 ATGAGAGCTCCGCCAGGTTCGTGCCCCGCTACAATTTCACCCGCGGCGACCTCCTGCGCAAGGTAGACTTCGAC 666
Query 667 ATCAAGGGCGATGACCTGATCGTGTTCCTGCACATCCAGAAGACCGGGGGCACCACTTTCGGCCGCCACTTGGT 740
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Sbjct 667 ATCAAGGGCGATGACCTGATCGTGTTCCTGCACATCCAGAAGACCGGGGGCACCACTTTCGGCCGCCACTTGGT 740
Query 741 GCGTAACATCCAGCTGGAGCAGCCGTGCGAGTGCCGCGTGGGTCAGAAGAAATGCACTTGCCACCGGCCGGGTA 814
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Sbjct 741 GCGTAACATCCAGCTGGAGCAGCCGTGCGAGTGCCGCGTGGGTCAGAAGAAATGCACTTGCCACCGGCCGGGTA 814
Query 815 AGCGGGAAACCTGGCTCTTCTCCAGGTTCTCCACGGGCTGGAGCTGCGGGTTGCACGCCGACTGGACCGAGCTC 888
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Sbjct 815 AGCGGGAAACCTGGCTCTTCTCCAGGTTCTCCACGGGCTGGAGCTGCGGGTTGCACGCCGACTGGACCGAGCTC 888
Query 889 ACCAGCTGTGTGCCCTCCGTGGTGGACGGCAAGCGCGACGCCAGGCTGAGACCGTCCAG--------------- 947
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Sbjct 889 ACCAGCTGTGTGCCCTCCGTGGTGGACGGCAAGCGCGACGCCAGGCTGAGACCGTCCAGGTGGAGGATTTTTCA 962
Query 948 -------------------------------------------------------------------------- 947
Sbjct 963 GATTCTAGATGCAGCAAGTAAGGATAAACGGGGTTCTCCAAACACTAACGCAGGCGCCAACTCTCCGTCATCCA 1036
Query 948 -------------------------------GAACTTCCACTACATCACCATCCTCCGAGACCCAGTGTCCCGG 990
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Sbjct 1037 CAAAGACCCGGAACACATCTAAGAGTGGGAAGAACTTCCACTACATCACCATCCTCCGAGACCCAGTGTCCCGG 1110
Query 991 TACTTGAGTGAGTGGAGGCATGTCCAGAGAGGGGCAACATGGAAAGCATCCCTGCATGTCTGCGATGGAAGGCC 1064
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Sbjct 1111 TACTTGAGTGAGTGGAGGCATGTCCAGAGAGGGGCAACATGGAAAGCATCCCTGCATGTCTGCGATGGAAGGCC 1184
Query 1065 TCCAACCTCCGAAGAGCTGCCCAGCTGCTACACTGGCGATGACTGGTCTGGCTGCCCCCTCAAAGAGTTTATGG 1138
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Sbjct 1185 TCCAACCTCCGAAGAGCTGCCCAGCTGCTACACTGGCGATGACTGGTCTGGCTGCCCCCTCAAAGAGTTTATGG 1258
Query 1139 ACTGTCCCTACAATCTAGCCAACAACCGCCAGGTGCGCATGCTCTCCGACCTGACCCTGGTAGGCTGCTACAAC 1212
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Sbjct 1259 ACTGTCCCTACAATCTAGCCAACAACCGCCAGGTGCGCATGCTCTCCGACCTGACCCTGGTAGGCTGCTACAAC 1332
Query 1213 CTCTCTGTCATGCCTGAAAAGCAAAGAAACAAGGTCCTTCTGGAAAGTGCCAAGTCAAATCTGAAGCACATGGC 1286
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Sbjct 1333 CTCTCTGTCATGCCTGAAAAGCAAAGAAACAAGGTCCTTCTGGAAAGTGCCAAGTCAAATCTGAAGCACATGGC 1406
Query 1287 GTTCTTCGGCCTCACTGAGTTTCAGCGGAAGACCCAATATCTGTTTGAGAAAACCTTCAACATGAACTTTATTT 1360
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Sbjct 1407 GTTCTTCGGCCTCACTGAGTTTCAGCGGAAGACCCAATATCTGTTTGAGAAAACCTTCAACATGAACTTTATTT 1480
Query 1361 CGCCATTTACCCAGTATAATACCACTAGGGCCTCTAGTGTAGAGATCAATGAGGAAATTCAAAAGCGTATTGAG 1434
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Sbjct 1481 CGCCATTTACCCAGTATAATACCACTAGGGCCTCTAGTGTAGAGATCAATGAGGAAATTCAAAAGCGTATTGAG 1554
Query 1435 GGACTGAATTTTCTGGATATGGAGTTGTACAGCTATGCCAAAGACCTTTTTTTGCAGAGGTATCAGTTTATGAG 1508
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Sbjct 1555 GGACTGAATTTTCTGGATATGGAGTTGTACAGCTATGCCAAAGACCTTTTTTTGCAGAGGTATCAGTTTATGAG 1628
Query 1509 GCAGAAAGAGCATCAGGAGGCCAGGCGAAAGCGTCAGGAACAACGCAAATTTCTGAAGGGAAGGCTCCTTCAGA 1582
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Sbjct 1629 GCAGAAAGAGCATCAGGAGGCCAGGCGAAAGCGTCAGGAACAACGCAAATTTCTGAAGGGAAGGCTCCTTCAGA 1702
Query 1583 CCCATTTCCAGAGCCAGGGTCAGGGCCAGAGCCAGAATCCGAATCAGAATCAGAGTCAGAACCCAAATCCGAAT 1656
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Sbjct 1703 CCCATTTCCAGAGCCAGGGTCAGGGCCAGAGCCAGAATCCGAATCAGAATCAGAGTCAGAACCCAAATCCGAAT 1776
Query 1657 GCCAATCAGAACCTGACTCAGAATCTGATGCAGAATCTGACTCAGAGTTTGAGCCAGAAGGAGAACCGGGAAAG 1730
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Sbjct 1777 GCCAATCAGAACCTGACTCAGAATCTGATGCAGAATCTGACTCAGAGTTTGAGCCAGAAGGAGAACCGGGAAAG 1850
Query 1731 CCCGAAGCAGAACTCAGGCAAGGAGCAGAATGATAACACCAGCAATGGCACCAACGACTACATAGGCAGTGTAG 1804
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Sbjct 1851 CCCGAAGCAGAACTCAGGCAAGGAGCAGAATGATAACACCAGCAATGGCACCAACGACTACATAGGCAGTGTAG 1924
Query 1805 AGAAATGGCGT 1815
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Sbjct 1925 AGAAATGGCGT 1935