Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09315
• Subject: XM_017016898.2
• Aligned Length: 1604
• Identities: 1260
• Gaps: 340

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTCTTCCTCTCGTTTCATGCAGGCTCTTGGGAAAGCTGGTGCTGCTGCTGCCTGATTCCCGCCGACAGACC  74

Query    1  -------------------------------ATGGCAGACACGAGATCCGTGCACGAGACTAGGTTTGAGGCGG  43
                                           |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGGGACCGGGGCCAACACTGGCAGCTGGAGATGGCGGACACGAGATCCGTGCACGAGACTAGGTTTGAGGCGG  148

Query   44  CCGTGAAGGTGATCCAGAGTTTGCCGAAGAATGGTTCATTCCAGCCAACAAATGAAATGATGCTTAAATTTTAT  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGAAGGTGATCCAGAGTTTGCCGAAGAATGGTTCATTCCAGCCAACAAATGAAATGATGCTTAAATTTTAT  222

Query  118  AGCTTCTATAAGCAGGCAACTGAAGGACCCTGTAAACTTTCAAGGCCTGGATTTTGGGATCCTATTGGAAGATA  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTTCTATAAGCAGGCAACTGAAGGACCCTGTAAACTTTCAAGGCCTGGATTTTGGGATCCTATTGGAAGATA  296

Query  192  TAAATGGGATGCTTGGAGTTCACTGGGTGATATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGA  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAATGGGATGCTTGGAGTTCACTGGGTGATATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGA  370

Query  266  AAAAGATTATTGAAACTATGCCAATGACTGAGAAAGTTGAAGAATTGCTGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAA  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAGATTATTGAAACTATGCCAATGACTGAGAAAGTTGAAGAATTGCTGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAA  444

Query  340  ATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGCAGGAGTTCTGATATAACCTCAGATCTTGGTAATGTTCTCACTTCTACTCC  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGCAGGAGTTCTGATATAACCTCAGATCTTGGTAATGTTCTCACTTCTACTCC  518

Query  414  GAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACAGTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCCAAG  487
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACAGTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCCAAG  592

Query  488  AAGAAGTGAAAGGAGCAGAACAAAGTGATAATGATAAGAAAATGATGAAGAAGTCAGCAGACCATAAGAATTTG  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  593  AAGAAGTGAAAGGAGCAGAACAAAGTGATAAT------------------------------------------  624

Query  562  GAAGTCATTGTCACTAATGGCTATGATAAAGATGGCTTTGTTCAGGATATACAGAATGACATTCATGCCAGTTC  635
                                                                                      
Sbjct  625  --------------------------------------------------------------------------  624

Query  636  TTCCCTGAATGGCAGAAGCACTGAAGAAGTAAAGCCCATTGATGAAAACTTGGGGCAAACTGGAAAATCTGCTG  709
                                                                                      
Sbjct  625  --------------------------------------------------------------------------  624

Query  710  TTTGCATTCACCAAGATATAAATGATGATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGATTCA  783
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  --------------GATATAAATGATGATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGATTCA  684

Query  784  GACAGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAGTCTTTAGACAGCTTTACGTCCAACAA  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  GACAGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAGTCTTTAGACAGCTTTACGTCCAACAA  758

Query  858  TGGACCATTTCAGTATTACTTGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGATATTC  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  759  TGGACCATTTCAGTATTACTTGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGATATTC  832

Query  932  AAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGCAGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAGCAT  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833  AAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGCAGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAGCAT  906

Query 1006  GGAGGAGAAGATGGCAGGAATAACAGCGGAGCACCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGACGAATTCTC  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907  GGAGGAGAAGATGGCAGGAATAACAGCGGAGCACCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGACGAATTCTC  980

Query 1080  TAATGTTAGAAGAGGAAGAGGACATAGGATGCAACACTTGAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAAGTG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  981  TAATGTTAGAAGAGGAAGAGGACATAGGATGCAACACTTGAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAAGTG  1054

Query 1154  GAGGTGATGGGGAGCGCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCCCTCGTGCTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055  GAGGTGATGGGGAGCGCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCCCTCGTGCTG  1128

Query 1228  ATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACTGCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCAGGC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129  ATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACTGCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCAGGC  1202

Query 1302  AAAATCATCAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAGAGACCATCTTGGTGGCCCTTCGAGA  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203  AAAATCATCAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAGAGACCATCTTGGTGGCCCTTCGAGA  1276

Query 1376  TGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGCCATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTATCAA  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277  TGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGCCATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTATCAA  1350

Query 1450  AGAAGGAGAAG----------AAAACTGAAC-------------------  1470
            |||||||||||          |||  ||..|                   
Sbjct 1351  AGAAGGAGAAGGTTTCTGCTCAAA--TGCCCCTCTTCACAGAGGTCCTCC  1398