Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09315
• Subject: XM_017016884.2
• Aligned Length: 1829
• Identities: 1464
• Gaps: 361

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAACCGGCTAGGAAGGAGGGATTCCGCCGCACGGCTGCGGCGTCCGCGGGACAGAGACGCCTAACCGGAAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCTAGCAGGAACGCCGGACGCCGCTGGGACGTGTCCGGAAGCGCGGCGGAACGGCGGACTACATTTCCCATAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCCCGCGGGGCAGGGCGAGGGGCGGGCGTCGGGGACATTACCGGACAGGCCTTGTCCGGCAATACCAAGGCTCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGGGAAAGCTGGTGCTGCTGCTGCCTGATTCCCGCCGACAGACCTTGGGACCGGGGCCAACACTGGCAGCTGGA  296

Query    1  -ATGGCAGACACGAGATCCGTGCACGAGACTAGGTTTGAGGCGGCCGTGAAGGTGATCCAGAGTTTGCCGAAGA  73
             |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGGCGGACACGAGATCCGTGCACGAGACTAGGTTTGAGGCGGCCGTGAAGGTGATCCAGAGTTTGCCGAAGA  370

Query   74  ATGGTTCATTCCAGCCAACAAATGAAATGATGCTTAAATTTTATAGCTTCTATAAGCAGGCAACTGAAGGACCC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGTTCATTCCAGCCAACAAATGAAATGATGCTTAAATTTTATAGCTTCTATAAGCAGGCAACTGAAGGACCC  444

Query  148  TGTAAACTTTCAAGGCCTGGATTTTGGGATCCTATTGGAAGATATAAATGGGATGCTTGGAGTTCACTGGGTGA  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTAAACTTTCAAGGCCTGGATTTTGGGATCCTATTGGAAGATATAAATGGGATGCTTGGAGTTCACTGGGTGA  518

Query  222  TATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGAAAAAGATTATTGAAACTATGCCAATGACTG  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGAAAAAGATTATTGAAACTATGCCAATGACTG  592

Query  296  AGAAAGTTGAAGAATTGCTGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAAATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGCAGGAGT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAAGTTGAAGAATTGCTGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAAATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGCAGGAGT  666

Query  370  TCTGATATAACCTC---------------------------------AGATCTTGGTAATGTTCTCACTTCTAC  410
            ||||||||||||||                                 |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGATATAACCTCAGTCCGACTGGAGAAAATCTCTAAATGTTTAGAAGATCTTGGTAATGTTCTCACTTCTAC  740

Query  411  TCCGAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACAGTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCC  484
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACAGTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCC  814

Query  485  AAGAAGAAGTGAAAGGAGCAGAACAAAGTGATAATGATAAGAAAATGATGAAGAAGTCAGCAGACCATAAGAAT  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAAGAAGTGAAAGGAGCAGAACAAAGTGATAATGATAAGAAAATGATGAAGAAGTCAGCAGACCATAAGAAT  888

Query  559  TTGGAAGTCATTGTCACTAATGGCTATGATAAAGATGGCTTTGTTCAGGATATACAGAATGACATTCATGCCAG  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGAAGTCATTGTCACTAATGGCTATGATAAAGATGGCTTTGTTCAGGATATACAGAATGACATTCATGCCAG  962

Query  633  TTCTTCCCTGAATGGCAGAAGCACTGAAGAAGTAAAGCCCATTGATGAAAACTTGGGGCAAACTGGAAAATCTG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCTTCCCTGAATGGCAGAAGCACTGAAGAAGTAAAGCCCATTGATGAAAACTTGGGGCAAACTGGAAAATCTG  1036

Query  707  CTGTTTGCATTCACCAAGATATAAATGATGATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTTTGCATTCACCAAGATATAAATGATGATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGAT  1110

Query  781  TCAGACAGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAGTCTTTAGACAGCTTTACGTCCAA  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGACAGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAGTCTTTAGACAGCTTTACGTCCAA  1184

Query  855  CAATGGACCATTTCAGTATTACTTGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGATA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAATGGACCATTTCAGTATTACTTGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGATA  1258

Query  929  TTCAAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGCAGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAG  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGCAGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAG  1332

Query 1003  CATGGAGGAGAAGATGGCAGGAATAACAGCGGAGCACCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGACGAATT  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGGAGGAGAAGATGGCAGGAATAACAGCGGAGCACCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGACGAATT  1406

Query 1077  CTCTAATGTTAGAAGAGGAAGAGGACATAGGATGCAACACTTGAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAA  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCTAATGTTAGAAGAGGAAGAGGACATAGGATGCAACACTTGAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAA  1480

Query 1151  GTGGAGGTGATGGGGAGCGCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCCCTCGTG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGGAGGTGATGGGGAGCGCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCCCTCGTG  1554

Query 1225  CTGATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACTGCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCA  1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACTGCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCA  1628

Query 1299  GGCAAAATCATCAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAGAGACCATCTTGGTGGCCCTTCG  1372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCAAAATCATCAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAGAGACCATCTTGGTGGCCCTTCG  1702

Query 1373  AGATGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGCCATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTAT  1446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGCCATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTAT  1776

Query 1447  CAAAGAAGGAGAAG----------AAAACTGAAC-------------------  1470
            ||||||||||||||          |||  ||..|                   
Sbjct 1777  CAAAGAAGGAGAAGGTTTCTGCTCAAA--TGCCCCTCTTCACAGAGGTCCTCC  1827